Výroční zpráva
za rok 2013
Výroční zpráva
za rok 2013
Vídeňská 1083, 142 20 Praha 4 - Krč
Tel.: +420 261 062 230
E-mail: [email protected]
www.iem.cas.cz
www.uem.cas.cz
3
4
Obsah
6
Slovo úvodem
8
Ústav
9
Vedení ústavu a kontaktní informace
10
Orgány ústavu
11
Organizační schéma ústavu
12
Výzkumná centra
15
Oddělení a významné výsledky výzkumu
15
Oddělení neurověd
15
Laboratoř tkáňových kultur a kmenových buněk
18
Laboratoř difúzních studií a zobrazovacích metod
20
Laboratoř biomateriálů a biofyzikálních metod
21
Laboratoř histochemie a farmakologie oka
24
Oddělení neurofyziologie sluchu
24
Laboratoř fyziologie a patofyziologie sluchu
28
Laboratoř synaptické fyziologie
29
Oddělení buněčné neurofyziologie
32
Oddělení molekulární neurofyziologie
34
Oddělení farmakologie
36
Oddělení genetické ekotoxikologie
36
Laboratoř molekulární epidemiologie
37
Laboratoř genetické toxikologie
38
Laboratoř genomiky
40
Oddělení teratologie
40
Laboratoř embryogeneze
40
Laboratoř odontogeneze
43
Oddělení molekulární biologie nádorů
46
Oddělení mikroskopie
48
Oddělení transplantační imunologie
51
Oddělení tkáňového inženýrství
54
Oddělení technologického transferu
55
Výzkumné centrum buněčné terapie a tkáňových náhrad
57
Inovační biomedicínské centrum
60Ocenění
61
Národní výzkumné projekty
69
Impaktované publikace za rok 2013
79
Věda pro praxi a život
80
Udělené patenty
82
Pedagogická činnost
85
Mezinárodní spolupráce a projekty
5
Slovo úvodem
Věda je jedním z hlavních pilířů, na nichž stojí vyspělé společnosti. To znamená, že je třeba věnovat náležitou
pozornost především vědeckému bádání samotnému. V poslední době se ale musíme věnovat i otázkám řízení
a financování vědy, které v České republice nejsou uspokojivě vyřešeny. Podfinancování a nedostatek strategického
řízení zůstávají tak politováníhodnými konstantami vědy a výzkumu v ČR. To mimo jiné přispívá k tomu, že se
zvyšuje tlak na výzkumné instituce, které jsou nuceny věnovat čím dále tím větší část své kapacity na získávání
účelových prostředků.
Přesto vědci našeho ústavu dosáhli významných výsledků, připomeňme nejdůležitější z nich:
V ústavu pracují v dlouhodobém horizontu (do roku 2018) tři Centra excellence GA ČR: Centrum studií toxických
vlastností nanočástic (spoluřešitel Ing. Jan Topinka, DrSc.), Projekt excelence v oblasti neurověd (spoluřešitel
prof. MUDr. Josef Syka, DrSc.) a od roku 2014 Centrum orofaciálního vývoje a regenerace (řešitel MUDr. Renta
Peterková, CSc.). Vědci také pracují v Centru kompetence TA ČR s názvem Centrum vývoje originálních léčiv
(spoluřešitel RNDr. Zdeněk Zídek, DrSc.).
Ve Výzkumném centru buněčné terapie a tkáňových náhrad, vybudovaném z Operačního programu Praha
Konkurenceschopnost (OPPK) pracují skupiny prof. RNDr. Vladimíra Holáně, DrSc., PharmDr. Šárky Kubinové, Ph.D.
a prof. RNDr. Evžena Amlera, CSc.
Pokračovali jsme úspěšně v plnění cílů projektů získaných ze Strukturálních evropských fondů (projekty OPVK
Lidské zdroje pro neurovědní výzkum v Královéhradeckém a Ústeckém kraji a Příprava výzkumných týmů ÚEM AV
ČR pro projekt BIOCEV, projekt OPPA Rozvoj podnikatelského prostředí v oboru klinických hodnocení LPMT), dále
pokračuje naše účast v projektu OP VaVpI BIOCEV (vybudování nového vědeckého centra ve Vestci u Prahy).
V těsném závěru roku 2013 byl schválen projekt OPPK Pokročilé zobrazování živých tkání za 16,9 mil. Kč, jehož
cílem je pořízení zobrazovacího zařízení – Konfokálního mikroskopu s možností bezprostředního pozorování
ve vodném médiu a rychlého Monochromátoru pro multifrekvenční excitaci fluorescence. Stejně byl schválen
i druhý projekt OPPK Výzkumné centrum genomiky a proteomiky za 14,2 mil. Kč, jehož cílem je pořízení tří modulů
technologií na sekvenování a čipovou analýzu, proteinovou analýzu a analýzu funkčních vlastností buněk pro
sledování a hodnocení vlivu znečištění ovzduší na změny a kvalitu lidské genetické informace. Oba projekty
významně přispějí k investičnímu vybavení našeho ústavu a ke zvýšení kvality probíhajícího výzkumu.
6
V rámci program Akcelerace – program podpory podnikání na území hlavního města Prahy byly vydány
tři Inovační vouchery. Tři firmy, umístěné v Inovačním biomedicínském centru ÚEM, EponaCell, Biotechinvest
a ArtiCell již uzavřely smlouvu o udělení inovačního voucheru. Jedná se o smluvní výzkum pro ústav v objemu 787
tis. Kč, z toho dotace bude činit 570 tis.Kč.
Z dalších úspěchů roku 2013 bych ráda uvedla, že pracovníci ústavu zorganizovali několik úspěšných konferencí
a mezinárodních škol. Mezi nejvýznamnější patřil Regionální kongres FENS, který se konal 11.–14. září 2013 v Praze.
Kongresu se zúčastnilo více než 600 účastníků ze zahraničí, proběhlo na něm 7 plenárních přednášek a 18 symposií.
V jeho rámci jsme uspořádali tři mezinárodní letní školy, kdy v třídenním kurzu vyškolili naši pracovníci celkem 36
studentů. V červnu se v metodikách výzkumu sluchové funkce školilo v průběhu dvou dnů 30 studentů z University
of Connecticut v USA. Kongres byl mimořádně pozitivně hodnocen výborem FENS.
V neposlední řadě se rozvíjí Inovační biomedicínské centrum a firmy v něm, především Bioinova, Eponacell
a Cellmagel. Firma Bioinova, z 51% vlastněná ústavem, si v roce 2013 vedla velmi dobře. Získala povolení SÚKL
vyrábět kmenové buňky pro klinické studie, několik jich již probíhá ve spolupráci s 2. lékařskou fakultou UK a IKEM –
jmenovitě pro léčbu amyotrofické laterální sklerózy, léčbu onemocnění šlach, chrupavek, kostí a léčbu diabetické nohy.
Hlavními výsledky ústavu zůstávají publikace a patenty. Pracovníci ústavu v roce 2013 publikovali celkem 94 práce
se souhrnným impact faktorem 3,3 a vědcům byl udělen jeden patent a jeden 1 užitný vzor.
Eva Syková
ředitelka ústavu
7
Ústav
Ústav experimentální medicíny Akademie
věd ČR, v. v. i. se zabývá vybranými problémy
biomedicíny se zaměřením na aplikaci v klinické medicíně. V oblasti základního neurovědního výzkumu jsou studovány iontové změny
a difúzní parametry v CNS v průběhu fyziologických a patologických stavů; nesynaptický
přenos v CNS, receptory a iontové kanály, funkce gliových buněk, úloha glutamátergních receptorů a vápníkových iontů v průběhu komunikace mezi neurony a gliovými buňkami, morfologické a funkční charakteristiky nervových
buněk sluchového systému a jejich poškození
patologickými procesy.
V oblasti buněčné terapie a tkáňových náhrad probíhá výzkum v oblasti embryonálních
kmenových buněk, regulace buněčného cyklu
v průběhu gametogeneze a diferenciace, řízené diferenciace a implantace neurálních a embryonálních kmenových buněk, tvorby tkáňových náhrad na bázi
hydrogelů, autologních chondrocytů a biodegradabilních matric z netkaných nanovláken.
V oblasti buněčné biologie se výzkum zabývá strukturně-funkční organizací buněčného jádra, dále pak studiem
problematiky molekulárních mechanismů rozvoje rakoviny a podstatou vnímavosti vůči nádorovým onemocněním. Součástí výzkumu je vyhledávání časných ukazatelů, indikujících možnost maligní transformace a napomáhající časné diagnostice. Nově se rozvíjí problematika molekulárních mechanismů rozvoje rakoviny a podstata
vnímavosti vůči nádorovým onemocněním.
Mezi další oblasti výzkumu patří genotoxické a embryotoxické účinky xenobiotik, mechanismy vzniku vrozených
vad, vznik a průběh toxických reakcí na buněčné a tkáňové úrovni, histochemie a farmakologie oka, biochemie
enzymů jako markerů metabolických
procesů a sledování účinků farmak
na imunitní reakce v průběhu infekčních onemocnění.
V oblasti biotechnologických inovací
je činnost ústavu zaměřena na technologický transfer a podporu spolupráce
mezi ÚEM AV ČR a podnikatelskou
sférou v oboru regenerativní medicíny
prostřednictvím vzdělávání a společné
výzkumné a vývojové činnosti.
Ústav je Centrem Excellence EU s názvem MEDIPRA, spoluřešitelem center
excellence GA ČR: Projekt excelence
v oblasti neurověd, Centrum studií toxických vlastností nanočástic
a od roku 2014 Centrum orofaciálního vývoje a regenerace spoluřešitelem centra kompetence TA ČR
Centrum vývoje originálních léčiv.
8
Vedení ústavu
Ředitelka:
prof. MUDr. Eva Syková
DrSc., FCMA
Zástupce ředitelky:
doc. RNDr. Alexandr Chvátal
DrSc., MBA
Předsedkyně Rady instituce:
prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
Předsedkyně Dozorčí rady:
RNDr. Hana Sychrová, DrSc.
Adresa a kontakt:
Ústav experimentální medicíny Akademie věd ČR, v. v. i.
Vídeňská 1083, 142 20 Praha 4-Krč, Česká republika
Tel.: +420 241 062 230 Fax: +420 241 062 782
E-mail: [email protected]
Sekretariát ředitelky ústavu:
Tel.: +420 241 062 230, Fax: +420 241 062 782
Renata Pesrová
E-mail: [email protected]
Jitka Danielová
E-mail: [email protected]
Knihovna ústavu:
Ivana Kolářová
Tel.: +420 241 062 218
Fax +420 241 062 782
E-mail: [email protected]
Tisková mluvčí:
Mgr. Jana Voláková Křížová
Tel.: +420 241 062 780
E-mail: [email protected]
www.iem.cas.cz
www.uem.cas.cz
9
Orgány ústavu
Rada instituce ÚEM AV ČR
Radu instituce volí shromáždění vědeckých pracovníků, současní členové Rady byly zvoleni v prosinci 2011. Rada se skládá
z předsedy, místopředsedy, interních a externích členů, jednání se účastní též stálí hosté prof. Amler a prof. Holáň. Předsedkyní
Rady byla zvolena prof. MUDr. Eva Syková, DrSc. a místopředsedou pak MUDr. Radim Šrám, DrSc.
Rada instituce dbá na zachování účelu zřízení organizace, na uplatnění veřejného zájmu v její činnosti a na řádné
hospodaření, stanovuje hlavní směry činnosti organizace, schvaluje vnitřní předpisy a rozpočet organizace, projednává návrhy na změny zřizovací listiny a vykonává další činnosti dle zákona.
Interní členové: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
(předsedkyně Rady instituce)
MUDr. Radim J. Šrám, DrSc.
(místopředseda Rady instituce)
Ing. Miroslava Anděrová, CSc.
doc. RNDr. Alexandr Chvátal, DrSc., MBA
RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
doc. MUDr. Miroslav Peterka, DSc.
prof. MUDr. Josef Syka, DrSc.
MUDr. Pavel Vodička, CSc.
RNDr. Zdeněk Zídek, DrSc.
Externí členové: prof. MUDr. Stanislav Filip, Ph.D., DSc. (FN HK)
Ing. Milan Hájek, DrSc. (IKEM)
prof. MVDr. Aleš Hampl, CSc. (LF MU)
prof. MUDr. Miroslav Ryska, CSc. (ÚVN)
doc. MUDr. Josef Zámečník, Ph.D. (2.LF UK)
Stálí hosté:
prof. RNDr. Evžen Amler, Ph.D.
prof. RNDr. Vladimír Holáň, Ph.D., DrSc.
Tajemník: Ing. Petr Bažant, CSc., MBA
E-mail: [email protected]
Rada instituce v průběhu roku 2013 jednala celkem šestkrát, vždy byla usnášeníschopná. Na prvém zasedání
schválila rozpočet pro rok 2013. Pravidelně probíhají před Radou interní obhajoby dizertačních prací, v roce 2013
to byly čtyři schválené práce. Rada též schvaluje podání grantových aplikací do GA ČR, v loňském roce jich bylo
24. Rada se trvale věnuje internímu hodnocení kvality práce oddělení ústavu i jednotlivých vědeckých pracovníků.
Dozorčí rada ÚEM AV ČR
Dozorčí rada vykonává dohled nad činností, hospodařením a nad nakládáním s majetkem ústavu
a vydává předchozí písemný souhlas k vybraným právním úkonům. Schází se nejméně dvakrát ročně.
Dozorčí rada ÚEM AV ČR pracovala v roce 2013 ve složení
prof. Ing. Petr Ráb, DrSc. (Akademická rada AV ČR) – předseda (do 21. července 2013)
RNDr. Hana Sychrová, DrSc. (Akademická rada AV ČR) – předsedkyně (od 21. července 2013)
Členové:
Ing. Petr Bažant, CSc., MBA (ÚEM AV ČR, v.v.i.) – místopředseda
JUDr. Jiří Malý (Středisko společných činností AV ČR, v.v.i.)
prof. MVDr. Jiří Rubeš, CSc. (Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i., Brno)
MUDr. Karel Filip, CSc., MBA (Thomayerova nemocnice, Praha)
Ing. Josef Fulka, DrSc. (Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i., Praha)
Tajemník:
Ing. Jan Prokšík
E-mail: [email protected]
V rámci svých zákonných kompetencí projednávala dozorčí rada na svých dvou zasedáních dne 24. května 2013
a 2. prosince 2013 záležitosti týkající se hospodaření ústavu, zejména účetní závěrku za předchozí rok, rozpočet ústavu na běžný rok, hospodářskou situaci dceřiné transferové společnosti Bioinova s.r.o., nájemní smlouvy, manažerské
hodnocení ředitelky ústavu, stav řešení jednotlivých projektů účelového financování, zejména financovaných ze
strukturálních fondů EU. Souhlasně projednala záměr pořízení nákladných přístrojů v rámci schválených projektů
v programu Praha – Konkurenceschopnost. V jednom případě proběhlo hlasování i procedurou per-rollam.
10
Organizační schéma ústavu v roce 2013
EU centrum excelence
ŘEDITELKA
RADA INSTITUCE
TECHNICKÉ
ÚTVARY
Servisní oddělení
Technickohospodářská správa
Oddělení
mikroskopie
Inovační
biomedicínské
centrum
Výzkumné centrum
buněčné terapie
DOZORČÍ RADA
ŘEDITELSKÁ RADA
ZÁSTUPCE ŘEDITELKY
KOMISE
TAJEMNÍK ÚSTAVU
VĚDECKÉ
ÚTVARY
SPOLEČNÁ
PRACOVIŠTĚ
Oddělení neurověd
Laboratoř difúzních studií a zobrazovacích metod
Laboratoř tkáňových kultur a kmenových buněk
Laboratoř biomateriálů a biofyzikálních metod
Laboratoř histochemie a farmakologie oka
Oddělení neurověd ÚEM
a Ústav neurověd UK 2. LF
Oddělení neurofyziologie sluchu
Laboratoř synaptického přenosu
Laboratoř sluchové fyziologie a patologie
Oddělení buněčné neurofyziologie
Oddělení molekulární neurofyziologie
Oddělení farmakologie
Společné pracoviště
regenerativní medicíny
ÚEM AV ČR, IKEM a UK
Společné pracoviště
Neuroregenerace
a biomedicínského
výzkumu
ÚEM AV ČR a Krajská
zdravotní, a.s.
(Masarykova nemocnice
v Ústí nad Labem)
Oddělení genetické ekotoxikologie
Laboratoř molekulární epidemiologie
Laboratoř genetické toxikologie
Laboratoř genomiky
Oddělení teratologie
Laboratoř embryogeneze
Laboratoř odontogeneze
Oddělení molekulární biologie nádorů
Laboratoř genetiky nádorů
Laboratoř DNA reparací
Oddělení transplantační imunologie
Oddělení tkáňového inženýrství
11
Výzkumná centra
1. Projekt excelence v oblasti neurověd
2012–2018
Projekt excelence v oblasti neurověd 2012–2018 je multidisciplinární projekt finančně podporovaný GA ČR, který je
založen na spolupráci předních neurovědních pracovišť.
Řešitel: MUDr. Ladislav Vyklický, DrSc., Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
Spoluřešitelé: RNDr. Daniela Řípová, CSc., Psychiatrické centrum Praha
prof. MUDr. Josef Syka, DrSc., ÚEM AV ČR, v.v.i.
Ing. Miroslava Anděrová, CSc., 2. LF UK v Praze
Cílem projektu je objasnit patofyziologické mechanismy vzniku neurodegenerativních onemocnění
a přispět ke včasné diagnostice a efektivnější léčbě těchto chorob.
Neurodegenerativní onemocnění se často vyskytují u stárnoucí populace, ale i u mladých jedinců a představují
závažný socio-ekonomický problém. Tato etiologicky různorodá onemocnění vedou k vážným kognitivním, motorickým a senzorickým poruchám. Cílem projektu je objasnit patofyziologické mechanismy vzniku těchto chorob
od úrovně genetické až po systémovou. Dosažení cíle bude umožněno díky inter-disciplinární spolupráci několika
významných vědeckých týmů v České republice; tak náročný úkol není možné řešit v rámci individuálních projektů jednotlivých týmů. S využitím širokého metodického zázemí jsou studovány mechanismy regulace genové
exprese, funkce membránových receptorů (s důrazem na NMDA receptory), mezibuněčné komunikace, modulace extracellulárního prostoru a funkce gliových buněk. Objasnění základních mechanismů neurodegenerativních
onemocnění vede k jejich inovativní a efektivní léčbě, např. s využitím neurosteroidů či kmenových buněk. Projekt
poskytuje optimální zázemí pro vysoce kvalitní postgraduální výuku neurověd.
V ÚEM AV ČR jsou imunohistochemickými metodami studovány morfologické změny gliových buněk v různých částech mozku během stárnutí myší. V současnosti je připravena pro tento výzkum transgenní myš představující model Alzheimerovy choroby. Využití kmenových buněk v procesu regenerace nervové tkáně je studováno u potkanů s poškozenou míchou nebo u modelu amyotrofické laterální sklerózy. Bylo zjištěno, že aplikace
mesenchymálních stromálních buněk do míšní léze vytvořené kompresí balonkovou metodou výrazně zlepší
pohybové schopnosti potkana. Morfologické a funkční změny ve sluchovém systému po expozici intenzivním
hlukem jsou studovány u potkanů imunohistochemickými, behaviorálními a elektrofyziologickými metodami
a metodou měření vápníkových proudů ve sluchové kůře myši dvoufotonovým mikroskopem. Tyto metody
Sluchové prahy a vizualizace jednotlivých struktur vnitřního ucha potkana
12
prokázaly specifické poškození centrální části sluchového systému intenzivním hlukem a naznačují zapojení
korových inhibičních interneuronů při zpracování akustické informace po akustickém traumatu, které je odlišné od poškození periferie vyvolané hlukem. Na experimentální studie navazuje i klinický výzkum, ve kterém
je ve spolupráci s klinikou zobrazovacích metod studován vliv stárnutí na sluchovou kůru člověka. Využitím
magnetické rezonanční spektroskopie bylo prokázáno, že degenerativní změny ve vnitřním uchu způsobené
stárnutím jsou provázeny snížením koncentrace excitačního neurotransmiteru glutamátu a zvýšením laktátu
ve sluchové kůře starších osob. Projekt excelence v oblasti neurověd také poskytuje zázemí pro vědeckou výchovu studentů v rámci postgraduální výuky neurověd.
Výsledky projektu v roce 2013
Kulijewicz-Nawrot M., Syková E., Chvátal A., Verkhratsky A., Rodríguez J.J. (2013). Astrocytes and glutamate homeostasis in Alzheimer’s disease: a decrease in glutamine synthetase but not in glutamate transporter-1 in the prefrontal cortex. ASN Neuro. 2013 Sep 23 doi:10.1042/AN20130017 (in press)
Forostyak S., Jendelová P., Syková E. (2013). The Role of Mesenchymal Stromal Cells in Spinal Cord Injury, Regenerative
Medicine and Possible Clinical Applications. Biochimie (in press).
Amemori T., Romanyuk N., Jendelová P., Herynek V., Turnovcová K., Procházka P., Kapcalová M., Cocks G., Price J.,
Syková E. (2013). Human conditionally immortalized neural stem cells improve locomotor function after spinal cord
injury in the rat. Stem Cell Res. Ther. 4(3): 68.
Tomek J., Novak O., Syka J. (2013). Two-Photon Processor and SeNeCA: a freely available software package to process data from two-photon calcium imaging at speeds down to several milliseconds per frame. J Neurophysiol. 2013
Jul;110(1):243-56.
Profant O., Balogová Z., Dezortová M., Wagnerová D., Hájek M., Syka J. (2013). Metabolic changes in the auditory
cortex in presbycusis demonstrated by MR spectroscopy. Exp Gerontol. 2013 Aug;48(8):795-800.
2. Centrum studií toxických vlastností nanočástic (CENATOX)
2012–2018
V rámci Centra excelence v základním výzkumu GA ČR se věnujeme zejména globálním i specifickým změnám genové exprese po působení látek vázaných na nanočástice vznikající v důsledku spalovacích procesů.
Dosavadní výsledky ukazují na klíčovou úlohu Ah-receptoru v toxické odpovědi na expozici těmto látkám. Dále
v rámci Centra spolupracujeme s integrovaným FP7 projektem „Quality in nanosafety assessment – driving best
practice and innovation“ (QNano) na standardizaci testů toxicity vyráběných nanočástic.
Řešitel: RNDr. Miroslav Machala, CSc., Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Spoluřešitelé: Ing. Pavel Moravec, CSc., Ústav chemických procesů AV ČR, v.v.i.
RNDr. Omar Šerý, Ph.D.,Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
Ing. Zbyněk Večeřa, CSc., Ústav analytické chemie AV ČR, v.v.i.
Ing. Jan Topinka, DrSc., Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
RNDr. Jan Hovorka, Ph.D., UK, Přírodovědecká fakulta
Rychlý rozvoj produkce nanomateriálů a jejich použití v řadě průmyslových odvětví s sebou nesou zvýšenou potřebu hlubšího porozumnění mechanismům jejich interakce s živými organismy. Tato potřeba je především dána unikátními vlastnostmi nanočástic plynoucími z jejich rozměrů a tím schopností pronikat v organismu do tkání i buněk. Nanočástice vznikají též v důsledku antropogenní činnosti (průmysl, doprava, lokální
topeniště). Navrhované interdisciplinární centrum základního výzkumu toxicity nanočástic sdružuje pracoviště
schopná provádět komplexní studie mechanismů toxicity průmyslově důležitých a hojně rozšířených nanomateriálů a také antropogenně produkovaných částic v životním prostředí, se zvláštním zřetelem na oblasti se silně
znečištěným ovzduším v ČR.
13
Automatický skenovací systém Metafer 4 provádí analýzu mikrojader.
Studie jsou prováděny na dobře charakterizovaných nanočásticích (včetně monitorování během experimentálních
expozic) tak, aby získané výsledky v oblasti biologického působení a toxicity těchto částic byly kvalitní a porovnatelné a mohly tak sloužit pro vývoj metod studia toxicity nanočástic.
3. P
rojekt Centrum vývoje originálních léčiv (CVOL)
2012–2019
Projekt Centrum vývoje originálních léčiv je strategickým plánem, který zhodnocuje výsledky základního
výzkumu v oblastech medicinální chemie a farmakologie. Cílem projektu je umožnit převod lékových kandidátů do komerční praxe. Projekt vytvoří organizační strukturu schopnou rozvíjet projekty zaměřené na hledání
nových léků především v preklinickém stádiu. Projekt zásadním způsobem zvýší úspěšnost vývoje originálních léků
v ČR a bude pokračovatelem v tradičně silném oboru místní vědy a průmyslu.
Řešitel: RNDr. Zdeněk Havlas, DrSc., Ústav organické chemie a biochemie AV ČVR, v.v.i.
Spoluřešitelé: d
oc. RNDr. Martin Valchář, CSc., Quinta-Analytica, s.r.o.
Jan Zábský, MBA, MediTox, s.r.o.
doc. Ing. Martin Fusek, CSc., IOCB TTO, s.r.o.
Mgr. Miroslav Havránek, Ph.D., Apigenex, s.r.o.
MUDr. Ladislav Vyklický, DrSc., Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
RNDr. Zdeněk Zídek, DrSc., Ústav experimentální medicíny, AV ČR, v.v.i.
doc. MUDr. Marián Hajdúch, Ph.D., Univerzita Palackého v Olomouci, LF
prof. RNDr. Vladimír Král, DSc., VŠCHT, Fakulta chemicko-inženýrská
Výsledek projektu v roce 2013
Mezinárodní přihláška patentu PCT/CZ201/000020: Pyrimidine compounds inhibiting the formation of nitric
oxide and prostaglandin E2, method of production thereof and use thereof (Inventors: Jansa, P., Holy, A., Zidek, Z.,
Kmonicková, E., Janeba, Z.). O látkách uvedených v patentu se předpokládá, že budou využity v léčbě zánětlivých
onemocnění, především střevních chorob.
14
Oddělení neurověd
Vedoucí: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 230
V oddělení jsou studovány mechanismy onemocnění
CNS, poranění mozku a míchy, užití kmenových buněk
a biomateriálů v jejich léčbě. Dále jsou studovány iontové
změny a difúzní parametry v CNS v průběhu fyziologických
a patologických stavů, nesynaptický přenos v CNS,
receptory a iontové kanály, funkce gliových buněk.
Laboratoř tkáňových kultur
a kmenových buněk
Vedoucí: RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 828
V laboratoři se vědci zabývají izolací, značením a užitím kmenových buněk
k léčbě poranění mozku, míchy a neurodegenerativních onemocnění.
Jsou studovány různé typy buněk (mezenchymové kmenové buňky,
neurální prekurzorové buňky derivované z linie fetálních spinálních buněk
nebo z indukovaných pluripotentních buněk) a přírodní protizánětlivé
látky z hlediska jejich potenciálu napomáhat regeneraci nervové tkáně.
Makroporézní polymerní hydrogely jsou využívány jako vhodné nosiče
pro růst buněk jak v kulturách in vitro, tak v in vivo implantacích jako cílené
nosiče buněk, které podporují regeneraci poraněné tkáně. Cílem buněčné
terapie je opravit nebo nahradit, případně zlepšit biologické funkce
poškozené nervové tkáně.
Vědečtí pracovníci:
prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
MVDr. Takashi Amemori, CSc.
Mgr. Nataliya Romanyuk, Ph.D.
MUDr. Lucia Urdziková-Machová, Ph.D.
MUDr. Aleš Hejčl, Ph.D.
RNDr. Klára Jiráková, Ph.D.
MUDr. Serhiy Forostyak, Ph.D.
Postgraduální studenti:
Mgr. Miroslava Kapcalová (mat. dovolená)
MUDr. Karolina Turnovcová
MUDr. Petr Lesny (do března 2013)
Mgr. Václav Vaněček
Mgr. Magdalena Kulijewicz-Nawrot
Mgr. Dana Mareková
Mgr. Jiři Růžička
Mgr. Kristýna Kárová
MUDr. Pavel Svítil
Techničtí pracovníci:
Linda Fedorowiczová
Pavlina Macková
Michal Douděra
15
Významné výsledky v roce 2013
1. Imortalizovaná linie lidských spinálních prekurzorových
buněk vede ke zlepšení motorických funkcí po míšním poranění
Do akutní míšní léze jsme implantovali neurální spinální progenitorové buňky, či kombinaci buněk a hydrogelů
a sledovali jsme vliv implantátů na regeneraci míšní tkáně. Kmenové buňky v časné fázi produkovaly neurotrofické
faktory, které zlepšily motorické funkce potkanů a současně pomalu zrály a diferencovaly do neuronů a částečně
rekonstruovaly míšní tkáň. Hydrogely překlenuly lézi, podpořily diferenciaci transplantovaných buněk, růst axonů
do implantátu a snížily tvorbu gliové jizvy.
Spolupráce: King’s College London, Ústav makromolekulární chemie AV ČR
Obr. Integrace a differenciace spinálních progenitorových buněk v poraněné míše potkana
Dva měsíce po transplantaci byly SPC-01 buňky pozitivní na raný transkripční faktor interneuronů a motoneuronů nkx 6.1.
a vykazovaly zvýšenou expresi RNA znaků zralých motoneuronů Islet2 a HB9 A. Čtyři měsíce po transplantaci byly v transplantátu nalezeny buňky pozitivní na Islet2 a cholin acetyl transferázu, B. zralé markery motoneuronů. (Amemori et al., 2013).
Publikace:
Amemori, T., Romanyuk, N., Jendelova, P., Herynek, V., Turnovcova, K., Prochazka, P., Kapcalova, M., Cocks, G., Price,
J., Sykova, E.: (2013) Human conditionally immortalized neural stem cells improve locomotor function after spinal
cord injury in the rat. Stem Cell Res. Ther. 4(3): 68. IF 3,652.
Cocks, G., Romanyuk, N., Amemori, T., Jendelova, P., Forostyak, O., Jeffries, A. R., Perfect, L., Thuretm S., Dayanithi, G.,
Sykova, E., Price, J.: (2013) Conditionally immortalized stem cell lines from human spinal cord retain regional identity
and generate functional V2a interneurons and motorneurons. Stem Cell Res. Ther. 4(3): 69. IF 3,652.
16
Ruzicka, J., Romanyuk, N., Hejcl, A., Vetrik, M., Hruby, M., Cocks, G., Cihlar, J., Pradny, M., Price, J., Sykova, E., Jendelova,
P.: (2013) Treating spinal cord injury in rats with a combination of human fetal neural stem cells and hydrogels modified with serotonin. Acta Neurobiol. Exp. 73(1): 102-115. IF 1.977.
2. Modifikace polymerních hydrogelů na bázi metakrylátu,
sloužících k překlenutí léze a jako nosiče pro buněčnou terapii
Ve spolupráci s Ústavem makromolekulární chemie AV ČR jsme vyvinuli a otestovali polymérní hydrogely na bázi
metakrylátu s různými typy pórů a povrchem modifikovaným kladným nábojem nebo peptidickou sekvencí RGD.
Hydrogely byly implantovány do akutního modelu míšní hemisekce. Z výsledků vyplynulo, že kladný náboj a síťová
struktura pórů s RGD sekvencí na povrchu podporují růst buněk jak in vitro tak in vivo, a současně i vrůstání axonů
a cév hostitele.
Spolupráce: ÚMCH AV ČR
Obr. Metakrylátový hydrogel
s modifikovaným povrchem
přemostil míšní lézi A. a podpořil vrůstání axonů B., cév
C. a astrocytů D. Sloužil i jako
vhodný nosič transplantovaných kmenových buněk E., F.
Měřítko A=400 µm, B,E=100
µm, C,F= 25µm, D=50µm.
Publikace:
Hejcl, A., Ruzicka, J., Kapcalova, M., Turnovcova, K., Krumbholcova, E., Pradny, M., Michalek, J., Cihlar, J., Jendelova, P.,
Sykova, E.: (2013) Adjusting the chemical and physical properties of hydrogels leads to improved stem cell survival
and tissue ingrowth in spinal cord injury reconstruction: a comparative study of 4 methacrylate hydrogels. Stem
Cells Dev. 2013 Oct 15;22(20):2794-805. IF 4,670.
17
3. Metoda automatického sledování
Ve spolupráci s Univerzitou v Bergenu jsme vyvinuli metodu automatického sledování metastázujících melanomových buněk v mozku. Buňky melanomu byly označeny nanočásticemi na bázi oxidů železa a aplikovány do levé
srdeční komory. Zachycené metastázy v mozku byly sledovány a hodnoceny magnetickou rezonancí.
Spolupráce: University of Bergen, Norsko
Publikace:
Sundstrøm, T., Daphu, I., Wendelbo, I., Hodneland, E., Lundervold, A., Immervoll, H., Skaftnesmo, K. O., Babic, M.,
Jendelova, P., Sykova, E., Lund-Johansen, M., Bjerkvig, R., Thorsen, F.: (2013) Automated tracking of nanoparticle-labeled melanoma cells improves the predictive power of a brain metastasis model. Cancer Res. 73(8): 2445-2456. IF 8,650.
Laboratoř difúzních studií
a zobrazovacích metod
Vedoucí: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 230
Laboratoř je zaměřena na studium extracellulárního prostoru (ECP)
a zvláště jeho difúzních parametrů. Změny těchto parametrů během
různých fyziologických a patologických stavů výrazně ovlivňují mezibuněčnou komunikaci a to především extrasynaptický přenos, ale mají modulační
vliv i na přenos synaptický. Změny difúzních parametrů ECP jsou studovány
pomocí unikátní iontoforetické metody v reálném čase a difúzně vážené
magnetické rezonance v experimentálních modelech, které napodobují
patologické stavy a nemoci nervového systému jako jsou např. nádory, ischemické poškození, změny během stárnutí, poranění mozku a míchy, epilepsie
a Alzheimerova choroba. Studie jsou zvláště zaměřeny na výzkum a pochopení
mechanismů udržování iontové a objemové homeostázy, neurgliální interakce a úlohy extracellulární matrix a glie při přenosu signálů. Cílem výzkumu
je zlepšení terapeutických a diagnostických metod pro onemocnění CNS
a prevence poškození nervového systému.
Vědečtí pracovníci:
prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
doc. MUDr. Lýdia Vargová, Ph.D.
Mgr. Ivan Voříšek, Ph.D.
MUDr. Aleš Homola, Ph.D.
Postgraduální studenti:
Mgr. Lesia Dmytrenko
MUDr. Michal Cicanič
Laboranti/technický personál:
Hana Kučerová
Helena Pavlíková
Významný výsledek v roce 2013
Vliv deficitu alfa-syntrofinu na změny struktury a difúzních
vlastností tkáně při zvětšení buněčného objemu během
fyziologických a patologických stavů
Transport vody přes aquaporinové kanály zvětšuje a urychluje zvětšení objemu astrocytů především během závažných patologických stavů a během stavů, které jsou spojeny se zvýšenou koncentrací draslíku. Změněné difúzní vlastnosti extracellulárního prostoru ovlivňují pohyb neuroaktivních látek nebo trofických faktorů a následně
18
rozsah poškození tkáně nebo distribuci léků. Alfa-syntrofin proto představuje možný cíl pro terapeutický zásah při
mozkové ischémii.
Spolupráce: 2. LF UK v Praze
Obr. Morfologické změny astrocytů v cortexu alfa-syntrofin pozitivních a negativních myší v barvení na GFAP (vlevo), vypočítané změny objemu astrocytů na základě GFAP imunoreaktivity (veprostřed) a změny objemové frakce extracellulárního
prostoru (vpravo) před, během a po aplikaci mírně hypotonického roztoku (H-50, A), silně hypotonického roztoku (H100, B)
nebo roztoku se zvýšenou koncentrací draslíku (10 mM K+). Deficit alfa-syntrofinu výrazně snížil sledované změny pouze při
aplikaci silně hypotonického roztoku nebo při zvýšené koncentraci draslíku.
Publikace:
Dmytrenko L., Cicanic M., Anderova M., Vorisek I., Ottersen O.P., Sykova E., Vargova L. (2013) The impact of alpha-syntrophin deletion on the changes in tissue structure and extracellular diffusion associated with cell swelling under
physiological and pathological conditions. PLoS One. 2013 Jul 5;8(7):e68044., IF 3,73.
19
Laboratoř biomateriálů
a biofyzikálních metod
Vedoucí: PharmDr. Šárka Kubinová, Ph.D.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 635
Laboratoř je zaměřena na vývoj syntetických biomateriálů pro regeneraci
a rekonstrukci tkání a studium jejich funkčnosti na biologických modelech.
Ve spolupráci s Fyzikálním ústavem AV ČR se laboratoř zabývá komplexním
výzkumem interakcí nízkoteplotního plazmatu s živými organismy a vývojem nových technologií a zařízení pro využití nízkoteplotního plazmatu
v biomedicínských aplikacích.
Vědečtí pracovníci:
PharmDr. Šárka Kubinová, Ph.D.
Postgraduální studenti:
Mgr. Zuzana Kollárová
MUDr. Dmitry Tukmachev
Pregraduální student:
Bc. Jana Dubišová
Technický pracovník:
Linda Fedorowiczová
Významné výsledky v roce 2013
1. Vývoj biologických scaffoldů z decelularizované matrix
Ve spolupráci s McGowan Institute for Regenerative medicine v Pittsburghu jsou připravovány degradabilní hydrogely na bázi decelularizované extracellulární matrix, jejichž terapeutický potenciál je ověřován in vitro na buněčných kulturách a in vivo na modelech poškozené míšní tkáně.
Spolupráce: McGowan Institute for Regenerative medicine, Pittsburgh, USA
Fluorescenční imunohistochemické
snímky podélných řezů míchy zobrazující hydrogel s orientovanou
porozitou implantovaný do míšní
transekce. A. Barvení zobrazující
neurofilamenta prorůstající do struktury hydrogelu. B. Detail zobrazující
neurofilamenta v oblasti implantovaného hydrogelu. C. Barvení zobrazující
vrůstání cév do implantovaného hydrogelu. D. Detail z oblasti hydrogelu
s prorůstajícími cévami. Histologie byla
provedena dva měsíce po implantaci
hydrogelu. Měřítko: (A., C.) 500 µm, (B.,
D.) 50 µm.
Publikace:
Kubinová, S., Horak, D., Hejcl, A., Plichta, Z., Kotek, J., Proks, V., Forostyak, S., Sykova, E. SIKVAV-modified highly superporous PHEMA scaffolds with oriented pores for spinal cord injury repair. J. Tissue Eng. Regen. Med. 2013 Feb 11.
doi: 10.1002/term.1694., in press. IF 2,826.
20
2. Vývoj biomodifikovaných PHEMA hydrogelů s orientovanou
porozitou pro přemostění léze po míšním poranění
Ve spolupráci s ÚMCH AV ČR bylo vyvinuto několik typů biomodifikovaných hydrogelů na bázi poly(2-hydroxyethyl
methakrylátu) (PHEMA) pro implantaci do poškozené míchy. Aby bylo možné využít PHEMA scaffold jako nosič
kmenových buněk, byly úspěšně zavedeny bioaktivní povrchové modifikace PHEMA hydrogelů pomocí kovalentní
imobilizace cholesterolu, peptidové sekvence SIKVAV a fibronektinu. Mechanické vlastnosti a porozita těchto hydrogelů byly optimalizovány tak, aby byla zachována kompatibilita scaffoldu s okolní tkání a současně aby bylo
umožněno funkční přemostění léze. Vybrané hydrogely s orientovanou porozitou a povrchovou modifikací SIKVAV
byly dále hodnoceny v kombinaci s kmenovými buňkami in vivo po implantaci do míšní hemisekce. Orientovaná
porozita hydrogelů stimulovala vrůstání axonů a dalších tkáňových struktur do implantátu, nicméně pro funkční
přemostění míšního poškození je nutné zapojit další terapeutické přístupy (růstovné faktory, rehabilitace, aj.).
Spolupráce: Ústav makromolekulární chemie AV ČR
Obr. A. Fibroblasty kultivované na hydrogelu připraveném z decelularizované matrix.
B. Podélný řez míchy potkana s hydrogelem
implantovaným do míšní léze. C. Vrůstání
neuronálních výběžků a D. cév do implantovaného hydrogelu. Měřítko: A. 50µm, B. 500
µm, (C., D.) 100 µm.
Laboratoř histochemie
a farmakologie oka
Vedoucí: doc. MUDr. Jitka Čejková, DrSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 208
Laboratoř histochemie a farmakologie oka zkoumá příčiny špatně se
hojících lézí předního očního segmentu při různých očních poraněních
nebo onemocněních a možnosti regenerace tkání předního očního
segmentu, zejména rohovky s navrácením vizuálních funkcí. Pro hojení
lézí předního očního segmentu je zvláštní pozornost věnována nanovláknům jako nosičům kmenových buněk a lékových forem.
Vědečtí pracovníci:
doc. MUDr. Jitka Čejková, DrSc.
Ing. Čestmir Čejka, Ph.D.
Pregraduální studenti:
Tomanová Aneta
Vašková Věrča
Švandová Ivana
Bayerová Martina
Technický pracovník:
Jana Herlová
21
Významné výsledky v roce 2013
1. Nový regenerační faktor (RGTA, CACICOL20) pro hojení
chronických rohovkových poranění a onemocnění
Prokázali jsme, že nový regenerační faktor (RGTA, CACIC0L20) je účinným prostředkem pro hojení rohovkových
poranění, především špatně se hojících chronických vředů. Po aplikaci RGTA se exprese proteolytických enzymů
(zejména metaloproteináz) a enzymů generujících oxid dusnatý v chronických ranách podstatně snížila, což bylo
doprovázeno hojením rohovky bez výrazného zjizvení. Neovaskularizace rohovky a intraokulární zánět ustoupily.
Rohovková průhlednost se obnovila zcela, anebo částečně.
Spolupráce: Thea Laboratoires, Clermont Ferrand, France (Dr. Celine Olmiere)
Oddělení transplantační imunologie ÚEM AV ČR (prof. RNDr V. Holáň, DrSc)
Obr. 1. A. Reprezentativní fotografie králičí rohovky s vředy, které se vyvinuly po poleptání rohovek 1.0 N Na0H
a následně léčeny pomocí RGTA, anebo placebem. A. Kontrolní oko. Rohovka prvního oka jeden den po alkalickém poškození
louhem sodným. Rohovková průhlednost je ztracena. B. Rohovka prvního oka jeden měsíc po poleptání (rohovka byla neléčena).
Vyvinul se středový rohovkový vřed (šipka). D. Rohovka stejného oka po následném měsíčním léčením kapáním RGTA. Rohovkový
vřed je zhojen (šipka). E. Rohovka druhého oka jeden den po poleptání louhem sodným. Rohovková transparence je ztracena.
F. Stejná rohovka po jednom měsíci (rohovka bez léčení). Vytváří se středový rohovkový vřed (šipka). G. Stejná rohovka po dalším
měsíci, kdy byla léčena placebem. Vřed je vyvinutý v celé tloušťce rohovky (šipka) a přetrvává. Rohovka je vaskularizovaná.
Obr. 1. B. Exprese genů prozánětlivých cytokinů
v rohovce poleptané louhem sodným a léčené RGTA
anebo placebem. V rohovkách poleptaných louhem a léčených placebem, nebo RGTA byly stanoveny po 7 dnech
(po 0.15 N NaOH) a po 21 dnech (po 1.0 N NaOH) exprese
genů pro IL-1ß (a), IFN-γ (b) a i-NOS (c) pomocí real-time
PCR. Každý sloupcový graf představuje +- SD alespoň ze
třech stanovení. Signifikantní rozdíly: *P<0.05, ***P<0.01
mezi rohovkami léčenými RGTA a placebem.
Publikace:
Cejkova J., Olmiere C., Cejka C., Trosan P., Holan
V. (2013). The healing of alkali-injured cornea is
stimulated by a novel matrix regenerating agent
(RGTA, CACICOL20): a biopolymer mimicking heparan sulfates reducing proteolytic, oxidative and
nitrosative damage. Histol Histopathol 2013 Oct 9.
(29,457–78,2014). IF 2,281.
22
2. Králičí kmenové mesenchymové buňky na nanovláknových
nosičích hojí oxidační poškození rohovky, vyvolané louhem sodným
Králičí mesenchymové kmenové buňky na nanovláknových nosičích přenesené na povrch poškozeného oka zhojily
oxidační poškození, vyvolané alkalickým poraněním. Alkalické poranění oka vyvolá prooxidační/antioxidační nerovnováhu vedoucí v rohovce ke zvýšenému množství prozánětlivých cytokinů a k tvorbě peroxynitritu a malondialdehydu. Mesenchymové kmenové buňky signifikantně redukovaly oxidační poškození rohovky a zhojily rohovku
s navrácením průhlednosti.
Spolupráce: Oddělení neurověd ÚEM
AV ČR (prof. MUDr E. Syková, DrSc.)
Oddělení transplantační imunologie
(prof. RNDr V. Holáň, DrSc.)
Obr. 2. A. Reprezentativní fotografie
rohovek, poleptaných louhem sodným (0.15 N NaOH) (A–G), rohovková
neovaskularizace (H) a vaskulární
endoteliální faktor (VEGF) (I) 15. den
po poškození. A. Kontrolní oko, B. rohovka po poškození, C. poraněná rohovka
s nanovláknovým nosičem s mesenchymálními kmenovými buňkami (MSCs), D.,
E. vysoká (stupeň 4) D. nebo středně vysoká (stupeň 3) neovaskularizace v neléčené
rohovce E.. V rohovce poškozené a léčené
MSCs je slabá (stupeň 2) E. nebo velmi
slabá (stupeň 1) neovaskularizace. F., H.
Kvantifikace rohovkové neovaskularizace
počítáním cév. I. Kvantifikace rohovkové
neovaskularizace pomocí real-time PCR
(exprese genů pro VEGF).
Obr. 2.B. Barvení Haematoxylin-eosinem (HE) (A,B),
exprese vaskulárního endoteliálního faktoru (VEGF)
(C–F) a makrofágů (G–J) 15. den po poškození rohovky
louhem sodným (0.15 N NaOH); a. Neléčená poškozená
rohovka je vaskularizována (šipky) s četnými zánětlivými
buňkami. b. V poškozené rohovce léčené MSCs jsou zánětlivé buňky redukovány. c., e. V poškozené neléčené
rohovce je exprese VEGF výrazná, v rohovce poškozené
a léčené MSCs, je nízká. D. V kontrolní rohovce není exprese téměř přítomna. f. V poškozené neléčené rohovce je
velké množství makrofágů, g., i. v rohovce poškozené
a léčené MSCs malé. j. Rohovka kontrolní, bez makrofágů.
Publikace:
Cejkova J., Trosan P., Cejka C., Lencova A., Zajicova A., Javorkova E., Kubinova S., Sykova E., Holan V. (2013). Suppression
of alkali-induced oxidative injury in the cornea by mesenchymal stem cells growing on nanofiber scaffolds and
transferred onto the damaged corneal surface. Exp Eye Res, 116:312–23,2013, IF 3,026.
23
Oddělení neurofyziologie
sluchu
Vedoucí: prof. MUDr. Josef Syka, DrSc., dr.h.c.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 700
V oddělení jsou studovány morfologické a funkční
charakteristiky nervových buněk sluchového
systému a jejich poškození patologickými procesy.
Elektrofyziologické a histologické nálezy jsou
korelovány se změnami v chování laboratorních zvířat
hodnocených na základě behaviorálních testů.
Laboratoř fyziologie a patofyziologie sluchu
Vedoucí: prof. MUDr. Josef Syka, DrSc., dr.h.c.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 700
V laboratoři je studována struktura a funkce sluchového systému u zvířat za normálních podmínek a jsou
sledovány změny během vývoje, stárnutí a po působení různých patologických činitelů na sluchový systém,
jako je např. hluk nebo léky poškozující sluch. Při výzkumu jsou používány imunohistochemické techniky,
registrace aktivity jednotlivých neuronů nebo sluchových vyvolaných odpovědí z mozku, měření otoakustických emisí a behaviorální testy. Změny sluchu během stárnutí jsou sledovány u rychle stárnoucího kmene
potkana Fischer 344, který slouží jako experimentální model pro poznání mechanismů vzniku a vývoje presbyakuze u člověka. Vliv krátké expozice intenzivnímu hluku během postnatálního vývoje potkana nebo vliv
dlouhodobého pobytu v akusticky obohaceném prostředí v období kritické periody vývoje potkana jsou
předmětem studia fenoménu plasticity v nervovém systému. Výsledky experimentálního výzkumu jsou v praxi ověřovány na pacientech a dobrovolnících v rámci spolupráce s ORL klinikou 1. lékařské fakulty UK v Praze.
Na tento výzkum navazoval v minulosti projekt Grantové agentury ČR zaměřený na vliv stárnutí na sluchovou kůru člověka, prováděný ve spolupráci s klinikou zobrazovacích metod IKEM a projekt EU NANOEAR,
zabývající se možností transportu aktivních látek do vnitřního ucha s využitím lokálně podaných nanočástic.
V současné době probíhá výzkum změn sluchu vlivem stárnutí – presbyakuze – v rámci EU projektů COST
(TINNET) a FP7 Marie Curie Actions TARGEAR. Další směr výzkumu v laboratoři představuje detailní analýza kódování akustických signálů sítěmi neuronů ve sluchové kůře na základě měření vápníkových proudů
dvoufotonovým mikroskopem u geneticky modifikovaných myší a s využitím optogenetických metod.
Vědečtí pracovníci:
Mgr. Jolana Bartošová, Ph.D.
(mat. dovolená)
Ing. Zbyněk Bureš, Ph.D.
MUDr. Mgr. Tomáš Hromádka, Ph.D.
RNDr. Jiří Lindovský, Ph.D.
MUDr. Ladislav Ouda, Ph.D.
RNDr. Jiří Popelář, CSc.
RNDr. Natalia Rybalko, CSc.
Dr. Ing. Daniel Šuta
24
Postgraduální studenti:
MUDr. Zuzana Balogová
Mgr. Jana Burianová
MUDr. Tetyana Chumak
Mgr. Ondřej Novák
MUDr. Oliver Profant
MUDr. Ondřej Zelenka
Vědecký asistent:
Ing. Milan Jilek
Techničtí pracovníci:
Jana Janoušková
Jan Setnička
Významné výsledky v roce 2013
1. Efekt deficience parvalbuminu na úlekovou reakci a prepulsní
inhibice u myší
Amplituda akusticky vyvolané úlekové reakce (ASR) a prepulsní inhibice ASR (PPI ASR) byla měřena u parvalbumin
deficientních myší (PV-/-) a u kontrolních myší (PV+/+) stejného věku. U PV-/- myší byla zjištěna menší amplituda
úlekové reakce a méně účinná PPI ve srovnání s PV+/+ u myší. I když nebyl zjištěn žádný rozdíl ve sluchových prazích mezi oběma skupinami myší, rozdíly v ASR amplitudě a výrazně snížená účinnost PPI odráží specifické změny
v nervových inhibičních okruzích ve sluchových jádrech PV-/- myší.
Publikace:
Popelar J., Rybalko N., Burianova J., Schwaller B., Syka J. (2013) The effect of parvalbumin deficiency on the acoustic
startle response and prepulse inhibition in mice. Neurosci Lett. 553, 216–220. IF 2,026.
2. Parametry odpovědí neuronů v jednotlivých oblastech sluchové
kůry potkana
Neurony v primární sluchové kůře mají dobře definované frekvenční charakteristiky. Byly analyzovány parametry
odpovědí neuronů sluchové kůry potkana a na jejich základě byla sluchová kůra rozdělena na řadu podoblastí.
Například neurony v primární sluchové kůře mají dobře definované frekvenční charakteristiky odpovědí na stimulaci čistými tóny, zatímco neurony v okrajových oblastech (v tzv. beltu) reagují pouze na širokopásmový šum. Byla
vypracována účinná metoda měření vápníkových proudů neuronů sluchové kůry myši na dvoufotonovém mikroskopu, metoda byla dána k dispozici veřejnosti publikováním v J. Neurophysiology.
Obr. 1. A. Funkční organizace sluchové kůry potkana. A. Příklad lokalizace snímaných neuronů v pravé sluchové kůře (AC).
Čísla znázorňují hodnoty charakteristických frekvencí (CF) neuronů v jednotlivých místech snímání. B. Schématická mapa AC
ukazující tonotopickou organizaci a hranici mezi primární AC (AI, AAF, SRAF a PAF) a okrajovým polem (BELT AREA). Frekvenční
oblast odpovědí (FRA), vytvořená z odpovědí na stimulaci čistými tóny v primární AC, ukazuje ostře vyladěné prahové frekvenční
křivky (TC), které mají jasně definovanou CF (FRA 1), popř. reagují pouze na vysoké intenzity podnětů (FRA 2, nespecifická
oblast UR). Neurony v okrajovém poli na stimulaci čistými tóny nereagují (FRA 3). (Profant a spol., 2013)
25
Obr. 1. B. Dvoufotonové zobrazování vápníkových proudů in vivo. A. Nervové (zeleně) a gliové (žlutě) buňky ve II/III vrstvě
sluchové kůry myši. B. Trasa (zelená linie) spojující nervové buňky automaticky detekované SeNeCa softvarem.
Publikace:
Profant O., Burianova J., Syka J. (2013) The response properties of neurons in different fields of the auditorycortex in
the rat. Hear Res, 296C: 51-59. IF 2,537.
Tomek J., Novak O., Syka J. (2013) Two-Photon Processor and SeNeCA: a freely available software package to process
data from two-photon calcium imaging at speeds down to several milliseconds per frame. J Neurophysiol. 2013
Jul;110(1):243-56. IF 3,301.
3. Metabolické změny ve sluchové kůře u osob s presbyakuzí
demonstrované magnetickou spektroskopií
1H magnetickou spektroskopií (MRS) byla zkoumána metabolická úroveň ve sluchové kůře u starších a mladých
dobrovolníků. MRS ukázala pokles glutamátu a N-acetylaspartátu u stárnoucí populace. Velikost sluchové ztráty
u starších osob ovlivňovala úroveň laktátu ve sluchové kůře. GABA ukazovala jen minimální změny v závislosti
na sluchové ztrátě a stáří, což je v rozporu s výsledky získanými u laboratorních zvířat. Naše výsledky ukázaly, že
změny ve vnitřním uchu během stáří jsou doprovázeny poklesem excitačních neurotransmiterů glutamátu a laktátu ve sluchové kůře, což je nejvýraznější u starších lidí s velkou sluchovou ztrátou.
Publikace:
Profant O., Balogova Z., Dezortova M., Wagnerova D., Hajek M., Syka J. (2013) Metabolic changes in the auditory
cortex in presbycusis demonstrated by MR spectroscopy. Exp Gerontol. 2013 Aug;48(8):795-800. IF 3,911.
4. Korová reprezentace vokalizací morčete
Reprezentace čtyř vokalizací ve sluchové kůře (AI) morčete byla porovnávána s obdobnými daty získanými v colliculus inferior (IC) a corpus geniculatum mediale (MGB). Reprezentace vokalizací whistle a chutter byly transformovány na úrovni talamu, zatímco odpovědi na purr na korové úrovni. Reprezentace zvuků se širokým spektrem
(whistle, chirp) byla v AI a MGB podobná jako v IC, zatímco nízkofrekvenční zvuky (chutter, purr) byly hůře reprezentované v AI a MGB než v IC. Rozdíl ve velikosti odpovědí na přirozený a časově invertovaný whistle byl menší
v AI než v IC a MGB.
Publikace:
Suta D., Popelar J., Burianova J., Syka J.. (2013) Cortical representation of species-specific vocalizations in Guinea pig.
PLoS One. 2013 Jun 13;8(6):e65432. doi: 10.1371/journal.pone.0065432. IF 3,730.
26
Obr. Srovnání spektrogramů jednotlivých vokalizací se sumární odpovědí neuronové populace. Spektrotemporální
mapy odpovědí neuronové populace (nahoře), spektrogram vokalizace (uprostřed) a časový průběh vokalizace (dole) jsou
zobrazeny pro purr A., whistle B., chutter C. a chirp D. (Šuta a spol., 2013)
27
Laboratoř synaptické fyziologie
Vedoucí: RNDr. Rostislav Tureček, Ph.D.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 748
Laboratoř je zaměřena na zkoumání mechanismů excitačního
a inhibičního synaptického přenosu pomocí elektrofyziologických
a imunohistochemických technik. Studium je prováděno na
supravitálních řezech mozkového kmene potkana nebo myši.
Vědecký pracovník:
Ing. Michaela Králíková, Ph.D.
Postgraduální studenti:
Mgr. Bohdana Hrušková
MVDr. Kateryna Pysanenko
Významný výsledek v roce 2013
Modulace synaptické deprese v Heldově synapsích receptory
GABAB a spontánní aktivitou
Zkoumali jsme vliv presynaptických GABAB receptorů a spontánní aktivity na pravděpodobnost uvolnění glutamátu v Heldově synapsi juvenilních myší za in vivo a in vitro podmínek. Naše výsledky naznačují, že spontánní aktivita
může tonicky snižovat pravděpodobnost uvolnění in vivo. Navíc, naše data ukazují, že zbytková extracellulární koncentrace GABA je v mozkovém kmeni příliš nízká pro dostatečnou aktivaci GABAB receptorů na Heldově kalichu,
přestože aktivace GABAB snižuje synaptickou depresi senzorických signálů na této synapsi.
Spolupráce: Department of Neuroscience, Erasmus MC, University Medical Center Rotterdam, The Netherlands
Publikace:
Wang, T., Rusu, S. I., Hruskova, B., Turecek, R., Borst, J. G.: Modulation of synaptic depression of the calyx of Held
synapse by GABAB receptors and spontaneous activity. J. Physiol. (Lond.), 2013, Oct 1;591(Pt 19):4877-94. IF 4,380.
Obr. Inhibiční vliv presynaptických GABAB receptorů na excitační synaptický přenos v mediálním jádře trapezovitého tělesa (MNTB) myší. A. Schematické znázornění snímání excitačních postsynaptických proudů (EPSC) z těla hlavního
neuronu MNTB technikou terčíkového zámku (vlevo). Glutamátergní EPSC jsou vyvolány elektrickým drážděním obřího
nervového zakončení, tzv. Heldova kalichu. Agonista GABAB receptorů (baclofen) je vstřikován do mozkové tkáně pomocí
skleněné kapiláry. Na panelu vpravo jsou příklady glutamátergních EPSC snímaných při membránovém potenciálu -60 mV
v absenci (Control) nebo v přítomnosti 100 µM baclofenu (červeně). Všimněte si značně potlačené amplitudy EPSC v přítomnosti aktivace GABAB. B. Snímek z elektronového mikroskopu ukazuje ultratenký řez MNTB značený protilátkami GABAB
receptoru. Protilátky byly konjugovány se zlatými částicemi (IG). IG byly nalezeny na pre- i postsynaptických neuronech
Heldovy synapse v MNTB. Na tělech hlavních neuronů se vyskytovaly v inhibičních subsynaptických místech (plné šipky)
nebo extrasynapticky (prázdné hlavičky šipek). Na Heldově kalichu (exc.) a na inhibičních nervových zakončeních (inh.) byly
lokalizovány (dvojité šipky) v blízkosti glutamátergních a glycinergních aktivních zón (označených hvězdičkou). Měřítko: 0,5 µm.
C. Vliv iontoforetické aplikace baclofenu na zvukem vyvolanou synaptickou aktivitu v MNTB. Všimněte si vratného potlačení
extracellulárně snímaných synaptických potenciálů v přítomnosti aktivace GABAB.
28
Oddělení buněčné
neurofyziologie
Vedoucí: Ing. Miroslava Anděrová, CSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 050
Oddělení se zabývá morfologickými a elektrofyziologickými
vlastnostmi astrocytů a polydendrocytů (NG2 gliových buněk)
v patofyziologii globální a fokální cerebrální ischemie a v progresi Alzheimerovy choroby a mechanismy vápníkové signalizace u gliových buněk.
Vědečtí pracovníci:
Ing. Miroslava Anděrová, CSc.
MUDr. Helena Pivoňková, Ph.D.
prof. José Julio Rodriguez Arellano, Ph.D.
prof. MUDr. Alexey Verkhratsky, Ph.D., DSc.
doc. RNDr. Alexander Chvátal, Dr.Sc., MBA
Postgraduální studenti:
Mgr. Jana Turečková
Mgr. Pavel Honsa
Mgr. Olena Butenko
Mgr. Dávid Džamba
Mgr. Jan Kriška
Mgr. Lenka Harantová
Mgr. Martin Valný
Techničtí pracovníci:
Helena Pavliková
Ing. Markéta Hemerová
Markéta Valová
Významné výsledky v roce 2013
1. Lokální mozková ischemie indukuje neurogenní potenciál
Dach1- exprimujících buněk v dorsální části postranních komor
Dach1 gen je v myši exprimován neurálními kmenovými buňkami během rané neurogeneze a jeho exprese pokračuje také v části buněk, které se nalézají v dorsální části postranních komor v dospělém mozku. V této studii jsme
ukázali, že buňky, které exprimují Dach1 gen, hrají za fyziologických podmínek roli především v gliogenezi, zatímco
po ischemické poškození tyto buňky vykazují neurogenní diferenciační potenciál, avšak nejsou schopné migrovat
do ischemické oblasti, kde by přispívaly k regeneraci.
Obr. A. Ischémie zvýšila procento DCX+/GFP+ buněk v dorsální části postranních komor, graf ukazující procento DCX+ buněk ze všech
GFP+ buněk v dorsální části postranních komor. Hvězdičky ukazují významné rozdíly mezi kontrolou a post-ischemickou dorsální
částí postranních komor. B. Obrázek ukazuje DCX+ a GFP+ buňky v dorsální části postranních komor v kontrolním mozku. C. Obrázek
ukazuje DCX+ a GFP+ buňky v dorsální části postranních komor na ipsilaterální straně ischemického mozku. D. Obrázek ukazuje DCX+
a GFP+ buňky v dorsální části postranních komor na kontralaterální straně ischemického mozku . Všimněte si výrazně zvýšeného počtu
GFP+ buněk v dorsální části postranních komor a většího výskytu DCX+ buněk po celé kontralaterální postranní komoře. Šipky ukazují
GFP+/DCX+ buňky. Měřítko: 50 µm.
29
Publikace:
Honsa P., Pivonkova H., Anderova M., Focal cerebral ischemia induces the neurogenic potential of mouse Dach1expressing cells in the dorsal part of the lateral ventricles, Neuroscience 240 (2013)39–53, IF 3,38.
2. Heterogenita astrocytů: v průběhu vývoje i v patologii
– analýza genové exprese na úrovni jedné buňky
Astrocyty vykonávají kontrolní a regulační funkce v centrálním nervovém systému a jejich heterogenita je stále
předmětem sporu. Pro objasnění této heterogenity během postnatálního vývoje a po lokální mozkové ischemii
jsme použili metodu genového profilování na úrovni jedné buňky. Identifikovali jsme 3 populace astrocytů během
postnatálního vývoje a další tři subpopulace byly identifikovány během 14 dnů po ischemii: klidové glie, rané reaktivní glie a permanentně reaktivní glie.
Spolupráce: Biotechnologický ústav, AV ČR – prof. Mikael Kubista
Obr. Změna v genové expresi EGFP+ buněk po MCAO. A. Změny v genové expresi velmi exprimovaných astrocytálních/
NG2 gliálních markerů a membránových proteinů EGFP+ P50 (modrá), D3 (hnědá), D7 (zelená) a D14 (červená). B. PCA třídění
buněk ze všech post-ischemických fázích a P50. Stádia jsou označena barevně (P50 modrá, D3 hnědá, zelená D7, D14 červené), a tři skupiny identifikované SOM analýzou jsou označeny symboly (čtverečky pro B3, kruhy pro B1 a trojúhelníky pro
B2. C. Výskyt buněk ze tří subpopulací v post-ischemické fázích a P50. Geny pod tabulkou ukazují vysoce exprimované geny
v jednotlivých podskupinách. D. Distribuce buněk v jednotlivých subpopulacích. Zkratky: D3 – 3 dny po MCAO, D7 – 7 dní
po MCAO, D14 – 14 dní po MCAO, P50 – 50 dní postnatálně (kontrola).
Publikace:
Rusnakova V., Honsa P., Dzamba D., Stahlberg A., Kubista M., Anderova M. Heterogeneity of astrocytes: from development to injury – single cell gene expression, PLoS One. 2013 Aug 5;8(8), IF 3,703.
30
3. NMDA Receptory v gliových buňkách: nezodpovězené otázky
Objevy posledních 25 let prokázaly aktivní úlohu NMDA receptorů v gliových buňkách. Nicméně, existuje mnoho nevyřešených otázek spojených s NMDA receptory u glií. Hlavním cílem práce je objasnění těchto nejasností
shrnutím výsledků ze všech významných publikací týkajících se astrocytů, oligodendrocytů a polydendrocytů
u pokusných zvířat, které je rozšířené studiemi na lidských gliových buňkách.
Obr. Nejpravděpodobnější složení NMDA receptorů v astrocytech, oligodendrocytech a polydendrocytech v jednotlivých
oblastech CNS za fyziologických a patologických podmínek. Otazníky označují neznámé složení NMDA receptoru.
Publikace:
Dzamba D., Honsa P., Anderova M.: NMDA Receptors in Glial Cells: Pending Questions. Curr Neuropharmacol. 2013
May;11(3):250-62, IF 2,847.
31
Oddělení molekulární
neurofyziologie
Vedoucí: Dr. Govindan Dayanithi, Ph.D.
E-mail: [email protected], [email protected]
Tel.: +420 241 062 725
Oddělení molekulární neurofyziologie se zabývá fyziologií
vazopresinu a oxytocinu v centrálním a periferním nervovém
systému a terapeutickými důsledky pro řadu lidských nemocí.
Oddělení používá tři nově vyvinuté modely transgenních
potkanů, které umožňují vizualizaci fluorescenčního
vazopresinu a oxytocinu. Tyto modely jsou používány
ke studiu vápníkové signalizace a vápníkové homeostázy
v magnocellularních neuronech a terminálech a k objasnění
fyziologie signalizačních mechanismů vazopresinu
a oxytocinu v DRG neuronech a gliových buňkách. Nedávno
byl v oddělení založen nový přístup k hodnocení plasticity
vápníkové signalizace v kmenových buňkách různého
původu, včetně neuronových prekurzorů. Cílem je zhodnotit
patofyziologií vápníkové signalizace v motoneuronech
na zvířecích modelech neurodegenerativních onemocnění
a u kmenových buněk transplantovaných do poraněné míchy.
Vědecký pracovník:
Dr. Govindan Dayanithi, Ph.D.
Research Director in CNRS
Postgraduální studenti:
MUDr. Oksana Forostyak
MVDr. Tomohiko Kayano, Ph.D.
Ing. Štěpán Kortus
Technický pracovník:
Dominika Dušková
Významné výsledky v roce 2013
1. Plasticita vápníkových signalizačních kaskád v embryonálních
prekurzorech pocházejících z lidských kmenových buněk
2. Podmíněně imortalizované kmenové buněčné linie pocházející
z lidské míchy udržují regionální identitu a generují funkční V2A
interneurony a motorneurony
Tyto studie popisují mechanismy zapojené do vápníkové homeostázy v průběhu diferenciace kmenových buněk.
Neurální prekurzory (NPs) pocházející z lidských embryonálních afetalních kmenových buněk jsou považovány
za slibný nástroj pro buněčnou terapii poraněné nervové tkáně a neurodegenerativních onemocnění CNS a analýza jejich funkčních vlastností zůstáva stále otevřená. Naším cílem bylo studium fyziologie a role vápníku a jeho
signálních mechanismů pro pochopení funkčních vlastností neurálních prekurzorů pocházejících z lidských kmenových buněk v průběhu jejich diferenciace. Naše výsledky ukazují, že tyto buňky reagují na různé fyziologické
stimuly zvýšením [Ca2+]i, která se mění v průběhu diferenciace. Buňky exprimují funkční glutamátové a purinergní
receptory, napěťově závislé vápníkové kanály a ukazují spontánní Ca2+ oscilace, jak je obvykle pozorováno v neuronech. Znalost funkčních vlastností kmenových buněk nám umožní lépe kontrolovat jejich regenerační potenciál
a dále zlepšit strategie pro jejich použití při transplantacích a v léčbě.
32
Spolupráce: The James Black Centre, Department of Neuroscience, King’s College London, UK
University of Manchester, School of Biological Sciences, Manchester, UK
Department of Physiology, School of Medicine, Birmingham University, Birmingham, UK
Department of Veterinary Physiology, Faculty of Agriculture, Tottori University, Tottori, Japan
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Unité de recherche U710, Université
Montpellier 2, Montpellier; and Ecole Pratique des Hautes Etudes, Sorbonne, France
Obr. Intracelulární Ca2+ zásoby (ryanodinové) a spontánní [Ca2+]i oscilace pozorované v 7 pasáži neurálních prekurzorů
pocházejících z lidských embryonálních kmenových buněk.
Publikace:
Plasticity of calcium signaling cascades in human embryonic stem cell-derived neural precursors. Forostyak O.,
Romanyuk N., Verkhratsky A., Sykova E., Dayanithi G., Stem Cells Dev. 2013 May 15;22(10):1506-21. IF 4,670.
Conditionally immortalized stem cell lines from human spinal cord retain regional identity and generate functional V2a interneurons and motorneurons. Cocks G., Romanyuk N., Amemori T., Jendelova P., Forostyak O., Jeffries
A.R., Perfect L., Thuret S., Dayanithi G., Sykova E., Price J. Stem Cell Res Ther. 2013 Jun 7;4(3):69. IF 3,652.
33
Oddělení farmakologie
Vedoucí: RNDr. Zdeněk Zídek, DrSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 720
Oddělení je zapojeno do programů výzkumného okruhu
„Zdraví člověka“. Cílem je výzkum a vývoj originálních
nízkomolekulárních léčiv, zvláště imunofarmak. Dosavadní
výsledky prokázaly imunosupresivní vlastnosti nově
syntetizovaných derivátů pyrimidinu a imunobiologické
vlastnosti látek přírodního původu. Další studie jsou cíleny
na hledání racionální struktury a syntézy látek tak, aby byl
umožněn přenos výsledků do dalších preklinických a klinických fází výzkumu a posléze i komerční praxe. Optimalizace
struktury zajišťujeme průběžnou zpětnovazebnou komunikací
mezi biologickou a chemicko-syntetickou částí projektu.
Kromě stanovení biologické účinnosti jsou dalšími kritérii pro
zařazení látek do preklinického výzkumu i hodnocení jejich
bezpečnosti a stanovení mechanismů účinku. Terapeuticky
využitelná aktivita nadějných kandidátů je experimentálně
ověřována v modelech autoimunitních a zánětlivých
onemocnění.
Vědečtí pracovníci:
doc. RNDr. Eva Kmoníčková, CSc.
MUDr. Miloslav Kverka, Ph.D.
RNDr. Zdeněk Zídek, DrSc.
Postgraduální studenti:
Ing. Petra Kostecká
Mgr. Adéla Dusilová
Techničtí pracovníci:
Mgr. Jana Křížková
Eva Prchlíková
Významný výsledek v roce 2013
Výzkum a vývoj protizánětlivých léčiv – deriváty pyrimidinu
Ve vývoji nových léčiv zaujímají významné postavení nízkomolekulární látky typu pyrimidinových derivátů.
Analyzovali jsme velké množství nově syntetizovaných originálních struktur z hlediska jejich vnitřních imunobiologických vlastností. V závislosti na chemické struktuře jsme u nich nalezli schopnost inhibovat produkci prostaglandinů, oxidu dusnatého a cytokinů. Na základě těchto výsledků jsme přistoupili ke sledování jejich protizánětlivých
účinků, a to v experimentálních modelech lidských onemocnění jako jsou ulcerózní kolitida a revmatoidní artritida.
In vivo pokusy potvrdily předpoklad o protizánětlivé aktivitě některých derivátů v podmínkách in vivo.
Spolupráce: ÚOCHB, Praha
Publikace:
Harmatha, J., Budesinsky, M., Vokác, K., Kostecka, P., Kmoníckova, E., Zidek, Z.: Trilobolide and related sesquiterpene
lactones from Laser trilobum possessing immunobiological properties. Fitoterapia, 89C: 157-166, 2013. IF 2,231.
Jansa, P., Holy, A., Dracinsky, M., Kolman, V., Janeba, Z., Kostecka, P., Kmonickova, E., Zidek, Z.: 5-Substituted 2-amino-4,6-dihydroxypyrimidines and 2-amino-4,6-dichloropyrimidines: synthesis and inhibitory effects on immune-activated nitric oxide production. Medicinal Chemistry Research, (in press). IF 1,612.
34
Obr. 1. A. Řada pyrimidinových analogů snižuje velmi výrazně produkci mediátorů zánětu, oxidu dusnatého (NO) a prostaglandinu E2. Testy byly provedeny v podmínkách in vitro u myších makrofágů. Koncentrace, které inhibovaly produkci
těchto faktorů o 50% (IC50), se pohybovaly v rozmezí od 2 µM do 10 µM. Předností látek je, že nevykazují žádnou cytotoxickou
aktivitu.
Obr. 1. B. Pyrimidinové deriváty mají příznivý terapeutický efekt na rozvoj experimentální kolitidy, indukované u myší
pomocí dextran sulfátu. Snížení tíže onemocnění se vyrovná účinku obvyklého standardu, klinicky používaného sulfasalazinu.
35
Oddělení genetické
ekotoxikologie
Vedoucí: MUDr. Radim J. Šrám, DrSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 596
Oddělení má jako hlavní náplň výzkumu genetické
poškození způsobené toxickými a karcinogenními
látkami jako jsou polycyklické aromatické uhlovodíky
a jejich deriváty, alkeny, apod. Účinek těchto látek
je studován jak na buněčných kulturách, tak in vivo
v lidských translačních molekulárně epidemiologických
studiích a pozorovacích epidemiologických studiích.
Laboratoř molekulární epidemiologie
Vedoucí: MUDr. Radim J. Šrám, DrSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 596
V laboratoři jsou prováděny molekulárně epidemiologické studie s použitím biomarkerů expozice
mutagenům a karcinogenům (DNA adukty, chromosomové aberace, mikrojádra, oxidační poškození
DNA, proteinů a lipidů, genotypizace, stanovení RNA expresních profilů), studie vlivu životního prostředí
na výsledky těhotenství a studium zdravotního stavu dětí ve vztahu k životnímu prostředí.
Vědečtí pracovníci:
MUDr. Radim J. Šrám, DrSc.
MUDr. Miroslav Dostál, DrSc.
RNDr. Božena Novotná, CSc.
MUDr. Anna Pastorková, CSc.
Mgr. Andrea Rössnerová, Ph.D.
Ing. Vlasta Švecová, Ph.D.
Postgraduální student:
Mgr. Kateřina Hoňková
Laborant:
Jolana Vaňková
Odborní pracovníci:
PhDr. Eva Dejmková
Ing. Ivo Solanský
Významný výsledek v roce 2013
Analýza biomarkerů u české populace exponované vysokému
znečištění ovzduší. Část I., část II.
Nové analýzy zaměřené na studium genové exprese ukázaly dramatické rozdíly mezi exponovanou a kontrolní populací. Překvapivým výsledkem bylo zjištění, že i když koncentrace polutantů na Ostravsku signifikantně překračují
jejich hladiny v kontrolní oblasti, počet genů, u nichž byla změněna míra exprese, je u ostravské populace výrazně
nižší, patrně došlo k navození jevu podobnému adaptivní odpovědí.
36
Obr. Adaptivní odpověď u osob vystavených znečištěnému ovzduší? I přes vysoké koncentrace škodlivin byla u osob
žijících na Ostravsku zjištěna změněná exprese u menšího počtu genů než u Pražanů. Výsledek naznačuje přizpůsobení organismu nepříznivým podmínkám životního prostředí.
Publikace:
Rossner P. Jr., Svecova V., Schmuczerova J., Milcova A., Tabashidze N., Topinka J., Pastorkova A., Sram R. J.: Analysis
of biomarkers in a Czech population exposed to heavy air pollution. Part I. Bulky DNA adducts. Mutagenesis 28 (1)
2013, 89-95. IF 3,500.
Rossner P. Jr., Rossnerova A., Spatova M., Beskid O., Uhlirova K., Libalova H., Solansky I., Topinka J., Sram R. J.: Analysis
of biomarkers in a Czech population exposed to heavy air pollution. Part II. Chromosomal aberrations and oxidative
stress. Mutagenesis 28 (1) 2013, 97-106. IF 3,500.
Laboratoř genetické toxikologie
Vedoucí: Ing. Jan Topinka, DrSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 763
Laboratoř se zabývá studiem mechanismů genotoxických i epigenetických účinků xenobiotik a oxidačním poškozením DNA, proteinů
a lipidů v buněčných kulturách (HepG2, lidské diploidní embryonální
fibroblasty a další). Studuje také vliv environmentálních polutantů
na mechanismy ovlivňující vznik a vývoj rakoviny prostaty.
Vědečtí pracovníci:
Ing. Jan Topinka, DrSc.
RNDr. Jana Schmuczerová, Ph.D.
Postgraduální student:
Mgr. Jitka Pavlíková
Odborný pracovník:
Mgr. Alena Milcová
37
Významný výsledek v roce 2013
Ultrajemné částice nejsou hlavním nositelem karcinogenních
PAU a jejich genotoxicity ve velikostně segregovaném aerosolu
Ultrajemná aerosolová frakce bývá považována za nejdůležitější nosič karcinogenních PAU, protože má nejvyšší
specifický povrch. Naše výsledky s ultrajemnou frakcí aerosolu navzorkovanou v různých lokalitách však prokazují,
že tato frakce není ani hlavním nosičem karcinogenních PAU ani hlavní induktor jejich genotoxicity. Tento výsledek
je významný pro posouzení toxicity ultrajemných částic, jež je v současnosti intenzívně diskutována.
Spolupráce: Přírodovědecká fakulta UK v Praze
Obr. Vztah mezi velikostí prachových částic v ovzduší a jejich
genotoxicitou.
Publikace:
Topinka J., Milcova A., Schmuczerova J., Krouzek J., Hovorka J.:
Ultrafine particles are not major
carriers of carcinogenic PAHs and
their genotoxicity in size-segregated aerosols. Mutation Res. 754
(2013) 1-6. IF 3,902.
Laboratoř genomiky
Vedoucí: RNDr. Pavel Rössner, Jr., Ph.D.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 763
Laboratoř je zaměřena na studium celogenomové i specifické genové
exprese, metylace DNA a stanovení jednonukleotidových polymorfismů
(SNPs) v lidském genomu s použitím čipových technologií s cílem
proniknout hlouběji do mechanismů toxického působení komplexních
směsí látek v životním prostředí.
Vědečtí pracovníci:
RNDr. Pavel Rössner, Jr., Ph.D.
Mgr. Helena Líbalová, Ph.D.
38
Postgraduální student:
Mgr. Antonín Ambrož
Odborný pracovník:
Mgr. Zuzana Nováková
Významný výsledek v roce 2013
Znečištěné ovzduší ovlivňuje metylační profily u dětské populace
Aktivita genů je významně ovlivňována jejich metylací. Na její nastavení má pro každého jedince vliv zejména expozice
negativním vlivům v prenatálním období. V naší studii jsme porovnávali rozložení 27 578 metylovaných míst u skupin
dětí z Ostravy a Prachaticka. Děti z Ostravy, kde koncentrace karcinogenního benzo[a]pyrenu (B[a]P) byla významně
vyšší, měly odlišné rozložení metylačních skupin, což ukazuje na odlišnou aktivitu genů v důsledku znečištění ovzduší.
Obr. Metylace genů u dětí z Ostravy je odlišná od dětí z Prachaticka.
Publikace:
Rossnerova A., Tulupova E., Tabashidze N., Schmuczerova J., Dostal M., Rossner P. Jr., Gmuender H., Sram R. J., Factors
affecting the 27K DNA methylation pattern in asthmatic and healthy children from locations with various environments, Mutat. Res. 741-742 (2013) 18-26. IF 3,902.
39
Oddělení teratologie
Vedoucí: doc. MUDr. Miroslav Peterka, DSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 604
Oddělení teratologie se zabývá vznikem vývojových vad u člověka
i na experimentálních modelech. Příčiny a mechanismy vzniku
vrozených vad jsou studovány pomocí dvou experimentálních
modelů (vyvíjející se kuřecí zárodek a vyvíjející se zuby u myši),
a pomocí klinicko-epidemiologických studií. Cílem je přispět
k poznatkům o normálním a abnormálním vývoji, etiopatogenezi
vývojových vad a o možnostech jejich prevence.
Laboratoř embryogeneze
Vedoucí: doc. MUDr. Miroslav Peterka, DSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 604
V klinicko-epidemiologických studiích sledujeme průběžně incidenci obličejových rozštěpů v české populaci,
a možné vyvolávající příčiny zjišťujeme z anamnestických údajů. Vytypované podezřelé faktory, především
léky používané v těhotenství, testujeme experimentálně. Testování je prováděno metodou CHEST na
vyvíjejícím se zárodku kuřete. Výsledky testů hodnotíme na základě letálního účinku, růstové retardace
a přítomnosti vývojových vad na kuřecím modelu.
Vědecký pracovník:
doc. MUDr. Miroslav Peterka, DSc.
Pregraduální student:
Bc. Klára Steklíková
Postgraduální studenti:
Mgr. Zuzana Pavlíková
Mgr. Natálie Hrozinková
Techničtí pracovníci:
Mgr. Petra Herlová
RNDr. Simona Vojtěchová
Šárka Dvořáková
Laboratoř odontogeneze
Vedoucí: MUDr. Renata Peterková, CSc .
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 232
Laboratoř je zaměřena na studium vývoje zubů za normálních, patologických
a experimentálních podmínek. Zjistili jsme, že při vývoji dentice se významně
uplatňují rudimentární zubní základy. Ačkoli tyto rudimenty později zanikají,
porucha jejich vývoje se může podílet na vzniku vrozených defektů dentice.
Objasnění vývoje a úlohy rudimentárních struktur v procesu odontogeneze
může přispět nejen k pochopení zubní evoluce, ale i k objasnění etiopatogeneze některých anomálií dentice. Např. pokud místo zániku rudimenty pokračují
ve vývoji, mohou dát vznik nadpočetným zubům. Z tohoto hlediska jsou zanikající/revitalizující rudimenty přirozeným modelem pro studium mechanismů inhibujících/stimulujících vývoj zubů a pro testování možností zubní regenerace.
Vědečtí pracovníci:
MUDr. Renata Peterková, CSc.
Mgr. Mária Hovořáková, Ph.D.
Mgr. Oldřich Zahradníček, Ph.D.
40
Postgraduální studenti:
Mgr. Kateřina Lochovská
Mgr. Lucie Smrčková
Mgr. Svatava Churavá-Lagronová
Techničtí pracovníci:
Ivana Koppová
Zdena Lisá
Ing. Lenka Jandová
Významný výsledek v roce 2013
Reinterpretace Shh signálních center během časného vývoje
myší dentice
Model vývoje zubu u myši patří k nejčastěji užívaným systémům při studiu regulačních mechanismů organogeneze a v poslední době je využíván především při vývoji metod zubního inženýrství a regenerace. Základním předpokladem pro získání spolehlivých závěrů vývojových studií na myším modelu odontogeneze je správná interpretace
morfologických a molekulárních dat.
Prokázali jsme, že první vyvíjející se struktura a s ní související exprese Shh v horní řezákové oblasti u myši nenáleží funkčnímu řezáku, jak se dosud předpokládalo, ale rudimentům zubů potlačených během evoluce (Hovořáková et al., 2013).
Obr. 1. A. Časný vývoj horní řezákové oblasti u myši. A. Dvě generace Shh expresních domén (zelená a žlutá), jejichž
postupné objevení je dokumentováno na hybridizované horní čelisti B.–D. a odpovídajících 3D rekonstrukcích zubního
a přilehlého ústního epitelu s vizualizovanou Shh expresí (červeně), E.–G. Dvě generace domén odpovídají dvěma generacím zubních primordií: První generace (zelená šipka) se objevuje vepředu a odpovídá rudimentárnímu primordiu.
Druhá generace (žlutá šipka) se objevuje vzadu a odpovídá signálnímu centru primordia funkčního řezáku.
Studie o vývoji horních řezáků u myši završila naši systematickou revizi klasických dat o myším modelu vývoje zubů,
která byla aktualizována ve shrnujícím článku (Peterková et al, v tisku). Prokázali jsme, že do 13. dne se u embryí myši
nevyskytují primordia funkčních zubů, jak se doposud předpokládalo, ale pouze rudimentární primordia zubů potlačených během evoluce. Až poté vznikají základy funkčních zubů. Vyvíjející se myší dentice obsahuje orgánová primordia,
která se zdárně vyvíjejí nebo zanikají. Studium jejího vývoje tedy umožňuje determinovat regulační faktory, které se
účastní stimulace růstu struktur a které růst brzdí. Takové informace budou využitelné na poli regenerativní medicíny.
41
Obr. 1. B. Korelace mezi signálními centry Shh a vyvíjejícími se zuby v dolní čelisti normálních myší.  – Shh hybridizace celé dolní čelisti myši na dni 12,5 embryonálního vývoje. Obdélníky – funkční zuby; kruhové a oválné tvary – Shh expresní
domény označující signální centra vyvíjejících se zubů. Klasická data: Podle literárních dat se Shh exprese vyskytuje do 14.
embryonálního dne ve dvou signálních centrech: přední odpovídá primordiu řezáku (I), zadní prvnímu moláru (M1). Nová
interpretace na základě shrnutí našich dosavadních výsledků: Shh exprese se objevuje ve více doménách podél předo-zadní
osy dolní čelisti. Dříve se objevující domény náleží rudimentárním zubním primordiím v oblasti řezáku (pt - zelená)
i tvářových zubů (MS – modrá; R2 – červená). Později se objevují primordia funkčních zubů a jejich signální centra: řezák
(I – žlutá), první molár (M1 – žlutá). Signální centra MS, R2 a M1 se objevují postupně směrem dozadu. Funkční M1 u dospělců
vzniká s přispěním R2 rudimentu (červený obdélník), a není vyloučeno i malé přispění rudimentu MS (modrý obdélník).
Publikace:
Hovorakova M., Smrckova L., Lesot H., Lochovska K., Peterka M., Peterkova R. Sequential Shh expression in the development of the mouse upper functional incisor. J Exp Zool B Mol Dev Evol. 320B: 455–464, 2013. IF 2,123.
Peterkova R., Hovorakova M., Peterka M., Lesot H. Three-dimensional analysis of the early development of the dentition. (Aust Dent J. – v tisku). IF 1,371.
42
Oddělení molekulární
biologie nádorů
Vedoucí: MUDr. Pavel Vodička, CSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 694
V oddělení jsou zkoumány molekulární charakteristiky nádorových onemocnění, především tlustého střeva a konečníku.
V rámci těchto studií pracujeme na molekulárně-epidemiologické úrovni s cílem identifikovat biologické ukazatele (I.)
zvýšené predispozice vůči nádorovému onemocnění, (II.) včasné
diagnostiky, (III.) individuální odpovědi na protinádorovou léčbu
(IV.) a nebo dlouhodobé prognózy. Zaměřujeme se především
na systém opravy DNA poškození. Tento rozsáhlý biologický proces
je zajištěn minimálně šesti víceméně samostanými dráhami a má
nezastupitelný význam pro udržení strukturální a funkční stability
DNA a tím zajišťuje prevenci nádorové transformace zdravé buňky.
Na druhé straně, aktivita opravy DNA poškození, se významně
uplatňuje rovněž při odpovědi nádorových buňek na působení
chemoterapeutik. Léčba některými nejčastěji používanými látkami
je založena na masivním poškození DNA s následnou buněčnou smrtí.
Vysoká aktivita opravných DNA mechanismů může přispět k rezistenci
nádorových buněk vůči takovým látkám. V oddělení pracujeme
s různými typy biologického materiálu od pacientů s nádorovým
onemocněním, jako jsou solidní tkáň, krevní buňky nebo plazma.
Jednotlivými výzkumnými záměry oddělení pak jsou:
• Vývoj a aplikace testů na funkční měření aktivity DNA opravných procesů v solidní tkáni
a v periferní krvi
• Genetická a epigenetická charakteristika genů zapojených do DNA opravných drah
v nádorové tkáni
• Stanovení DNA a chromozomálního poškození v nádorové tkáni
Vědečtí pracovníci:
MUDr. Pavel Vodička, CSc.
MUDr. Ludmila Vodičková, CSc.
Mgr. Jana Slyšková, Ph.D.
Ing. Veronika Poláková-Vymetálková, Ph.D.
RNDr. Miroslav Svoboda, Ph.D.
RNDr. Pavel Procházka, Ph.D.
Postgradualní studenti:
Mgr. Ludovít Bielik
Mgr. Kateřina Jirásková
Mgr. Alexandra Rejhová (mat. dovolená)
Mgr. Soňa Vodénková
Mgr. Linda Bartů
Mgr. Michal Kroupa
Spolupracovníci:
MUDr. Jiří Švec, Ph.D.
Ing. Peter Makovický, Ph.D.
prof. RNDr. Rudolf Štětina, CSc.
RNDr. Monika Burócziová, Ph.D.
43
Významné výsledky v roce 2013
1. Publikovali jsme souborný protokol technik pro stanovení
funkční aktivity dvou opravných drah – bázové a nukleotidové
excizní dráhy – s aplikací na různé typy výchozího biologického
materiálu
Substrát
Ro 19–8022 + světlo
anebo UV
Extrakt
anebo
Buněčná kultura
anebo
Lymfocyty
anebo
Buněčná kultura
Tkáň
Extrakce proteinů
Lymfocyty
Substrátové buňky
ukotvené v agaróze
Extrakt
Lyzační roztok
Reakce
Buněčná lýza
Substrát: nukleoidy
obsahující specifické DNA
poškození
ALKALICKÝ ROZTOK
ELEKTROFORÉZA
NEUTRALIZACE
BARVENÍ DNA
HODNOCENÍ KOMET
Obr. Schématické znázornění principu metody na měření aktivity DNA opravy.
Publikace:
Azqueta, A., Langie, S. A., Slyskova, J., Collins, A. R.: (2013) Measurement of DNA base and nucleotide excision repair
activities in mammalian cells and tissues using the comet assay - A methodological overview. DNA Repair (Amst). 12:
1007-1010. IF 4,274.
44
2. Vztah mezi vnímavostí pacientů se sporadickým karcinomem
tlustého střeva a konečníku na léčbu 5-fluorouracilem
Objevili jsme vztah mezi vnímavostí pacientů se sporadickým karcinomem tlustého střeva a konečníku na léčbu
5-fluorouracilem a jejich dlouhodobým přežíváním a genetickou variantou v genu DNA opravy, ležící v oblasti
vazby s regulační nekódující krátkou RNA. Tato genetická varianta může, po ověření nezávislou studií, představovat
prediktivní a prognostický marker pro sporadický karcinom tlustého střeva a konečníku.
SMUG1rs2233921 (codominant model)
1.0
SMUG1 (TT)
SMUG1 (GT)
SMUG1 (GG)
Survival
0.8
0.6
0.4
0.2
p=0.03
0.0
0 50 100150 200250300350
Months
SMUG1rs2233921 (dominant model)
1.0
SMUG1 (GG+GT)
SMUG1 (TT)
Survival
0.8
0.6
0.4
0.2
p=0.008
0.0
0 50 100150200250300350
Months
Obr. Kaplan-Meirova závislost celkového přežívání a variant v genu SMUG1 polymorfního místa rs2233921 v souvislosti s chemoterapií 5-fluorouracilem u pacientů s nádory tlustého střeva a konečníku.
Publikace:
Pardini B., Rosa F., Barone E., Di Gaetano C., Slyskova J., Novotny J., Levy M., Garritano S., Vodickova L., Buchler T., Gemignani F.,
Landi S., Vodicka P., Naccarati A.: (2013) Variation within 3‘ UTRs of base excision repair genes and response to therapy in
colorectal cancer patients: a potential modulation of microRNAs binding. Clin Cancer Res. 12(21): 6044-56. IF 7,837.
45
Oddělení mikroskopie
Vedoucí: RNDr. Jan Malínský, Ph.D.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 597
Výzkum oddělení je zaměřen na problematiku funkčních
mikrodomén plasmatické membrány. Pomocí moderních
metod fluorescenční a elektronové mikroskopie studujeme
zejména mechanismy formování, distribuci a dynamiku
těchto mikrodomén. Oddělení zároveň slouží jako metodická
základna pro ostatní pracoviště ústavu, školí nové uživatele
mikroskopů a poskytuje expertní servisní služby v oblasti
fluorescenční a elektronové mikroskopie.
Vědecký pracovník:
RNDr. Jan Malínský, Ph.D.
Postdoktorandský pracovník:
Mgr. Vendula Strádalová, Ph.D.
Postgraduální studenti:
Mgr. Aleš Efenberk
Mgr. Dagmar Folková (mat. dovolená)
Mgr. Katarína Vaškovičová
Techničtí pracovníci:
Ing. Tomáš Červinka
RNDr. Miroslava Opekarová, CSc.
Ing. Petra Veselá
Jitka Eisensteinová
Lenka Hlavínová (mat. dovolená)
Významné výsledky v roce 2013
1. Obsah sfingolipidů zásadním způsobem ovlivňuje
laterální doménové uspořádání plasmatické membrány
Pomocí fluorescenční spektroskopie jsme prokázali, že gelové mikrodomény v plasmatické membráně kvasinky S. cerevisiae se výrazně reorganizují v závislosti na obsahu sfingolipidů v membráně. Podíl těchto mikrodomén byl významně snížen v mutantu se zablokovanou biosyntézou sfingolipidů, stejné snížení nastalo po farmakologicky indukované
depleci sfingolipidů v kultuře divokého kmene kvasinek. Tento fenotyp bylo možno potlačit dodáním exogenního
prekursoru sfingolipidů dihydrosfingosinu. Naše data významně podporují hypotézu, že gelové laterální mikrodomény v plasmatické membráně kvasinek jsou tvořeny především sfingolipidy.
Spolupráce: MFF UK v Praze
Obr. Dva komplementární
pohledy na mikrodomény
v plasmatické membráně.
Konfokální fluorescenční obraz
integrálního membránového proteinu, který se akumuluje ve specifických laterálních mikrodoménách
plasmatické membrány kvasinek
A. Dvě charakteristické struktury
membránových mikrodomén visualizovaných pomocí elektronové
mikroskopie – žlábkové invaginace
kvasniční plasmatické membrány
(šipky) a proteolipidové shluky vykazující hexagonální symetrii hroty:
(B., C.) Měřítka: 5μm A. 500μm
46
Publikace:
Vecer J., Vesela P., Malinsky J., Herman P. Sphingolipid levels crucially modulate lateral microdomain organization of
plasma membrane in living yeast. FEBS Lett. 588(3):443-9. doi: 10.1016/j.febslet.2013.11.038. (2014). IF 3,538.
2. Membránové mikrodomény, rafty a detergentům odolné
membrány v buňkách opatřenými buněčnou stěnou
V přehledném článku jsme shrnuli dosavadní stav poznání doménového uspořádání plasmatické membrány.
Povětšinou byly imobilní mikrodomény v buňkách opatřených buněčnou stěnou přímo visualizovány. Tyto domény
se daří uvádět do kontextu s mezibuněčnými (symbiotickými či patogenními) interakcemi, membránovým transportem, stresem a polarizovaným růstem. Dosud publikovaná data podporují nejméně tři různé mechanismy formování
těchto mikrodomén.
Spolupráce: Department for Plant Biology, Carnegie Institution for Science, Stanford, CA, USA
Institute of Cell Biology and Plant Physiology, University of Regensburg, Germany; Mikrobiologický ústav AV ČR
Publikace:
Malinsky J., Opekarova M., Grossmann G, and Tanner W. Membrane Microdomains, Rafts, and Detergent-Resistant
Membranes in Plants and Fungi. Annu Rev Plant Biol 64:501–29 (2013). IF 25,962.
Obr. Stabilizace membránového kompartmentu Can1 (MCC) pomocí specifických proteinů. Velikost jednotlivých
mikrodomén MCC je určována eisosomem, cytosolickým proteinovým agregátem asociovaným s plasmatickou membránou.
Lineární eisosom je stabilizován specializovanými coil-coiled proteiny – Seg1 (S. cerevisiae) a Sle1 (S. pombe). Kvantitativní
morfologickou analýzou jsme porovnali průměrnou délku eisosomů v buňkách exprimujících samotný Seg1 v jedné nebo
dvou genových kopiích a buňkách exprimujících oba stabilizační proteiny Seg1 a Sle1. A. Pozorované buňky byly roztříděny
do tří kategorií: s krátkými (do 0,5μm; vlevo), prodlouženými (mezi 0,5 a 1,0μm; uprostřed) a dlouhými eisosomy (>1μm; vpravo). B. Změny v procentuálním zastoupení jednotlivých kategorií ve sledovaných buněčných liniích ukázaly, že efektivita Sle1
v procesu stabilizace eisosomu, vyjádřená jako průměrná délka MCC mikrodomén v buňce, je významně vyšší v porovnání
s jeho S. cerevisiae homologem Seg1. Signál: fluorescence SpPil1-mRFP. Měřítko: 5μm.
47
Oddělení transplantační
imunologie
Vedoucí: prof. RNDr. Vladimír Holáň, DrSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: + 420 241 063 226
Oddělení je zaměřeno především na studium buněčných
a molekulárních mechanismů specifické transplantační
imunity a na využití získaných poznatků pro regulace
imunitních reakcí. Cílem je zlepšení přežíváni geneticky
odlišných transplantátů buněk a tkání. Základní model
představují kultivované a cíleně diferenciované kmenové
buňky (mesenchymální, limbální), které jsou transplantovány
pomocí různých typů nanovlákenných nosičů za účelem
reparace těžkých poškození kůže, očního povrchu a deficience
limbálních kmenových buněk. Je využito široké spektrum
metod buněčné a molekulární biologie, jako jsou tkáňové
kultury, diferenciace kmenových buněk, studium regulace
genové exprese (PCR, real time PCR), produkce a detekce
cytokinů (ELISA, ELISPOT), průtoková cytometrie, MACS,
Western blotting, experimentální modely transplantace
kůže, oční rohovky, limbu a přenosy kmenových buněk.
Hlavním cílem je testování získaných poznatků v preklinic
kých modelech a jejich potenciální využití v klinické praxi
(především u pacientů s těžkými poraněními očního povrchu).
Vědečtí pracovníci:
prof. RNDr. Vladimír Holáň, DrSc.
RNDr. Alena Zajícová, CSc.
RNDr. Magdaléna Krulová, Ph.D.
Postgraduální studenti:
Mgr. Eliška Javorková
Ing. Milada Chudičková
Mgr. Peter Trošan
Mgr. Michaela Hájková
Pregraduální studenti:
Pavla Boháčová
Jan Kössl
Laboranti/technický personál:
Lucie Holáňová
Jaroslava Knížová
Významné výsledky v roce 2013
1. Regenerace těžce poškozeného povrchu oka pomocí
kmenových buněk
Limbální a mesenchymální kmenové buňky byly expandovány in vitro a pomocí nanovlákenných nosičů byly přeneseny na poškozený oční povrch v experimentálních modelech u myši a u králíka. Terapeutický účinek kmenových
buněk byl hodnocen histologicky a podle schopnosti kmenových buněk inhibovat expresi genů pro prozánětlivé
molekuly jako je IL-2, IFN-gama, IL-17 nebo iNOS. Výsledky ukázaly využitelnostl kmenových buněk a nanovlákenných
nosičů pro léčbu těžce poškozeného očního povrchu.
Spolupráce: Evropská oční klinika Lexum, Praha
48
A
Podpora růstu
progenitorových buněk
Migrace do místa
poškození
Tvorba regenerativního
mikroprostředí
(růstové a trofické faktory)
(VEGF, HGF, NGF)
Mezenchymální kmenové buňky
Antifibrotický
a antiapoptotický
účinek
Diferenciace v rohovkové
epiteliální buňky
Imunomodulace
(IDO, PGE2, TGF-β, iNOS, IL-6)
Obr. A. Schéma imunoregulačního a terapeutického působení mesenchymálních kmenových buněk. B. Růst kmenových buněk na nanovlákenném nosiči. C. Poškozené oko králíka pokryté nanovlákenným nosičem s kmenovými buňkami.
Publikace:
Holan, V., Javorkova, E.: (2013) Mesenchymal stem cells, nanofiber scaffolds and ocular surface reconstruction. Stem
Cells Rev. Rep. 9(5), 609-619. IF 4,523.
Cejkova J., Tosan P., Cejka C., Lencova A., Zajicova A., Javorkova E., Kubinova S., Sykova E., Holan V.: (2013) Suppression of
alkali-induced oxidative injury to the cornea by mesenchymal stem cells growing on nanofiber scaffolds and transferred
onto the damaged corneal surface. Exp. Eye Res. 116, 312-323. IF 3,026.
Holan, V., Javorkova, E., Trosan, P.: The growth and delivery of mesenchymal and limbal stem cells using copolymer
polyamide 6/12 nanofiber scaffolds. In: Wright, B. and Connon, C. J. (eds), Corneal Regenerative Medicine, Methods
Mol. Biol., Humana Press – Springer, New York, London 2013, S. 187-199. ISBN 978-1-62703-431-9.
49
2. Role cytokinů při diferenciaci a funkci regulačních T a B buněk
Bylo prokázáno, že odlišné cytokiny determinují vývoj a funkci regulačních T (Treg) a B (Breg) buněk. Zatímco
TGF-beta determinuje vývoj a zesiluje imunosupresivní funkce Treg, u B lymfocytů tento cytokin tlumí vývoj Breg
produkujících supresivní cytokin IL-10. Naproti tomu jiné dva cytokiny, IL-12 a IFN-gama, vývoj Breg silně zesilují.
Výsledky tak ukazují odlišné role cytokinů při vývoji Treg a Breg a naznačují možnosti jejich využití pro efektivnější
cílené regulace funkcí imunitního systému.
CD19
Spolupráce: Přírodovědecká fakulta UK, Praha
CD1d
1 2 34
(a)
(b)
CD5
CD22
120
100
(c)
(d)
(e)
(f )
Počet buněk
80
60
40
20
0
–
γ
S 2
1
β
LP IL–1 IL–2 FN– GF–
I
T
Obr. A. Charakterizace populací B lymfocytů pomocí průtokové cytometrie.
B. Detekce buněk produkujících interleukin-10 pomoci techniky ELISPOT.
Publikace:
Holan, V., Zajicova, A., Javorkova, E., Trosan, P., Chudickova, M., Pavlikova, M., Krulova, M.: (2013) Distinct cytokines balance the development of regulatory T cells and IL-10-producing regulatory B cells. Immunology. In press. IF 3,705.
Kubera M., Curzytek K., Duda W., Leskiewicz M., Basta-Kaim A., Budziszewska B., Roman A., Zajicova A., Holan V.,
Szczesny E., Lason W., Maes M.:. (2013) A new animal model of (chronic) depression induced by repeated and intermittent lipopolysaccharide administration for 4 months. Brain Behav. Immun. 31, 96-104. IF 5,612.
Holan, V., Krulova, M.: (2013) Common and small molecules as the ultimate regulatory and effector mediators of
antigen-specific transplantation reactions. World J. Transplant. 3(4), 54-61. Nový časopis, zatím bez IF.
50
Oddělení tkáňového
inženýrství
Vedoucí: prof. RNDr. Evžen Amler, CSc.
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 241 062 387
Oddělení je především zaměřeno na přípravu tkáňových
náhrad, tvorbu buněčných nosičů, především z biodegradabilních materiálů a na bázi nanovláken látky na
modelování proteinových struktur, ale také na vyhledávání
možností praktického využití výsledků. Pracoviště vyvíjí
technologii uvolňování bioaktivních látek s využitím
nanovlákenných nosičů obohacených o lipozomy, což
umožňuje řízený přísun živin a léků přímo do místa
defektu. Připravují se umělé chrupavčité a kostní náhrady
pro klinické využití v ortopedii a vyvíjejí se modifikované
chirurgické sítě pro reparaci incizionálních kýl.
Vědečtí pracovníci:
prof. RNDr. Evžen Amler, CSc.
Mgr. Eva Filová, Ph.D.
Mgr. Andrej Litvinec, Ph.D.
Mgr. Michala Rampichová, Ph.D.
Postgraduální studenti:
Mgr. Jana Benešová
Mgr. Dagmar Bezděková
Mgr. Matej Buzgo
Mgr. Věra Sovková
Mgr. Martin Královič
Mgr. Andrea Míčková
Mgr. Martin Plencner
Mgr. Eva Prosecká
MUDr. Bc. Karolína Vocetková
Mgr. Gracián Tejral
Pregraduální studenti:
Bc. Věra Lukášová
Bc. Barbora Kodedová
Bc. Barbora Jakubcová
Bc. Radek Stranka
Významné výsledky v roce 2013
1. Časově regulovatelný systém dodávání léčiv pro
biomedicínské použití založený na alfa granulích
inkorporovaných v koaxiálních nanovláknech
Alfa granule přinášejí nový zdroj přirozených růstových faktorů z krevních destiček. V posledních studiích se nám podařilo úspěšně zapouzdřit tyto alfa granule do koaxiálních nanovláken (nanovlákna typu jádro/plášť). Alfa granule přežily
proces elektrostatického zvlákňování. Bioaktivita růstových faktorů uvolňujících se ze zapouzdřených alfa granulí byla
prokázána in vitro na primárních buňkách chrupavčité tkáně (chondrocytech) a mezenchymálních kmenových buňkách.
Spolupráce: Ústav biofyziky, 2. LF UK v Praze
Oddělení mechaniky, Fakulta aplikovaných věd, Západočeská univerzita v Plzni
Textilní fakulta, Katedra netkaných textilií, Technická univerzita v Liberci
51
Obr. A.,B. Mikrofotografie alfa-granul enkapsulovaných v koaxiálních nanovláknech z polykaprolaktonu a polyvinyl
alkoholu pomocí rastrovací elektronové mikroskopie (FESEM).
Publikace:
Buzgo M., Jakubova R., Mickova A., Rampichova M., Prosecka E., Kochova P., Lukas D., Amler E.: (2012) Time-regulated
drug delivery system based on coaxially incorporated platelet alpha granules for biomedical use. NanomedicineUK. 8(7): 1137-1154. IF 5,26.
2. Bezbuněčný nanovlákenný kompozitní nosič pro
regeneraci osteochondrálních defektů miniprasete
Byl vyvinut nový systém pro dodávání léčiv založený na liposomech enkapsulovaných z polyvinylalkoholu (PVA)
nanovláken. Časová kontrola uvolňování insulinu a bFGF zlepšila viabilitu mesenchymálních kmenových buněk
in vitro. Bezbuněčné kompozitní nosiče složené z PVA nanovláken obohacených o liposomy, bFGF a insulin byly
implantovány do 7 osteochondrálních defektů v modelu miniprasete; kontrolní defekty nebyly léčeny. Bezbuněčný
kompozitní nosič zvýšil migraci buněk do defektu a jejich diferenciaci do chondrocytů. Nosič podpořil regeneraci
osteochondrálních defektů na modelu miniprasete.
Spolupráce: Fakulta biomedicínského inženýrství, ČVUT v Praze
Ústav biofyziky, 2. LF UK v Praze; Fyziologický ústav AV ČR, Praha
Ústav stavebníctva a architektúry SAV Bratislava; Textilní fakulta, Technická univerzita Liberec
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, Liběchov
Ústav histologie a embryologie, 2. LF UK v Praze; Student Science, s r.o.
Obr. Regenerace osteochondrálního defektu u miniprasete pomocí bezbuněčného gelu složeného z kolagenu typu I/hyaluronanu sodného/fibrinu, obsahující nanovlákna z polyvinylalkoholu obohacená o lipozomy a růstové faktory A. a neléčený defekt B.
Publikace:
Filová E., Rampichová M., Litvinec A., Držík M., Míčková A., Buzgo M., Košťáková E., Martinová L., Usvald D., Prosecká E.,
Uhlík J., Motlík J., Vajner L., Amler E. A cell-free nanofiber composite scaffold regenerated osteochondral defects in
miniature pigs. Int J Pharm. 2013 Apr 15;447(1-2):139-49. IF 3,458.
52
3. Nanovlákna typu jádro/plášť: nadějný systém pro tkáňové
inženýrství chrupavky
Alfa-granule krevních destiček jsou novým, přirozeným zdrojem růstových faktorů. Naše skupina v nedávné době
úspěšně inkorporovala alfa-granule do nanovláken typu jádro/plášť. Pomocí chondrocytů a mesenchymálních
kmenových buněk bylo prokázáno, že elektrostatické zvlákňování nenarušuje bioaktivitu uzavřených růstových
faktorů.
Spolupráce: Ústav biofyziky, 2. LF UK v Praze; Univerzitní centrum energeticky efektivních budov, Buštehrad
Obr. Koaxiální nanovlákna z polyvinyl alkoholu (jádro) a polykaprolaktonu (plášť) s inkorporovanými
alfa-granulemi značenými carboxyfluorescein succinimidyl esterom snímané konfokálním mikroskopem.
Publikace:
Amler E., Mickova A., Buzgo M. Electrospun core/shell nanofibers: a promising system for cartilage and tissue engineering? Nanomedicine (Lond). 2013 Apr;8(4):509-12. IF 5,26.
53
Oddělení technologického
transferu
Vedoucí: Ing. Petr Bažant, CSc., MBA
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 296 443 350
Oddělení monitoruje a vyhodnocuje výzvy k podávání
projektů v tuzemských i zahraničních programech
podpory v oblasti podnikání, základního i aplikovaného
výzkumu, inovací a vzdělávání. Ve vybraných případech
pak společně s výzkumnými odděleními ústavu
připravuje projektové žádosti, podílí se na realizaci
schválených projektů a připravuje periodické monitorovací
zprávy o průběhu projektů a jejich udržitelnosti.
Oddělení rozšířilo své služby do procesu komercializace, u nových poznatků zajišťuje
ochranu duševního vlastnictví, společně s Radou pro komercializaci vybírá a administruje
projektu typu proof-of-concept, které jsou následně financovány z Fondu pro komercializaci poznatků ÚEM. Letos oddělení připraví žádost do programu TA ČR GAMA.
Oddělení plní též roli projektové kanceláře, PMO. Jejím hlavním účelem je zvýšení úspěšnosti
v plnění plánu projektů, dále optimalizace ve využití zdrojů pro implementaci projektů,
plánování cash-flow pro finacování projektů a vede evidenci všech realizovaných projektů.
Projektový manažer EU fondů
Ing. Jan Prokšík
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 296 443 632
Dewarova nádoba – v parách tekutého dusíku jsou uloženy
retenční vzorky všech vyrobených šarží buněčných léčivých
přípravků.
Zařízení pro výrobu aqua purificata technologií inverzní
osmózy s 300 l tankem.
Práce v laminárním boxu v superčistých prostorách třídy B.
Nasazení buněk ke kultivaci do izolátoru.
54
Výzkumné centrum buněčné terapie
a tkáňových náhrad (VCBT)
V současnosti dochází v medicíně
k masivnímu rozvoji léčivých přípravků
pro moderní terapii (advanced
therapy medicinal products): jedná
se o léky obsahující živé buňky
(přípravky pro buněčnou terapii, resp.
somato-buněčnou léčbu a přípravky
tkáňového inženýrství), léky obsahující
genetickou informaci uloženou
v nukleových kyselinách (přípravky pro
genovou terapii) a léčebně využívané
nanotechnologické přípravky. Tyto
přípravky a metody slibují možnost
léčebně ovlivnit řadu onemocnění,
která jsou dnes považována za obtížně
léčitelná nebo zcela neléčitelná.
Mezi přípravky pro moderní terapii patří například kmenové buňky kostní dřeně pro léčbu autoimunitních onemocnění, autologní náhrady chrupavky, kostí, šlach a kůže připravené metodami buněčné terapie a tkáňového
inženýrství, virové vektory (geneticky modifikované viry, schopné vnést do buňky novou informaci) pro léčbu rakoviny prostaty, užití dospělých kmenových buněk pro léčbu degenerativních onemocnění a úrazů mozku a míchy,
využití indukovaných pluripotentních buněk z dospělých buněk pacienta, výzkum a diagnostické užití superparamagnetických nanočástic pro sledování chování buněk v živém organismu pomocí zobrazování magnetickou
rezonancí (MRI), hydrogelové tkáňové náhrady a kryty ran, apod.
V rámci Operačního programu Praha Konkurenceschopnost ústav vybudoval Výzkumné centrum buněčné terapie a tkáňových náhrad (VCBT) jako součást infrastruktury pro základní biomedicínský výzkum ve výše zmíněných
oborech moderní terapie.
Unikátní interdisciplinární výzkumné centrum je zaměřeno na léčivé přípravky pro moderní terapii,
zejména v těchto směrech:
Základní výzkum v oblasti přípravků buněčné terapie a tkáňových náhrad,
základní výzkum v oblasti nasazení nanotechnologií v léčebných postupech,
základní výzkum v oblasti bezpečnosti, efektivity a efektivnosti v obou výše uvedených oborech.
Výzkumné centrum bylo vybudováno jako dostavba budovy Inovačního biomedicínského centra ústavu v areálu
výzkumných ústavů AV ČR. Sousedství VCBT a IBC otevírá velké možnosti vzájemně výhodné spolupráce – podnikatelský inkubátor nabízí řadu služeb žádaných i VCBT (ochrana duševního vlastnictví, projektový management
a poradenství, vzdělávací akce v biomedicíně, apod.). VCBT synergicky využívá infrastruktury podnikatelského inkubátoru pro inovační MSP firmy zaměřené na výrobu v čistých prostorech, zejména pak zkušeností společnosti
Bioinova, s.r.o., která má povolení pro farmaceutickou výrobu v režimu Správné výrobní praxe. Společnost Bioinova,
s.r.o. jako člen klastru CzechBio s zprostředkovává vědcům kontakty na nejvýznamnější biotechnologické firmy
v ČR. Vědecké výstupy VCBT stimulují orientaci základního biomedicínského výzkumu a poznatky s potenciálem
komerčního využití mohou využít inovativní společnosti v IBC.
Pro provoz VCBT v letech 2014–2018 ústav získal projekt v rámci Národního programu udržitelnosti I. finanční podporu ve výši 22 mil. Kč.
55
Na základě trendů světového vývoje a naléhavé poptávky zdravotnického trhu po účinném a bezpečném použití metod buněčné terapie a tkáňových náhrad byly stanoveny interdisciplinární vědeckovýzkumné aktivity VCBT:
Cílené diferenciace kmenových buněk a jejich využití k regeneraci poškozeného povrchu oka a kůže,
Studium Regulace imunitní odpovědi po transplantaci kmenových buněk,
Příprava a charakterizace funkcionalizovaných nanovláken a mikrokapslí,
Biologická charakterizace nově vyvinutých pokročilých materiálů jako systému dodávání bioaktivních látek,
Vývoj biomateriálů pro regeneraci tkání,
Vývoj biofyzikálních metod pro medicínské aplikace.
Potřebné odborné složení VCBT pokrývá koncepce mezioborové spolupráce odborných týmů, které zahájily činnost v budově centra 1. ledna 2013.:
Pracoviště
Vedoucí
Oddělení tkáňového inženýrství
prof. RNDr. Evžen Amler, CSc.
Oddělení transplantační imunologie
prof. RNDr. Vladimír Holáň, DrSc.
Oddělení neurověd
prof. MUDr. Eva Syková, DrSc.
– Laboratoř biomateriálů a biofyzikálních metod
PharmDr. Šárka Kubinová, Ph.D.
– Laboratoř tkáňových kultur a kmenových buněk
RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
Pohled do laboratoří Výzkumného centra.
56
Inovační biomedicínské
centrum (IBC)
Vedoucí: Ing. Petr Bažant, CSc., MBA
E-mail: [email protected] | Tel.: +420 296 443 350
IBC napomáhá vzniku a úspěšnému rozběhu spin-off firem založených
na vědeckých výstupech Ústavu experimentální medicíny. IBC podporuje
spolupráci mezi firmami, výzkumnými pracovišti a investory.
Obr. Inovační biomedicínské centrum
(IBC) je situováno v těsné blízkosti
ústavu v Praze 4-Krči, v areálu biomedicínských ústavů Akademie věd ČR. Jeho
výstavba, která byla financována z fondů
EU a také částečně městem Praha, proběhla v letech 2007 až 2008.
Inovační biomedicínské centrum ÚEM je od roku 2008 členem
Společnosti vědeckotechnických parků ČR (www.svtp.cz)
Služby IBC pro inovační začínající firmy jsou orientovány
do tří, navzájem úzce spolupracujících směrů:
Podpora konkurenceschopnosti v biomedicíně – školení v oborech marketing, ochrana duševního vlastnictví,
organizace prodeje, management, finanční řízení, sestavení žádosti dotačních projektů, projektový management,
právní úkony spojené se založením společnosti, veřejné zakázky a asistence při zavedení systému Správní výrobní
praxe. Školení a koučing jsou uspořádány tak, aby začínající firmy překonaly nejčastější úskalí: špatně sestavený
business plán a model financování, špatně nastavené vztahy a smlouvy s investorem, špatný management firmy,
dodržování korporátních povinností ze zákona a nedostatečné ochrany duševního vlastnictví.
Podpora aplikovaného výzkumu v biomedicíně – certifikované služby v režimu Správné výrobní praxe: testy
sterility, výroba odběrových setů, rozplňování, separace a kultivace kmenových buněk apod.
Podnikatelský inkubátor pro spin-off společnosti – služby usídleným firmám: pronájem kanceláří a laboratoří,
správa počítačové sítě, řízení nákupu, patentové a daňové služby, skladové hospodářství, recepce, pošta, správa
a údržba nemovitosti, prezentace firem, vyhledání investorů a asistence při uzavírání smluv. V současné době je
podnikatelský inkubátor plně obsazen.
57
V současné době jsou v podnikatelském inkubátoru firmy:
Bioinova, s.r.o
VÝVOJ A VÝROBA LÉČIVÝCH PŘÍPRAVKŮ MODERNÍ MEDICÍNY
Společnost je zaměřena na vývoj a výrobu buněčných léčivých přípravků. V roce 2010 získala povolení k farmaceutické výrobě a v letech 2011 a 2013 úspěšně prošla periodickým auditem SÚKL. Bioinova v roce 2012 získala povolení
ke klinickému hodnocení bezpečnosti a účinnosti použití kmenových buněk z kostní dřeně pro léčbu amyotrofické
laterální sklerózy. V roce 2012 bylo z plánovaného počtu 10 léčeno prvních 9 pacientů, v roce 2013 to bylo dalších 10
pacientů a v roce 2014 počítáme s dalšími 10 pacienty. V roce 2012 byla schválena klinická studie ověřující bezpečnost
a účinnost kmenových buněk kostní dřeně při zpevnění operované rotátorové manžety, v roce 2013 byli operováni 3
pacienti, pro rok 2014 už počítáme se 13 pacienty. V roce 2013 SÚKL schválil klinické hodnocení pro navození synostózy obratlů, v témže roce byli ošetřeni 4 pacienti, pro rok 2014 počítáme s 8 pacienty. FN Hradec Králové je sponzorem
klinického hodnocení léčby defektů při reimplantaci endoprotézy kyčelního kloubu kmenovými buňkami, Bioinova je
zda smluvní zhotovitel, v roce 2013 vyrobila šarže pro 7 pacientů, se stejným počtem počítáme pro r. 2014.
Vedoucí skupiny kontroly kvality je RNDr. Kateřina Růžičková, Ph.D, vedoucí výroby je RNDr. Šimona LangkramerKonrádová a kvalifikovanou osobou je Ing. Ivana Drahorádová. V čistých prostorech pracují zkušené laborantky Jana
Tenkrátová a Jana Káclová.
Jednatel: Ing. Petr Bažant, CSc., MBA
E-mail: [email protected]
Tel.: +420 241 063 350
www.bioinova.cz
EponaCell, s.r.o.
VÝVOJ VETERINÁRNÍCH BUNĚČNÝCH PRODUKTŮ
Firma se specializuje na aplikaci metod založených na použití kmenových buněk ve veterinární medicíně, zejména
u koní a psů. Vybudovala si vlastní laboratorní zázemí s izolátorem pracujícím ve třídě čistoty A na pozadí kontrolované čistoty D. Firma se mimo jiné díky úspěšným tiskovým konferencím velmi rychle prosadila na trhu, má uzavřeny
smlouvy s důležitými hráči na trhu veterinární medicíny. EponaCell získala v roce 2012 povolení k výrobě veterinární
léčivých přípravků a certifikát výrobce v režimu Správné Výrobní Praxe. V loňském roce bylo léčeno více než 70 zvířecích pacientů. Ředitelem, vedoucím kontroly kvality a minoritním spolumajitelem firmy je Mgr. Daniel Bezděk. Vedoucí
výroby je Linda Fedorowiczová a vedoucí jištění kvality je RNDr. Lenka Řeháková. Firma má též svoji kvalifikovanou
osobu.
Ředitel: Mgr. Daniel Bezděk
E-mail: [email protected]
Tel.: +420 296 943 362
GSM: +420 774 223 233
www.eponacell.cz
58
Klinické projekty ÚEM AV ČR
Společně s Centrem diabetologie IKEM od roku 2008 spolupracuje ÚEM na experimentálním posouzení možností využití autologních kmenových buněk kostní dřeně a periferních kmenových (progenitorových) buněk v léčbě
ischemické choroby dolních končetin u pacientů se syndromem diabetické nohy. V rámci klinické studie bylo
dosud léčeno přes 20 pacientů s diabetem, u kterých byla diagnostikována ischemická choroba dolních končetin
se syndromem diabetické nohy.
ÚEM připravuje klinickou studii ověřující bezpečnost a účinnost intrathekálního podání autologních mesenchymálních
multipotentních buněk kostní dřeně v léčbě závažného poranění míchy (stupeň A, B nebo C podle ASIA klasifikace).
V roce 2012 byla schválena klinická studie AMSC-ALS-001 ověřující bezpečnost a účinnost intrathekálního podání autologních multipotentních kmenových buněk u pacientů s diagnózou Amyotrofické laterální sklerózy. Studie probíhá ve Fakultní nemocnici Motol, v roce 2013 bylo léčeno 10 pacientů, v roce 2014 počítáme
s dalšími 10.
V roce 2013 byla schválena klinická studie AMSC-RC-001, ověřující možnost využití autologních multipotentních kmenových buněk v ortopedii pro urychlení hojení při operaci rotátorové manžety. Studie probíhá
ve Fakultní nemocnici Motol, v témže roce byli ošetřeni 3 pacienti, pro rok 2014 počítáme se 13 pacienty.
Úspěšná in vitro a in vivo diferenciace autologních multipotentních kmenových buněk do kostních struktur vedla
k podání dvou klinických studií využívající tento mechanismus pro navození synostózy obratlů (AMSC-DSD-001),
případně pro hojení rozsáhlých defektů při reimplantaci endoprotézy kyčelního kloubu (AMSC-BDT-001). Obě
studie byly SÚKL schváleny. Sponzorem DSD studie je Bioinova, s.r.o., v roce 2013 byli léčeni 4 pacienti, v roce 2014
to bude dalších 8. Sponzorem studie BDT je FN Hradec Králové, Bioinova, s.r.o. je GMP zhotovitelem léčebných šarží,
v roce 2013 to bylo 7 pacientů, se stejným počtem počítáme v roce 2014.
59
Ocenění
prof. MUDr. Eva Syková, DrSc.
– obdržela Medaili Za zásluhy o stát v oblasti vědy
Profesorka Eva Syková, lékařka, vědkyně a politička, je ředitelkou Ústavu experimentální medicíny Akademie věd ČR od roku 2001. Je nositelkou četných cen a vyznamenání (Čestná oborová medaile J. E. Purkyně, 2003; Manažerka roku 2011) a zvolenou členkou Academia Europaea a Učené společnosti ČR. Věnuje se biomedicíně
– oboru neurovědy. Její specializací je výzkum mozku a v posledním desetiletí se
intenzivně zabývá výzkumem kmenových buněk. Je autorkou více než 600 publikací, 8447 citací a její h-index je 50. Rozvíjí a podporuje nově vznikající vědní obor
– regenerativní medicínu. Patří mezi nejvýznamnější české vědce, věnuje se vědní
politice a popularizaci vědy. V roce 2012 byla zvolena senátorkou Parlamentu ČR
jako nezávislá kandidátka za ČSSD.
Ocenění udělil Prezident republiky Miloš Zeman.
MUDr. Radim Šrám, DrSc.
– obdržel Čestnou oborovou medaili J.E.Purkyně za zásluhy v biomedicínských vědách
MUDr. Radim Šrám, DrSc., je mezinárodně uznávaným vědeckým
pracovníkem v oblasti genetické toxikologie, molekulární epidemiologie a studia vlivu znečištěného ovzduší na zdravotní stav
populace. Výsledky prokazují významné riziko znečištění ovzduší
karcinogenními PAU, které může při dlouhodobém působení nepříznivě ovlivnit zdravotní stav populace v příštích desetiletích.
Dr. Šrám je mezinárodně velmi aktivní, byl řešitelem 15 mezinárodních grantů – PHARE, EU, HEI (USA), NIEHS (USA), v letech
1993–1995 byl prezidentem European Environmental Mutagen
Society. Získal The EEMS Fritz Sobels Prize for 2000. V r. 2008 byl
oceněn Cenou ministra životního prostředí ČR a Cenou „Česká
hlava“. Je stále velmi aktivní ve své vědecké práci, publikoval více než 250 prací v časopisech s IF, které byly citovány
dle SCI 4450 krát, jeho h-index činí 39. Od r. 2001 je předsedou Komise pro životní prostředí AV ČR.
Ocenění udělil Předseda Akademie věd České republiky prof. Jiří Drahoš
Mgr. Dávid Džamba
– obdržel Cenu za nejlepší přednášku studentské konference 2. LF UK v Praze
Cena odborné komise za nejlepší přednášku a cena návštěvníků
konference na Vědecké konferenci 2. lékařské fakulty Univerzity
Karlovy.
Mgr. Dávid Džamba je studentem postgraduálního studia oboru Neurovědy na 2. LF UK v Praze. Pod vedením
Ing. Miroslavy Anděrové, CSc. se v ústavu zabývá především studiem glutamátových receptorů u gliových buněk, a to jak za fyziologických podmínek, tak i po ischemickém poškození mozku.
Přednáška, za kterou získal ocenění, shrnovala dosavadní výsledky
jeho práce.
Ocenění udělila 2. LF UK v Praze.
60
Národní výzkumné projekty
řešené v roce 2013
Zdroj/ Source: http://www.isvav.cz/prepareProjectForm.do, http://www.isvav.cz/organizationDetail.
do?rowId=ico%3A68378041
IAA500200917 AV ČR
Genetická a imunologická studie časných stádií kolorektálního adenokarcinomu: prostředí
zánětu na konvenčních vs germ free zvířecích modelech a na vzorcích z lidské tkáně
/ Genetics and immunity in early stages of colorectal adenocarcinoma: inflammatory
environment inconventional vs germ-free animal models, and in human samples
Příjemce: Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
Řešitel: MUDr. Luca Vannucci, Ph.D.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Spoluřešitel: MUDr. Pavel Vodička, CSc.
Období řešení projektu: 2009–2013 7E09088 MŠMT ČR
BIOactive highly porous and injectable Scaffolds controlling stem cell recruitment,
proliferation and differentiation and enabling angiogenesis for Cardiovascular
ENgineered Tissues
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: prof. RNDr. Amler Evžen, CSc.
Období řešení projektu: 2009–2013
GAP 108/10/1560 GA ČR
Nová generace reduktivně biodegradovatelných funkcionalizovaných matrix
pro tkáňové inženýrství nervového systému / New generation of reductively
biodegradable functionalized macroporous scaffolds for neural tissue engineering
Příjemce: Ústav molekulární chemie AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Ing. Martin Přádný, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
Období řešení projektu: 2010–2013
GAP 304/10/0320 GA ČR
Využití autologních mezenchymových buněk při posterolaterální fúzi
u degenerativních onemocnění páteře: preklinická a klinická studie / Utilization of
autologous mesenchymal cells in the posterolateral spinal fusion in the degenerative
spine diseases: preclinical and clinical trial
Příjemce: UK v Praze
Řešitel: prof. MUDr. Karel Štulík, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
Období řešení projektu: 2010–2013
GAP 304/10/0326 GA ČR
Aplikace autologních mezenchymových kmenových buněk při ošetření ruptury
rotátorové manžety: preklinická a klinická studie / Autologous mesenchymal stem
cells in rotator cuff repair enhancement – preclinical and prospective randomized
clinical study
Příjemce: UK v Praze
Řešitel: prof. MUDr. Tomáš Trč, CSc., MBA
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
Období řešení projektu: 2010–2013
61
GAP304/10/1286 GA ČR
Oprava DNA a sporadická forma rakoviny tlustého střeva a konečníku / DNA repair
and sporadic colorectal cancer
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Dr. Alessio Naccarati, Ph.D.
Období řešení projektu: 2010–2013
GAP304/11/1418 GA ČR
Diferenciace lidských embryonálních kmenových buněk do odontogenních linií /
Differentiation of human embryonic stem cells into odontogenic lineages
Příjemce: MU Brno, Lékařská fakulta
Řešitel: doc. MVDr. Aleš Hampl, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Období řešení projektu: 2011–2013
GPP304/11/P715 GA ČR
Epigenetické umlčení genů v kolorektálním karcinomu-potenciální biomarker časné
diagnózy a účinnosti chemoterapie / Epigenetic gene silencing in colorectal cancera potential biomarker for early diagnosis and efficacy of chemotherapy
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Ing. Veronika Poláková, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011– 2013
GPP304/11/P633 GA ČR
Regenerace axonů v transverzální míšní lézi po přemostění hydrogelem osázeným
mezenchymálními kmenovými buňkami / Axonal regeneration across a complete
spinal cord lesion bridged with hydrogels seeded with mesenchymal stem cells
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: MUDr. Aleš Hejčl, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011– 2013
GCP303/11/J005 GA ČR
Plastické změny neuronových sítí po ohlušení v raném období vývoje / Neural
remodeling after early sound exposures
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: prof. MUDr. Josef Syka, DrSc.
Období řešení projektu: 2011–2013
GAP503/11/0142 GA ČR
Genotoxické a negenotoxické mechanismy v toxicitě komplexních směsí
atmosferických polutantů: toxikogenomický přístup / Genotoxic and non-genotoxic
mechanisms involved in carcinogenicity of complex mixtures of air pollutants:
toxicogenomic approach
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Ing. Jan Topinka, DrSc.
Období řešení projektu: 2011–2013
GAP503/11/0084 GA ČR
Vliv polycyklických aromatických uhlovodíků a prachových částic na poškození
DNA a na mechanismy reparace DNA in vitro / The effect of polycyclic aromatic
hydrocarbons and particulate matter on DNA damage and DNA repair mechanisms in
vitro
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: RNDr. Pavel Rössner Jr., Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2013
62
GAP304/11/2373 GA ČR
Fyziologie signalizace vápníku u neurálních precursorů derivovaných z lidských
embryonálních kmenových buněk / The physiology of calcium signalling in human
embryonic stem cell-derived neuronal precursors
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Dr. Dayanithi Govindan, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2013
GAP304/11/0731 GA ČR
Léčba míšního poranění pomocí biomodifikovaných hydrogelů s orientovanou
porositou / Spinal cord injury repair using biomodified hydrogels with oriented
channels
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: PharmDr. Šárka Kubinová, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2013
GAP303/11/0192 GA ČR
Fyziologie vasopresinu a oxytocinu v komunikaci mezi neurony-gliovými buňkami,
vnímání bolesti, těhotenství a laktace / The physiology of vasopressin and oxytocin
signalling in neuron-glia interactions, nociception, pregnancy and lactation
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Dr. Dayanithi Govindan, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2013
GAP303/11/0131 GA ČR
Fyziologický význam a mechanismus ektopického uvolňování glycinu / Ectopic
release of glycine - physiological role and mechanism
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Ing. Michaela Králíková (Havlíčková), Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2013
GAP301/11/1568
Buněčné aspekty transplantační tolerance / Cellular aspects of transplantation
tolerance
Příjemce: IKEM, Praha
Řešitel: prof. MUDr. Ondřej Viklický, CSc. Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Spoluřešitel: prof. RNDr. Vladimír Holáň, DrSc.
Období řešení projektu: 2011–2014
GAP302/11/0146 GA ČR
Úloha proteinů obsahujících MARVEL doménu v geneticky kódované ochraně vůči
stresu / Role of MARVEL domain containing proteins in the geneticly encoded stress
protection
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: RNDr. Jan Malínský, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2014
GAP301/11/2418 GA ČR
Využití 13C a protonové MR spektroskopie pro sledování úlohy transportu a tkáňové
akumulace lipidů v patogenezi metabolického syndromu / Using 13C and proton MR
spectroscopy to study the role of fatty acid transport and accumulation in tissues in
the pathogenesis of insulin resistance
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: Mgr. Ivan Voříšek, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2014
63
GAP304/11/0653 GA ČR
Cílené diferenciace a transdiferenciace limbálních a mesenchymalních kmenových
buněk a jejich terapeutické využití v preklinických modelech / Targeted
differentiation and transdifferentiation of limbal and mesenchymal stem cells and
their therapeutic applications in preclinical models
Příjemce: Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Řešitel: prof. RNDr. Vladimír Holáň, DrSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
Období řešení projektu: 2011–2014
GAP304/11/0189 GA ČR
Kmenové buňky v léčbě amyotrofické laterální sklerózy / The use of stem cells in the
treatment of amyotrophic lateral sclerosis
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2014
P304/11/0184 GA ČR
Využití mesenchymových kmenových buněk v léčbě Alzheimerovy choroby / The
potential of mesenchymal stem cells in the treatment of Alzheimers
Příjemce: UK 2. LF
Řešitel: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Spoluřešitel: Dr. José Julio Rodríguez Arellano, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2014
GAP303/11/2378 GA ČR
Změny difúzních parametrů extracelulárního prostoru při rozvoji edému mozku a role
akvaporinových kanálů / Changes in the extracellular space diffusion parameters
during the development of brain edema and the role of aquaporin water-transporting
proteins
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Mgr. Ivan Voříšek, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2014
IGA MZ ČR: NT 12025–4
Molekulárně biologická a histopatologická charakteristika lymfocytů infiltrujících
tumorózní tkáň jako nástroj predikce rizika časné recidivy kolorektálního karcinomu
/ Molecular-biological and histopathological characteristics of tumor infiltrating
lymphocytes as instrument of prediction
of risk of early colorectal cancer recurrence
Příjemce: Univerzita Karlova v Praze, LF v Plzni
Řešitel: MUDr. Petr Novák
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Spoluřešitel: MUDr. Pavel Vodička, CSc.
Období řešení projektu: 2011–2014
IGA MZ ČR NT12459
Možnosti zachování sluchu u pacientů s vestibulárním schwanomem / Possibilities of
hearing preservation in patients with vestibular schwannoma
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: prof. MUDr. Josef Syka, DrSc.
Období řešení projektu: 2011–2015
64
FR-TI3/521 MPO
Technologie přípravy nových magnetických nanočástic pro diagnostiku a terapii
v onkologii / Technology of new magnetic nanoparticles for diagnostics and therapy
in oncology
Příjemce: Synpo, a.s.
Řešitel: Ing. Jiří Zelenka, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
Období řešení projektu: 2011–2015
P205/12/0720 GA ČR
Role membránového potenciálu v laterální organizaci mikrodomén plazmatické
membrány /
Role of membrane potential in the lateral microdomain organization of the plasma
membrane
Příjemce: UK v Praze
Řešitel: doc. RNDr. Petr Heřman, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: RNDr. Jan Malínský, Ph.D.
Období řešení projektu: 2012–2014
GAP303/12/0855 GA ČR
Polydendrocyty a regenerace ischemicky poškozeného mozku – úloha Wnt
signalizační dráhy / Polydendrocyte function in regeneration after ischemic brain
injury – the role of Wnt signaling pathway
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: Ing. Miroslava Anděrová, CSc.
Období řešení projektu: 2012–2015
GAP304/12/1370 GA ČR
Vliv superparamagnetických nanočástic na bázi oxidů železa na značení buněk,
genotoxicitu, cytotoxicitu a diferenciaci kmenových buněk / Superparamagnetic ironoxide nanoparticles for cellular imaging and their effect on genotoxicity, cytotocixity
and stem cell differentiation
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
Období řešení projektu: 2012–2015
IGA MZ ČR: NT13477
Užití syntetických biomateriálů k léčení rozsáhlých defektů skeletu při reimplantaci
totální endoprotézy kyčelního kloubu / The use of the synthetic biomaterials in the
treatment of the extensive skeletal defects in revision total hip arthroplasty
Příjemce: UK v Praze, Lékařská fakulta v Hradci Králové
Řešitel: prof. MUDr. Stanislav Filip, Ph.D.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA
Období řešení projektu: 2012–2015
LH12024 GA MSM
Stanovení molekulárních mechanismů účastnících se poranění míchy, regenerace,
buněčné terapie a léčby protizánětlivými faktory / Determining the molecular
aspects of spinal cord injury, regeneration, stem cell therapy and treatment with antiinflammatory compounds
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
Období řešení projektu: 2012–2015
65
GAP 304/12/1585 GA ČR
Molekulární charakter DNA opravy v nádorových tkáních karcinomu tlustého střeva
a konečníku / Molecular DNA repair characteristics in CRC tumor tissue
Příjemce: UK 1. LF
Řešitel: MUDr. Pavel Vodička, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: MUDr. Ludmila Vodičková, CSc.
Období řešení projektu: 2012–2015
IGA MZ ČR NT/13424
Studium miR137 a její proteinová i genová exprese v mucínech jako vodítko časné
diagnostiky CRC / MiR137 and its influence on the production of mucin as a potential
tool in early diagnosis of colorectal cancer or colorectal cancer relapse
Příjemce: Thomayerova nemocnice s poliklinikou, Praha
Řešitel: MUDr. Miroslav Levý, Ph.D.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Spoluřešitel: MUDr. Pavel Vodička, CSc.
Období řešení projektu: 2012–2015
IGA MZ ČR NT/13770
Vyšetření instability DNA gamet, embryí a somatických buněk u dysfertility
po úspěšné onkologické terapii ke zlepšení prognózy další reprodukce / Examination
of DNA instability in gametes, embyos and somatic cells following oncological
therapy for improvement of reproductive success in treated patients.
Příjemce: FN Motol v Praze
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: doc. MUDr. Milan Macek, CSc.
Spoluřešitel: RNDr. Božena Novotná, CSc.
Období řešení projektu: 2012–2015
GAP301/12/1734 GA ČR
Analýza významu genetických faktorů v riziku vzniku a prognóze karcinomu
pankreatu / Analysis of role of genetic factors in pancreatic cancer risk and prognosis
Příjemce: Státní zdravotní ústav, Praha
Řešitel: RNDr. Pavel Souček, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: RNDr. Pavel Procházka, Ph.D.
Období řešení projektu: 2012–2016
GAP303/12/0172 GA ČR
Studie vztahu mezi strukturou a imunosupresivní aktivitou pyrimidinových analogů
/ Structure-activity relationship (SAR) study of immunosuppressive effects of
pyrimidine analogues
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: RNDr. Zdeněk Zídek, DrSc.
Období řešení projektu: 2012–2016
P303/12/535 GA ČR
Mechanismy ovlivnění zánětu, metabolismu a farmakokinetiky léčiv komenzálními
a probiotickými bakteriemi / Mechanisms of the anti-inflammatory effects
of commensal and probiotic bacteria and their role in metabolism and drug
pharmacokinetics
Příjemce: Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Ing. Tomáš Hudcovic
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: doc. RNDr. Eva Kmoníčková, CSc.
Doba řešení projektu: 2012–2016
66
GAP305/12/1766 GA ČR
Rudimenty ve vývoji zubů u myšího modelu / Rudiments in the mouse model of tooth
development
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: Mgr. Mária Hovořáková, Ph.D.
Období řešení projektu: 2012–2016
GAP303/12/1347 GA ČR
Mechanismy zpracování komplexních zvuků v neuronových okruzích sluchového
systému / Mechanisms underlying complex sound processing in the neuronal
assemblies in the auditory system
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: prof. MUDr. Josef Syka, DrSc.
Období řešení projektu: 2012–2016
GAP304/12/1342 GA ČR
Patologické změny v centrálním sluchovém systému během stárnutí / Pathological
changes in the central auditory system accompanying aging
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: RNDr. Jiří Popelář, CSc.
Období řešení projektu: 2012–2016
P304/12/G069 GA ČR
Projekt excelence v oblasti neurověd / Project of excellence in the field of
neuroscience
Příjemce: Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
Řešitel: MUDr. Ladislav Vyklický Jr., DrSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: prof. MUDr. Josef Syka, DrSc.
Období řešení: 2012–2018
GAP503/12/G147 GA ČR
Centrum studií toxických vlastností nanočástic / Centre for studies on toxicity of
nanoparticles
Příjemce: Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Řešitel: RNDr. Miroslav Machala, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Spoluřešitel: Ing. Jan Topinka, DrSc.
Období řešení projektu: 2012–2019
TE01020028 TAČR – CENTRUM KOMPETENCE
Centrum vývoje originálních léčiv / Center for Development of Original Drugs
Hlavní příjemce: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Řešitel: RNDr. Zdeněk Havlas, DrSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: RNDr. Zdeněk Zídek, DrSc.
Období řešení: 2012–2019
IGA MZ ČR NT14056
Molekulární a genetické biomarkery v patogenesi a resistenci karcinomu ovaria /
Molecular and genetic biomarkers of ovarian cancer pathogenesis and resistance Příjemce: Státní zdravotní ústav, Praha
Řešitel: Mgr. Radka Václavíková, Ph.D.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: MUDr. Pavel Vodička, CSc.
Období řešení projektu: 2013–2015
67
IGA MZ ČR NT14102
Role B lymfocytů v imunitních reakcích po transplantaci ledviny / A role of B
lymphocytes in immune reactions after kidney transplantation
Příjemce: IKEM Praha, Praha
Spoluřešitel: prof. MUDr. Ondřej Viklický, CSc.
Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: prof. RNDr. Vladimír Holáň, DrSc.
Období řešení projektu: 2013–2015
IGA MZ ČR NT14329
Hodnocení významu změn molekulárně-biologických faktorů v prognóze
generalizace radikálně operovaného kolorektálního karcinomu / Evaluation of
changes of molecular-biologic factors and their importance in prognosis of relapsing
colorectal cancer after radical surgical treatment
Příjemce: UK v Praze, Lékařská fakulta v Plzni
Řešitel: MUDr. Václav Liška, Ph.D. Spolupříjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Spoluřešitel: MUDr. Pavel Vodička, CSc. Období řešení projektu: 2013–2015
LH13061 MSM
Vliv extraktu Ganoderma Lucidum na regulaci interakcí mezi NF-kB, DNA opravami
a proteosomy v kolorektální karcinogeneze / The role of Ganoderma Lucidum in the
regulation of NFkappaB-dependent DNA repair-proteasome interactions in colorectal
carcinogenesis
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Řešitel: MUDr. Pavel Vodička, CSc.
Období řešení projektu: 2013–2015
GA P503/13–01438S GA ČR
Mechanismy toxicity pevných emisí z biopaliv / Mechanisms of toxicity of biofuel
particulate emissions.
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Ing. Jan Topinka, DrSc.
Období řešení projektu: 2013–2015
GA P503/13–13458S GAČR
Dopady znečištění ovzduší na genom novorozenců / Impact of air pollution to
genome of newborns.
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: MUDr. Radim J. Šrám, DrSc.
Období řešení projektu: 2013–2016
GA13–00939S GA ČR
Léčba chronického míšního poranění pomocí kmenových buněk a enzymů
v kombinaci s polymerními nosiči / The treatment of chronic spinal cord injury using
stem cells and enzymes in combination with polymer scaffolds
Příjemce: Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Řešitel: RNDr. Pavla Jendelová, Ph.D.
Spolupříjemce: Univerzita Karlova v Praze, 2. Lékařská fakulta
Spoluřešitel: doc. MUDr. Lýdia Vargová, Ph.D.
Období řešení projektu: 2013–2016
68
Publikace za rok 2013
ODDĚLENÍ NEUROVĚD
Amemori, T., Romanyuk, N., Jendelová, P., Herynek, V., Turnovcová, K., Procházka, P., Kapcalová, M., Cocks, G.,
Price, J., Syková, E.: (2013) Human conditionally immortalized neural stem cells improve locomotor function after
spinal cord injury in the rat. Stem Cell Res. Ther. 4(3): 68.
IF 3.652
Babchenko, O., Romanyuk, N., Jendelová, P., Kromka, A.: (2013) Tailoring morphologies of diamond thin films for
neural stem cells culturing. Phys. Status Solidi B-Basic Solid State Phys. 250(12): 2717–2722.
IF 1.489
Cocks, G., Romanyuk, N., Amemori, T., Jendelová, P., Forostyak, O., Jeffries, A. R., Perfect, L., Thuret, S.,
Dayanithi, G., Syková, E., Price, J.: (2013) Conditionally immortalized stem cell lines from human spinal cord retain regional identity and generate functional V2a interneurons and motorneurons. Stem Cell Res. Ther. 4(3): 69.
IF 3.652
Čejka, Č., Rosina, J., Širc, J., Michálek, J., Brůnová, B., Čejková, J.: (2013) The reversibility of UV-B induced alterations in optical properties of the rabbit cornea depends on dose of UV irradiation. Photochem. Photobiol. 89(2):
474–482.
IF 2.287
Čejková, J., Trošan, P., Čejka, Č., Lencová, A., Zajícová, A., Javorková, E., Kubinová, Š., Syková, E., Holáň, V.:
(2013) Suppression of alkali-induced oxidative injury in the cornea by mesenchymal stem cells growing on nanofiber scaffolds and transferred onto the damaged corneal surface. Exp. Eye Res. 116: 312–323.
IF 3.026
Dmytrenko, L., Cicanič, M., Anděrová, M., Voříšek, I., Ottersen, O. P., Syková, E., Vargová, L.: (2013) The Impact
of Alpha-Syntrophin Deletion on the Changes in Tissue Structure and Extracellular Diffusion Associated with Cell
Swelling under Physiological and Pathological Conditions. PLoS One 8(7): e68044.
IF 3.730
Dubský, M., Jirkovská, A., Bém, R., Fejfarová, V., Varga, M., Kolesar, L., Pagacova, L., Syková, E., Jude, E. B.: (2013) Role
of serum levels of angiogenic cytokines in assessment of angiogenesis after stem cell therapy of diabetic patients
with critical limb ischemia. Cell Transplant. In press.
IF 4.422
Dubský, M., Jirkovská, A., Bém, R., Fejfarová, V., Pagacová, L., Sixta, B., Varga, M., Langkramer, S., Syková, E., Jude, E.
B.: (2013) Both autologous bone marrow mononuclear cell and peripheral blood progenitor cell therapies similarly improve ischemia in patients with diabetic foot in comparison with control treatment. Diabetes-Metab. Res. Rev.
29(5): 369–376.
IF 2.968
Forostyak, O., Romanyuk, N., Verkhratsky, A., Syková, E., Dayanithi, G.: (2013) Plasticity of Calcium Signalling
Cascades in Human Embryonic Stem Cell-Derived Neural Precursors. Stem Cells Dev. 22(10): 1506–1521.
IF 4.670
Forostyak, S., Jendelová, P., Syková, E.: (2013) The role of mesenchymal stromal cells in spinal cord injury, regenerative medicine and possible clinical applications. Biochimie 95(12): 2257–2270.
IF 3.142
Hejčl, A., Růžička, J., Kapcalová, M., Turnovcová, K., Krumbholcová, E., Přádný, M., Michálek, J., Cihlář, J.,
Jendelová, P., Syková, E.: (2013) Adjusting the chemical and physical properties of hydrogels leads to improved
stem cell survival and tissue ingrowth in spinal cord injury reconstruction: a comparative study of 4 methacrylate
hydrogels. Stem Cells Dev. 22(20): 2794-2805.
IF 4.670
Kubinová, Š., Horák, D., Hejčl, A., Plichta, Z., Kotek, J., Proks, V., Forostyak, S., Syková, E.: (2013) SIKVAV-modified highly superporous PHEMA scaffolds with oriented pores for spinal cord injury repair. J. Tissue Eng. Regen. Med. In press.
IF 2.826
Kubinová, Š., Horák, D., Vaněček, V., Plichta, Z., Proks, V., Syková, E.: (2013) The use of new surface-modified poly(2-hydroxyethyl methacrylate) hydrogels in tissue engineering: Treatment of the surface with fibronectin subunits
versus Ac-CGGASIKVAVS-OH, cysteine, and 2-mercaptoethanol modification. J. Biomed. Mater. Res. Part A. In press.
IF 2.834
69
Kulijewicz-Nawrot, M., Syková, E., Chvátal, A., Verkhratsky, A., Rodríguez, J. J.: (2013) Astrocytes and glutamate
homeostasis in Alzheimer’s disease: a decrease in glutamine synthetase but not in glutamate transporter-1 in the
prefrontal cortex. ASN Neuro. 5(4): 273–282.
IF 3.638
Kwon, B. K., Soril, L. J., Bacon, M., Beattie, M. S., Blesch, A., Bresnahan, J. C., Bunge, M., Dunlop, S., Fehlings, M. G.,
Ferguson, A. R., Hill, C., Karimi-Abdolrezaee, S., Lu, P., McDonald, J. W., Müller, H. W., Oudega, M., Rosenzweig, E. S.,
Reier, P. J., Syková, E., Xu, X. M., Guest, J., Tetzlaff, W.: (2013) Demonstrating Efficacy in Preclinical Studies of Cellular
Therapies for Spinal Cord Injury – How Much is Enough? Exp. Neurol. 248: 30–44.
IF 4.645
Mareková, D., Lesný, P., Jendelová, P, Michálek, J., Kostecká, P., Přádný, M., Martinová, L., Pantoflíček, T., Ryska,
M., Syková, E.: (2013) Hepatocyte growth on polycapronolactone and 2-hydroxyethylmethacrylate nanofiber
sheets enhanced by bone marrow-derived mesenchymal stromal cells. Hepato-gastroenterol. 60(125): 1156–1163.
IF 0.774
Pollert, E., Kašpar, P., Závěta, K., Herynek, V., Burian, M., Jendelová, P.: (2013) Magnetic Nanoparticles for Therapy
and Diagnostics. IEEE Trans. Magn. 49 (1): 7–10.
IF 1.422
Růžička, J., Romanyuk, N., Hejčl, A., Vetrík, M., Hrubý, M., Cocks, G., Cihlář, J., Přádný, M., Price, J., Syková, E.,
Jendelová, P.: (2013) Treating spinal cord injury in rats with a combination of human fetal neural stem cells and
hydrogels modified with serotonin. Acta Neurobiol. Exp. 73(1): 102–115.
IF 1.977
Sundstrøm, T., Daphu, I., Wendelbo, I., Hodneland, E., Lundervold, A., Immervoll, H., Skaftnesmo, K. O., Babič,
M., Jendelová, P., Syková, E., Lund-Johansen, M., Bjerkvig, R., Thorsen, F.: (2013) Automated tracking of nanoparticle-labeled melanoma cells improves the predictive power of a brain metastasis model. Cancer Res. 73(8):
2445–2456.
IF 8.650
Vaněček, V., Klíma, K., Kohout, A., Foltán, R., Jiroušek, O., Šedý, J., Štulík, J., Syková, E., Jendelová, P.: (2013) The
combination of mesenchymal stem cells and a bone scaffold in the treatment of vertebral body defects. Eur. Spine
J. 22(12): 2777–2786.
IF 2.133
Zablotskyy, V., Dejneka, A., Kubinová, Š., Le-Roy, D., Dumas-Bouchiat, F., Givord, D., Dempsey, N. M., Syková, E.:
(2013) Life on magnets: stem cell networking on micro-magnet arrays. PLoS One 8(8): e70416.
IF 3.730
ODDĚLENÍ NEUROFYZIOLOGIE SLUCHU
Bureš, Z., Maršálek, P.: (2013) On the precision of neural computation with interaural level differences in the lateral superior olive. Brain Res. 1536: 16–26.
IF 2.879
Groh, D., Seeman, P., Jilek, M., Popelář, J., Kabelka, Z., Syka, J.: (2013) Hearing function in heterozygous carriers
of a pathogenic GJB2 gene mutation. Physiol. Res. 62(3): 323–330.
IF 1.531
Chovanec, M., Zvěřina, E., Profant, O., Skřivan, J., Čakrt, O., Lisý, J., Betka, J.: (2013) Impact of video-endoscopy on
the results of retrosigmoid-transmeatal microsurgery of vestibular schwannoma: prospective study. Eur. Arch. OtoRhino-Laryn. 270(4): 1277–1284.
IF 1.458
Popelář, J., Rybalko, N., Burianová, J., Schwaller, B., Syka J.: (2013) The effect of parvalbumin deficiency on the
acoustic startle response and prepulse inhibition in mice. Neurosci. Lett. 533: 216–220.
IF 2.026
Profant, O., Burianová, J., Syka, J.: (2013) The response properties of neurons in different fields of the auditory
cortex in the rat. Hear. Res. 296: 51–59.
IF 2.537
Profant, O., Balogová, Z., Dezortová, M., Wagnerová, D., Hájek, M., Syka, J.: (2013) Metabolic changes in the auditory cortex in presbycusis demonstrated by MR spectroscopy. Exp. Gerontol. 48(8): 795–800.
IF 3.911
70
Šuta, D., Popelář, J., Burianová, J., Syka, J.: (2013) Cortical representation of species-specific vocalizations in
Guinea pig. PLoS One 8(6): e65432.
IF 3.730
Tomek, J., Novák, O., Syka, J.: (2013) Two-Photon Processor and SeNeCA – A freely available software package to
process data from two-photon calcium imaging at speeds down to several ms per frame. J. Neurophysiol. 110(1):
243–256.
IF 3.301
Wang, T., Rusu, S. I., Hrušková, B., Tureček, R., Borst, J. G.: (2013) Modulation of synaptic depression of the calyx of
Held synapse by GABAB receptors and spontaneous activity. J. Physiol. (Lond.) 591(19): 4877–4894.
IF 4.380
ODDĚLENÍ BUNĚČNÉ NEUROFYZIOLOGIE
Dmytrenko, L., Cicanič, M., Anděrová, M., Voříšek, I., Ottersen, O. P., Syková, E., Vargová, L.: (2013) The Impact
of Alpha-Syntrophin Deletion on the Changes in Tissue Structure and Extracellular Diffusion Associated with Cell
Swelling under Physiological and Pathological Conditions. PLoS One 8(7): e68044.
IF 3.730
Džamba, D., Honsa, P., Anděrová, M.: (2013) NMDA Receptors in Glial Cells: Pending Questions. Curr.
Neuropharmacol. 11(3): 250–262.
IF 2.031
Honsa, P., Pivoňková, H., Anděrová, M.: (2013) Focal cerebral ischemia induces the neurogenic potential of
mouse Dach1-expressing cells in the dorsal part of the lateral ventricles. Neuroscience 240: 39–53.
IF 3.122
Minieri, L., Pivoňková, H., Caprini, M., Harantová, L., Anděrová, M., Ferroni, S.: (2013) The inhibitor of volume-regulated anion channels DCPIB activates TREK potassium channels in cultured astrocytes. Br. J. Pharmacol. 168(5):
1240–1254.
IF 5.067
Rusňáková, V., Honsa, P., Džamba, D., Stählberg, A., Kubista, M., Anděrová, M.: (2013) Heterogeneity of
Astrocytes: From Development to Injury – Single Cell Gene Expression. PLoS One 8(8): e69734.
IF 3.730
Stählberg, A., Rusňáková, V., Forootan, A., Anděrová, M., Kubista, M.: (2013) RT-qPCR work-flow for single-cell data
analysis. Methods 59(1): 80–88.
IF 3.641
ODDĚLENÍ MOLEKULÁRNÍ NEUROFYZIOLOGIE
Cocks, G., Romanyuk, N., Amemori, T., Jendelová, P., Forostyak, O., Jeffries, A. R., Perfect, L., Thuret, S.,
Dayanithi, G., Syková, E., Price, J.: (2013) Conditionally immortalized stem cell lines from human spinal cord retain regional identity and generate functional V2a interneurons and motorneurons. Stem Cell Res. Ther. 4(3): 69.
IF 3.652
Forostyak, O., Romanyuk, N., Verkhratsky, A., Syková, E., Dayanithi, G.: (2013) Plasticity of Calcium Signalling
Cascades in Human Embryonic Stem Cell-Derived Neural Precursors. Stem Cells Dev. 22(10): 1506–1521.
IF 4.670
ODDĚLENÍ FARMAKOLOGIE
Harmatha, J., Buděšínský, M., Vokáč, K., Kostecká, P., Kmoníčková, E., Zídek, Z.: (2013) Trilobolide and related
sesquiterpene lactones from Laser trilobum possessing immunobiological properties. Fitoterapia 89: 157–166.
IF 2.231
Kmoníčková, E., Dusilová, A., Kostecká, P., Kverka, M., Zídek, Z.: (2013) Activation of NO and cytokines by low-molecular weight fractions of lysates from G+ and G- bacteria. Biomed. Pap-Olomouc 157(Suppl.1): S51-S55.
IF 0.990
Štětinová, V., Smetanová, L., Kholová, D., Květina, J., Svoboda, Z., Zídek, Z., Tlaskalová-Hogenová, H.: (2013) The
effect of probiotic Escherichia coli strain Nissle 1917 lipopolysaccharide on the 5-aminosalicylic acid transepithelial transport across Caco-2 cell monolayers. Gen. Physiol. Biophys. 32(3): 371–380.
IF 0.852
71
Zhang, D., Li, S. B., Yang, L., Li, Y. J., Zhu, X. X., Kmoníčková, E., Zídek, Z., Fu, M. H., Fang, J.: (2013) Two new C-methyl
flavanones from the rhizomes and frond bases of Matteuccia struthiopteris. J. Asian Nat. Prod. Res. 15(11): 1163–1167.
IF 0.948
Zídek, Z., Kmoníčková, E., Kostecká, P., Jansa, P.: (2013) Microfiltration method of removal of bacterial contaminants and their monitoring by nitric oxide and Limulus assays. Nitric Oxide-Biol. Chem. 28: 1–7.
IF 3.265
Zhu, X. X., Yang, L., Li, Y. J., Zhang, D., Chen, Y., Kmoníčková, E., Weng, X. G., Yang, Q., Zídek, Z.: (2013) Divergent
immunomodulatory effects of extracts and phenolic compounds from the fern Osmunda Japonica Thunb. Chin. J.
Integr. Med. 19(10): 761–770.
IF 1.059
Zhu, X. X., Yang, L., Li, Y. J., Zhang, D., Chen, Y., Kostecká, P., Kmoníčková, E., Zídek, Z.: (2013) Effects of sesquiterpene, flavonoid and coumarin types of compounds from Artemisia annua L. on production of mediators of
angiogenesis. Pharmacol. Rep. 65(2): 410–420.
IF 1.965
ODDĚLENÍ GENETICKÉ EKOTOXIKOLOGIE
Barregard, L., Moller, P., Henriksen, T., Mistry, V., Koppen, G., Rössner, P. Jr., Šrám, R., Weimann, A., Poulsen, H.,
Nataf, R., Andreolli, R., Manini, P., Marczylo, T. H., Lam, P., Evans, M. D., Kasai, H., Kawai, K., Li, Y. S., Sakai, K., Singh, R.,
Teichert, F., Farmer, P., Rozalski, R., Gackowski, D., Siomek, A., Saez, G., Cerda, C., Broberg, K., Lund, C., Hossain, M.,
Haghdoost, S., Hu, C. W., Chao, M. R., Wu, K. Y., Senduran, N., Orhan, H., Smith, R. J., Santella, R., Su, Y., Cortez, C., Yeh,
S., Olinski, R., Loft, S., Cooke, M.S.: (2013) Human and methodological sources of variability in the measurement of
urinary 8-oxo-7,8-dihydro-2’-deoxyguanosine. Antioxid. Redox Signal. 18(18): 2377–2391.
IF 7.189
Bousquet, J., Anto, J., Sunyer, J., Nieuwenhuijsen, M., Vrijheid, M., Keil, T., MeDALL Study Group., CHICOS Study
Group., ENRIECO Study Group (Šrám, R., ) GA2 LEN Study Group.: (2013) Pooling birth cohorts in allergy and
asthma: European Union-funded initiatives - a MeDALL, CHICOS, ENRIECO, and GA²LEN joint paper. Int. Arch.
Allergy. Immunol. 161(1): 1–10.
IF 2.248
Fenech, M., Kirsch-Volders, M., Rössnerová, A., Šrám, R., Romm, H., Bolognesi, C., Ramakumar, A., Soussaline, F.,
Schunck, C., Elhajouji, A., Anwar, W., Bonassi, S.: (2013) HUMN project initiative and review of validation, quality
control and prospects for further development of automated micronucleus assays using image cytometry systems. Int. J. Hyg. Environ. Health. 216(5): 541–552.
IF 3.045
Dostál, M., Pastorková, A., Rychlík, S., Rychlíkova, E., Švecová, V., Schallerová, E., Šrám, R.: (2013) Comparison of
child morbidity in regions of Ostrava, Czech Republic, with different degrees of pollution: a retrospective cohort
study. Environ. Health 12(1): 74.
IF 2.714
Ghosh, R., Topinka, J., Joad, J. P., Dostál, M., Šrám, R., Hertz-Picciotto, I.: (2013) Air pollutants, genes and early
childhood acute bronchitis. Mutat. Res.-Fundam. Mol. Mech. Mutagen. 749(1–2): 80–86.
IF 3.902
Hyánková, L., Novotná, B.: (2013) Divergent selection for shape of growth curve in Japanese quail: 7. Effect of
egg storage at high temperature on embryo development and hatchability. Br. Poult. Sci. 54(6): 695–703.
IF 1.147
Larsen, P. S., Kamper-Jørgensen, M., Adamson, A., Barros, H., Bonde, J. P., Brescianini, S., Brophy, S., Casas, M.,
Devereux, G., Eggesbø, M., Fantini, M. P., Frey, U., Gehring, U., Grazuleviciene, R., Henriksen, T. B., Hertz-Picciotto, I.,
Heude, B., Hryhorczuk, D. O., Inskip, H., Jaddoe, V. W., Lawlor, D. A., Ludvigsson, J., Kelleher, C., Kiess, W., Koletzko,
B., Kuehni, C. E., Kull, I., Kyhl, H. B., Magnus, P., Momas, I., Murray, D., Pekkanen, J., Polanska, K., Porta, D., Poulsen,
G., Richiardi, L., Roeleveld, N., Skovgaard, A. M., Šrám, R., Strandberg-Larsen, K., Thijs, C., Van Eijsden, M., Wright, J.,
Vrijheid, M., Andersen, A. M.: (2013) Pregnancy and birth cohort resources in europe: a large opportunity for aetiological child health research. Paediatr. Perinat. Epidemiol. 27(5): 505.
IF 2.157
Pauk, N., Klimešová, S., Kára, J., Topinka, J., Lábaj, J.: (2013) The relevance of monitoring of antibodies against the
polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) and PAH-DNA adducts in serum in relation to lung cancer and chronic
obstructive pulmonary disease (COPD). Neoplasma 60(2): 182–187.
IF 1.574
72
Rössner, P. Jr., Mistry, V., Singh, R., Šrám, R., Cooke, M. S.: (2013) Urinary 8-oxo-7,8-dihydro-2’-deoxyguanosine
values determined by a modified ELISA improves agreement with HPLC-MS/MS. Biochem. Biophys. Res. Commun.
440(4): 725–730.
IF 2.406
Rössner, P. Jr., Švecová,. V., Schmuczerová, J., Milcová, A., Tabashidze, N., Topinka, J., Pastorková, A., Šrám,
R.: (2013) Analysis of biomarkers in a Czech population exposed to heavy air pollution. Part I. Bulky DNA adducts.
Mutagenesis 28(1): 89–95.
IF 3.500
Rössner, P. Jr., Rössnerová, A., Špátová, M., Beskid, O., Uhlířová, K., Líbalová, H., Solanský, I., Topinka,
J., Šrám, R.: (2013) Analysis of biomarkers in a Czech population exposed to heavy air pollution. Part II.
Chromosomal aberrations and oxidative stress. Mutagenesis 28(1): 97–106.
IF 3.500
Rössner, P. Jr., Mrhálková, A , Uhlířová, K., Špátová, M., Rössnerová, A., Líbalová, H., Schmuczerová, J.,
Milcová, A., Topinka. J., Šrám, R.: (2013) Nucleotide excision repair is not induced in human embryonic lung
fibroblasts treated with environmental pollutants. PLoS One 8(7): e69197.
IF 3.730
Rössnerová, A., Tulupová, E., Tabashidze, N., Schmuczerová, J., Dostál, M., Rössner, P. Jr., Gmuender, H.,
Šrám, R.: (2013) Factors affecting the 27K DNA methylation pattern in asthmatic and healthy children from locations with various environments. Mutat. Res.-Fundam. Mol. Mech. Mutagen. 741–742: 18–26.
IF 3.902
Sedmíková, M., Petr, J., Dörflerová, A., Nevoral, J., Novotná, B., Krejčová, T., Chmelíková, E., Tůmová, L.: (2013) Inhibition
of c-Jun N-terminal kinase (JNK) suppresses porcine oocyte ageing in vitro. Czech J. Anim. Sci., 58(12): 535–545.
IF 0.922
Slama, R., Bottagisi, S., Solanský, I., Lepeule, J., Giorgis-Allemans, L., Šrám, R.: (2013) Short-term impact of atmospheric pollution on fecundability. Epidemiology 24(6): 871–879.
IF 5.738
Šmerdová, L., Neča, J., Svobodová, J., Topinka, J., Schmuczerová, J., Kozubík, A., Machala, M., Vondráček, J.: (2013)
Inflammatory mediators accelerate metabolism of benzo[a]pyrene in rat alveolar type II cells: the role of enhanced cytochrome P450 1B1 expression. Toxicology 314: 30–38.
IF 4.017
Švecová, V., Topinka, J., Solanský, I., Rössner, P. Jr., Šrám, R.: (2013) Personal exposure to carcinogenic polycyclic aromatic hydrocarbons in the Czech Republic. J. Expos. Sci. Environ. Epidemiol. 23(4): 350–355.
IF 3.187
Šrám, R., Binková, B., Dostál, M., Merkerová-Dostalová, M., Líbalová, H., Milcová, A., Rössner, P. Jr.,
Rössnerová, A., Schmuczerová, J., Švecová, V., Topinka, J., Votavová, H.: (2013) Health impact of air pollution
to children. Int. J. Hyg. Environ. Health. 216(5): 533–540.
IF 3.045
Topinka, J., Milcová, A., Schmuczerová, J., Kroužek, J., Hovorka, J.: (2013) Ultrafine particles are not major carriers of carcinogenic PAHs and their genotoxicity in size-segregated aerosols. Mutat. Res. Genet. Toxicol. Environ.
Mutagen. 754(1–2): 1–6.
IF 2.220
Yauk, C. L., Bishop, J., Dearfield, K. L., Douglas, G. R., Hales, B. F., Luijten, M., O´Brien, J. M., Robaire, B., Šrám, R., van
Bethem, J., Wade, M. G., White, P. A. Marchetti, F.: (2013) The development of adverse outcome pathways for mutagenic effects for the organization for economic co-operation and development. Environ. Mol. Mutagen. 54(2): 79–81.
IF 3.708
ODDĚLENÍ TERATOLOGIE
Buchtová, M., Zahradníček, O., Balková, S., Tucker, A. S.: (2013) Odontogenesis in the Veiled Chameleon
(Chamaeleo calyptratus). Arch. Oral Biol. 58(2): 118–133.
IF 1.549
Hovořáková, M., Smrčková, L., Lesot, H., Lochovská, K., Peterka, M., Peterková, R.: (2013) Sequential Shh expression in the development of the mouse upper functional incisor. J. Exp. Zool. Part B. 320(7): 455-464.
IF 2.123
73
Khonsari, R. H., Seppala, M., Pradel, A., Dutel, H., Clément, G., Lebedev, O., Ghafoor, S., Rothová, M., Tucker, A.,
Maisey, J. G., Fan, C. M., Ohazama, A., Tafforeau, P., Franco, B., Helms, J., Haycraft, C. J., David, A., Janvier, P., Cobourne,
M. T., Sharpe, P.T.: (2013) The buccohypophyseal canal is an ancestral vertebrate trait maintained by modulation in
sonic hedgehog signaling. BMC Biol. 11: 27.
IF 6.531
Klein, O. D., Oberoi, S., Huysseune, A., Hovořáková, M., Peterka, M., Peterková, R.: (2013) Developmental disorders of the dentition: An update. Am. J. Med. Genet. C. 163(4): 318–332.
IF 4.440
Lagronová-Churavá, S., Špoutil, F., Vojtěchová, S., Lesot, H., Peterka, M., Klein, O. D., Peterková, R.: (2013) The
Dynamics of Supernumerary Tooth Development Are Differentially Regulated by Sprouty Genes. J. Exp. Zool. Part
B. 320(5): 307–320.
IF 2.123
Nakatomi, M., Hovořáková, M., Gritli-Linde, A., Blair, H., MacArthur, K., Peterka, M., Lesot, H., Peterková, R., RuizPerez, V. L., Goodship, J., Peters, H.: (2013) Evc regulates a symmetric response to Shh signaling in molar development. J. Dent. Res. 92(3): 222–228.
IF 3.826
Rusková, H., Bejdová, S., Peterka, M., Krajíček, V., Velemínská, J.: (2013) 3-D shape analysis of palatal surface in patients with unilateral complete cleft lip and palate. J. Craniofac. Surg. In press.
IF 0.686
ODDĚLENÍ MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE NÁDORŮ
Azqueta, A., Langie, S. A., Slyšková, J., Collins, A. R.: (2013) Measurement of DNA base and nucleotide excision
repair activities in mammalian cells and tissues using the comet assay – A methodological overview. DNA Repair
(Amst) 12(11): 1007–1010.
IF 4.274
Campa, D., Rizzato, C., Capurso, G., Giese, N., Funel, N., Greenhalf, W., Souček, P., Gazouli, M., Pezzilli, R, Pasquali, C., TalarWojnarowska, R., Cantore, M., Andriulli, A., Scarpa, A., Jamroziak, K., Delle Fave, G. D., Costello, E., Khaw, K. T., Heller, A., Key,
T. J., Theodoropoulos, G., Malecka-Panas, E., Mambrini, A., Bambi, F., Land, S., Pedrazzoli, S., Bassi, C., Pacetti, P., Piepoli, A.,
Tavano, F., di Sebastiano, P., Vodičková, L., Basso, D., Plebani, M., Fogar, P., Büchler, M. W., Bugert, P., Vodička, P., Boggi, U.,
Neoptolemos, J. P., Werner, J., Canzian, F.: (2013) Genetic susceptibility to pancreatic cancer and its functional characterisation: The PANcreatic Disease ReseArch (PANDoRA) consortium. Dig. Liver Dis. 45(2): 95–99.
IF 3.162
Campa, D., Rizzato, C., Bauer, A. S., Werner, J., Capurso, G., Costello, E., Talar-Wojnarowska, R., Jamroziak, K., Pezzilli,
R., Gazouli, M., Khaw, K. T., Key, T. J., Bambi, F., Mohelníková-Duchoňová, B., Heller, A., Landi, S., Vodičková, L.,
Theodoropoulos, G., Bugert, P., Vodička, P., Hoheisel, J., Delle Fave, G., Neoptolemos, J., Souček, P., Buchler, M. W.,
Giese, N. A., Canzian, F.: (2013) Lack of replication of seven pancreatic cancer susceptibility lociidentified in two
Asian populations. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 22(2): 320–323.
IF 4.559
Lu, S., Bevier, M., Huhn, S., Sainz, J., Lascorz, J., Pardini, B., Naccarati, A., Vodičková, L., Novotný, J., Hemminki, K.,
Vodička, P., Försti, A.: (2013) Genetic variants in C-type lectin genes are associated with colorectal cancer susceptibility and clinical outcome. Int. J. Cancer 133(10): 2325–2333.
IF 6.198
Makovický, P., Rimárová, K., Boor, A., Makovický, P., Vodička, P., Samasca, G., Kruzliak, P.: (2013) Correlation between
antibodies and histology in celiac disease: Incidence of celiac disease is higher than expected in the pediatric
population. Mol. Med. Rep. 8(4): 1079–1083.
IF 1.170
Mušák, L., Šmerhovský, Z., Halásová, E., Osina, O., Letková, L., Vodičková, L., Poláková, V., Buchancová, J.,
Hemminki, K., Vodička, P.: (2013) Chromosomal damage among medical staff occupationally exposed to volatile
anesthetics, antineoplastic drugs, and formaldehyde. Scand. J. Work Environ. Health 39(6): 618–630.
IF 3.775
Pardini, B., Rosa, F., Barone, E., Di Gaetano, C., Slyšková, J., Novotný, J., Levý, M., Garritano, S., Vodičková, L., Buchler, T.,
Gemignani, F., Landi, S., Vodička, P., Naccarati, A.: (2013) Variation within 3’ UTRs of base excision repair genes and response
to therapy in colorectal cancer patients: a potential modulation of microRNAs binding. Clin. Cancer Res. 19(21): 6044–6056.
IF 7.837
74
Picelli, S., Bermejo, J. L., Change-Claude, J., Hoffmeister, M., Fernández-Rozadilla, C., Carracedo, A., Castells, A.,
Castellví-Bel, S., The EPICOLON Consortium, Naccarati, A., Pardini, B., Vodičková, L., Müller, H., Talseth-Palmer,
B. A., Stibbard, G., Peterlongo, P., Nici, C., Veneroni, S., Li, L., Casey, G., Tenesa, A., Farrington, S. M., Tomlinson, I.,
Moreno, V., van Wezel, T., Wijnen, J., Dunlop, M., Radice, P., Scott, R. J., Vodička, P., Ruiz-Ponte, C., Brenner, H., Buch,
S., Völzke, H., Hampe, J., Schafmayer, C., Lindblom, A.: Meta-Analysis of Mismatch Repair Polymorphisms within the
Cogent Consortium for Colorectal Cancer Susceptibility. PLoS One 8(9): e72091.
IF 3.730
Procházka, P., Hraběta, J., Vícha, A., Cipro, S., Stejskalová, E., Musil, Z., Vodička, P., Eckschlager, T.: (2013) Changes
in MYCN expression in human neuroblastoma cell lines following cisplatin treatment may not be related to MYCN
copy numbers. Oncol. Rep. 29(6): 2415–2421.
IF 2.297
Rizzato, C., Campa, D., Pezzilli, R., Souček, P., Greenhalf, W., Capurso, G., Talar-Wojnarowska, R., Heller, A., Jamroziak, K.,
Khaw, K. T., Key, T. J., Bambi, F., Landi, S., Mohelníková-Duchoňová, B., Vodičková, L., Büchler, M. W., Bugert. P., Vodička, P.,
Neoptolemos, J. P., Werner, J., Hoheisel, J. D., Bauer, A. S., Giese, N., Canzian, F.: (2013) ABO blood groups and pancreatic cancer risk and survival: Results from the PANcreatic Disease ReseArch (PANDoRA) consortium. Oncol. Rep. 29(4): 1637–1644.
IF 2.297
Vymetálková-Poláková, V., Vannucci, L., Korenková, V., Procházka, P., Slyšková, J., Vodičková, L., Rusňáková, V.,
Bielik, L., Burocziová, M., Rossmann., P., Vodička, P.: (2013) Evaluation of tumor suppressor gene expressions and
aberrant methylation in the colon of cancer-induced rats: a pilot study. Mol. Biol. Rep. 40(10): 5921–5929.
IF 2.506
ODDĚLENÍ MIKROSKOPIE
Malínský, J., Opekarová, M., Grossmann, G., Tanner, W.: (2013) Membrane microdomains, rafts, and detergent-resistant membranes in plants and fungi. Annu. Rev. Plant Biol. 64: 501–529.
IF 23.654
Rinnerthaler, M., Lejsková-Slabá, R., Groušl, T., Strádalová, V., Heeren, G., Richter, K., Breitenbach-Koller, H.,
Malínský, J., Hašek, J., Breitenbach, M.: (2013) Mmi1, the Yeast Homologue of Mammalian TCTP, Associates with
Stress Granules in Heat-Shocked Cells and Modulates Proteasome Activity. PLoS One 8(10): e77791.
IF 3.730
ODDĚLENÍ TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE
Čejková, J., Trošan, P., Čejka, Č., Lencová, A., Zajícová, A., Javorková, E., Kubinová, Š., Syková, E., Holáň, V.:
(2013) Suppression of alkali-induced oxidative injury in the cornea by mesenchymal stem cells growing on nanofiber scaffolds and transferred onto the damaged corneal surface. Exp. Eye Res. 116: 312–323.
IF 3.026
Holáň, V., Javorková, E.: (2013) Mesenchymal Stem Cells, Nanofiber Scaffolds and Ocular Surface Reconstruction.
Stem Cell Rev. Rep. 9(5): 609–619.
IF 4.523
Kubera, M., Curzytek, K., Duda, W., Leskiewicz, M., Basta-Kaim, A., Budziszewska, B., Roman, A., Zajícová, A., Holáň,
V., Szczesny, E., Lason, W., Maes, M.: (2013) A new animal model of (chronic) depression induced by repeated and
intermittent lipopolysaccharide administration for 4months. Brain Behav. Immun. 31: 96–104.
IF 5.612
ODDĚLENÍ TKÁŇOVÉHO INŽENÝRSTVÍ
Amler, E., Míčková, A., Buzgo, M.: (2013) Electrospun core/shell nanofibers: a promising system for cartilage and
tissue engineering? Nanomedicine-UK 8(4): 509–512.
IF 5.260
Buzgo, M., Jakubová, R., Míčková, A., Rampichová, M., Prosecká, E., Kochová, P., Lukas, D., Amler, E.: (2013)
Time-regulated drug delivery system based on coaxially incorporated platelet alpha granules for biomedical use.
Nanomedicine-UK 8(7): 1137–1154.
IF 5.260
Filová, E., Rampichová M., Litvinec, A., Držík, M., Míčková, A., Buzgo, M., Košťáková, E., Martinová, L., Usvald, D.,
Prosecká, E., Uhlík, J., Motlík, J., Vajner, L., Amler, E.: (2013) A cell-free nanofiber composite scaffold regenerated
osteochondral defects in miniature pigs. Int. J. Pharm. 447(1–2): 139–149.
IF 3.458
75
Rampichová, M., Chvojka, J., Buzgo, M., Prosecká, E., Mikeš, P., Vysloužilová, L., Tvrdik, D., Kochová, P., Gregor, T.,
Lukáš, D., Amler, E.: (2013) Elastic three-dimensional poly (ε-caprolactone) nanofibre scaffold enhanced migration, proliferation, and osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells. Cell Prolif. 46(1): 23–37.
IF 2.265
KAPITOLA V MONOGRAFII
Holáň V., Javorková, E., Trošan P.: The growth and delivery of mesenchymal and limbal stem cells using copolymer polyamide 6/12 nanofiber scaffolds. Corneal Regenerative Medicine. New York: Humana Press, 2013, (Wright, B.
- Connon, Ch. J.), s. 187–199, ISBN 978-1-62703-431-9. (Methods and Protocols. Part IV).
Syková, E.: Control of the extracellular ionic environment and volume. Neuroglia. New York: Oxford University
Press, 2013, (Kettenmann, H. - Ransom, B. R.), s. 430–442, ISBN 978-0-19-979459-1.
ČLÁNEK V ODBORNÉM PERIODIKU
Dostál, M., Pastorková, A., Švecová, V., Šrám, R.: (2013) Studie zdravotního stavu dětí v Ostravě 2001–2009.
Alergie. 15(1): 16–28.
Holáň, V., Krulová, M.: (2013) Common and small molecules as the ultimate regulatory and effector mediators
of antigen-specific transplantation reactions. World J. Transplant. 3(4): 54–61.
Chvátal, A.: (2013) Jiří Procházka (1749–1820) I.: Významný český anatom a fyziolog 18. století. Československá
fyziologie. (62): 2: 54–61.
Chvátal, A.: (2013) Jiří Procházka (1749–1820) II.: Struktura nervové tkáně. Československá fyziologie. 62(2): 62–76.
Li, S., Zhang, D., Yang, L., Li, Y., Zhu, X., Kmoníčková, E., Zídek, Z.: (2013) HPLC Quantitative Analysis of Main
Stilbenes and Flavones in Different Parts of Matteuccia struthiopteris. J. Chem. ID452610.
Machová –Urdzíková, L., Lesný, P., Syková, E., Jendelová, P.: (2013) Mesenchymal stem cells for the treatment
of tendon disorders. JBiSE 6: 14–23.
Syková, E., Forostyak S.: (2013) Stem Cells in Regenerative Medicine. Laser Therapy 22(2): 87–92.
Verkhratsky, A., Rodríguez, J. J., Parpura, V.: (2013) Astroglia in neurological diseases. Future Neurol. 8(2):
149–158.
OBHÁJENÉ DIZERTAČNÍ PRÁCE
Hánová, Monika
Vztah mezi genetickými polymorfizmy DNA reparačních genů a jejich expresí u zdravé populace (s výhledem
na stanovení u onkologických pacientů).
Ústav expexperimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Školitel: MUDr. P. Vodička, CSc.
Obhájeno: Přírodovědecká fakulta UK. 05.09.2013.
Rampichová, Michala
Detekce a vizualizace nativních chrupavčitých tkání biofyzikálními technikami.
Ústav expexperimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Školitel: doc. RNDr. E. Amler, CSc.
Obhájeno: Ústav biofyziky 1. LF UK. 26.02.2013.
Vaněček, Václav
Nanotechnologie a biomateriály pro využití v buněčné terapii míšního poranění.
Ústav expexperimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Školitel: prof. MUDr. E. Syková, DrSc.
Obhájeno: Neurologická klinika 1. LF UK. 17.06.2013.
76
Publikační činnost v impaktovaných časopisech v roce 2013
Název časopisu
četnost
IF (2011)
Acta Neurobiologiae Experimentalis
1
1,977
American Journal of Medical Genetics
1
4,440
Annual Review of Plant Biology
1
23,654
Antioxidants & Redox Signaling
1
7,189
Archives of Oral Biology
1
1,549
ASN Neuro
1
3,638
Biochemical and Biophysical Research Communications
1
2,406
Biochimie
1
3,142
Biomedical Papers
1
0,990
BMC BIOLOGY
1
6,531
Brain Behavior and Immunity
1
5,612
Brain Research
1
2,879
British Journal of Pharmacology
1
5,067
British Poultry Science
1
1,147
Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention
1
4,559
Cancer Research
1
8,650
Cell Proliferation
1
2,265
Clinical Cancer Research
1
7,837
Current Neuropharmacology
1
2,031
Czech Journal of Animal Science
1
0,922
Diabetes Metabolism Research and Reviews
1
2,968
Digestive and Liver Disease
1
3,162
Dna Repair
1
4,274
Environmental and Molecular Mutagenesis
1
3,708
Environmental Health: A Global Access Science Source.
1
2,714
Epidemiology
1
5,738
European Archives of Oto-Rhino-Laryngology
1
1,458
European Spine Journal
1
2,133
Experimental Eye Research
1
3,026
Experimental Gerontology
1
3,911
Experimental Neurology
1
4,645
Fitoterapia
1
2,231
General Physiology and Biophysics
1
0,852
Hearing Research
1
2,537
Hepato-Gastroenterology
1
0,774
77
Název časopisu
četnost
IF (2011)
Chinese Journal of Integrated Medicine
1
1,059
International Archives of Allergy and Immunology
1
2,248
International Journal of Cancer
1
6,198
International Journal of Hygiene and Environmental Health
2
3,045
International Journal of Pharmaceutics
1
3,458
Journal of Asian Natural Products Research
1
0,948
Journal of Dental Research
1
3,826
Journal of Experimental Zoology Part B
2
2,123
Journal of Exposure Science and Environmental Epidemiology
1
3,187
Journal of Neurophysiology
1
3,301
Journal of Physiology
1
4,380
Methods
1
3,641
Molecular Biology Reports
1
2,506
Molecular Medicine Reports
1
1,170
Mutagenesis
2
3,500
Mutation Research – Fundamental and Mol. Mech. of Mutagenesis
2
3,902
Mutation Research – Genet.Toxicol. and Environ. Mutagenesis
1
2,220
Nanomedicine
2
5,260
Neoplasma
1
1,574
Neuroscience
1
3,122
Neuroscience Letters
1
2,026
Nitric Oxide-Biology and Chemistry
1
3,265
Oncology Reports
2
2,297
Paediatric and Perinatal Epidemiology
1
2,157
Pharmacological Reports
1
1,965
Photochemistry and Photobiology
1
2,287
Physica Status Solidi B-Basic Solid State Physics
1
1,489
Physiological Research
1
1,531
PLoS ONE
7
3,730
Scandinavian Journal of Work Environment & Health
1
3,775
Stem Cell Research & Therapy
2
3,652
Stem Cell Reviews and Reports
1
4,523
Stem Cells and Development
2
4,670
Toxicology
1
4,017
78
Věda pro praxi a život
Výsledky řešení projektů s podnikatelskou
sférou získané řešením projektů
Výsledek č.1.
CZNanoprogres II.
Výsledek: Realizace klastru Nanoprogres II
Uplatnění: Akcelerace transferu výsledků základního výzkumu do aplikace
Poskytovatel: MPO ČR
Partnerská organizace: Klastr 17 podniků
Výsledek č.2.
Centrum vývoje originálních léčiv
Výsledek: Mezinárodní přihláška patentu
Uplatnění: Vývoj nových léčiv
Poskytovatel: TA ČR
Partnerská organizace: ÚOCHB AV ČR Praha, Univ. Palackého v Olomouci, VŠCHT Praha, FgÚ Praha, MediTox s.r.o.,
APIGENEX s.r.o., QUINTA-ANALYTICA s.r.o., IOCB TTO s.r.o.
Výsledek č.3.
Rozvoj podnikatelského prostředí v oboru klinických hodnocení přípravků moderní terapie
Výsledek:: Vzdělávací program zaměřený na metody moderní terapie a jejich klinické hodnocení
Uplatnění: Klinická hodnocení přípravků moderní terapie
Poskytovatel: Magistrát hlavního města Prahy, Operační program Praha Adaptabilita
Partnerská organizace: EastHorn Clinical Services in CEE, s.r.o.
Výsledky spolupráce s podnikatelskou sférou
získané na základě hospodářských smluv
Zadavatel
Anotace
Uplatnění
1. firma Autifony, Verona, Itálie
Testování preparátu pro zlepšení sluchové funkce v souvislosti se stárnutím.
Příprava léčiva
Název
Zadavatel
Výsledek
1. Oponentské posudky návrhů
grantů
GA ČR, IGA MZ, Human Frontier IGA
MZ, FP7-NMP-2011-SMALL-5 GA ČR,
WHO/NIEHS Grant Scientific Advisory
Committee, VEGA, GAUK, APVV
Písemné vyjádření – posudek
2. Recenze odborných publikací
Redakční rady domácích a zahraničních časopisů
Písemné vyjádření – posudek
3. Hodnocení biokompatibility, adheze a růstu buněk na nanovlákenných strukturách
CellMaGel, s.r.o.
Byla hodnocena biokompatibilita a růst buněk na nanovlákenných nosičích na bázi
PLA a HEMA.
4. Oponentské posudky disertačních
a doktorských prací
Příslušné oborové komise
Písemné vyjádření – posudek
Odborné expertizy
79
Dvoustranné dohody
Spolupracující instituce
Země
Téma spolupráce
1. Department of Physiology, Medical
College, National Cheng Kung
University, Tainan
Taiwan
Bilaterální grant GA ČR: Plastické změny neuronových sítí po ohlušení v raném období vývoje.
2. Ústav fyziologie I. P. Pavlova, RAV,
Sankt Peterburg
Rusko
Neurofyziologické mechanismy detekce a rozlišování zvukových signálů u člověka a živočichů.
3. US Environmental Protection
Agency, NC
USA
Analysis of gene-environment interactions and
development of applications for risk assessment.
Udělené, podané patenty
a užitné vzory v roce 2013
ROK 2013
počet
dělené
pracoviště
Přihlášky vynálezů podané v ČR
Užitné vzory podané v ČR
1
1-FZÚ
Užitné vzory zapsané v ČR
1
1-FZÚ
Patenty podané v zahraničí
2
Národní patent udělený
1
1-ÚMCH
Národní patent podaný
1
1-ÚMCH
Mezinárodní přihláška patentu – udělená
CA 2642779
Horák, D., Syková, E., Babič, M., Jendelová, P., Hájek, M.: Superparamagnetic nanoparticles based on iron oxides
with modified surface, method of their preparation and application.
2013. Vlastník: Ústav makromolekulární chemie AV ČR, v.v.i., Praha 6, Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.,
Praha 4. Uděleno: 14.05.2013.
Anotace: Vynález se týká superparamagnetických nanočástic sondy na bázi oxidů železa s modifikovaným povrchem, způsobu jejich přípravy a použití. Sonda je upravena na povrchu modifikátoru vybraného ze skupiny, kterou tvoří mono-, di-a polysacharidy, poly (amino kyselina) s a polymery (meth) deriváty kyseliny akrylové, a tvoří
koloid skládající se z částic s úzkým indexem polydisperzity nižší než 1,3, průměrná velikost, která se pohybuje
v rozmezí od 10 do 30 nm, obsah oxidu železa, činí 70 až 99,9% hmotn., obsah modifikace činidla je 0,1 až 30
hmotn.%. Sondy mohou být použity k označování buněk použitých při zobrazování magnetickou rezonancí pro
sledování jejich pohybu, lokalizaci, přežití a diferenciaci zejména rozpoznání patologických změn u buněk dysfunkce a regenerace tkání, a také pro označování a sledování buňky podávané pro účely buněčné terapie u příjemce organizmu s magnetickou rezonancí.
http://brevets-patents.ic.gc.ca/opic-cipo/cpd/eng/patent/2642779/summary.html?type=number_search
80
Užitný vzor – zapsaný
25959
Churpita, O., Dejneka, A., Zablotskyy, V., Kubinová, Š., Syková, E.: Atmosférický zdroj plazmatu, zejména pro využití v medicínských bioaplikacích. 2013. Vlastník: Fyzikální ústav AV ČR, v.v.i., Praha 8, Ústav experimentální medicíny
AV ČR, v.v.i., Praha 4.
Uděleno 14.10.2013.
Anotace: Technické řešení spadá do oblasti využití nízkoteplotního atmosférického zdroje plazmatu s laditelnou
koncentrací ionizovaných částic pro řadu procedur ve zdravotnictví, kdy je aplikací nízkoteplotního atmosférického
plazmatu dosaženo efektu hojení. Atmosférický plazmový systém vytvářející spolehlivý atmosférický zdroj plazmatu
s možnosti nastavení přesných parametrů plazmatu, je vhodný především k úpravě povrchů živé tkáně pro různé
medicínské aplikace jako je desinfekce, hojení ran, úprava rakovinných buněk, dermatologie a stomatologie, přičemž
nehrozí nebezpečí poškození tkáně z důvodu možné interakce vysokého elektrického střídavého napětí.
http://spisy.upv.cz/UtilityModels/FullDocuments/FDUM0025/uv025959.pdf
Přihláška patentu – podaná
PV 2009-190
Čejková, J., Čejka, Č., Michálek, J., Širc, J.: Způsob měření lokální toxicity látek a zařízení k jeho provádění. Ústav
experimentální medicíny AV ČR, v.v.i, Praha 4, Ústav makromolekulární chemie, AV ČR, v.v.i., Praha 6.
Anotace: Při způsobu měření lokální toxicity látek se látce vystaví rohovka oka zvířete a změří se změna tloušťky
rohovky a popřípadě také absorpčních vlastností rohovky. Změna tloušťky rohovky se měří pachymetrem, změna
absorpčních vlastností rohovky spektrofotometricky. Vložka do kyvety pro spektrofotometrické měření sestává ze
dvou plexisklových krycích destiček (1, 5) s otvorem velikostí odpovídajícím vykrojenému středu měřené rohovky,
mezi kterými je umístěna destička (3) z nerezu s kruhovým výkrojem o témže průměru, přičemž po obou stranách
destičky z nerezu, mezi destičkou z nerezu a plexisklovými krycími destičkami, jsou uspořádána křemenná krycí
sklíčka (2, 4).
PV 2011-103-podaná
Jansa, P., Holý, A., Zídek, Z., Kmoníčková, E., Janeba, Z.: Pyrimiddinové sloučeniny inhibující tvorbu oxidu dusnatého a prostaglandinu E2, způsob výroby a použití.
Ústav organické chemie a biochemie, AV ČR v.v.i., Praha 6, Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i., Praha 4.
Anotace: Předmětem vynálezu jsou pyrimidinové sloučeniny obecného vzorce I, snižující produkci oxidu dusnatého (NO) a zároveň prostaglandinu PGE2, které v koncentracích, které snižují produkci těchto faktorů o 50 %,
nemají negativní vliv na životnost buněk, způsob přípravy těchto sloučenin, farmaceutický prostředek s jejich
obsahem a jejich použití pro léčbu zánětlivých a nádorových onemocnění.
Mezinárodní přihláška patentu – podaná
PCT/CZ2012/000020
Jansa, P., Holý, A., Zídek, Z., Kmoníčková, E., Janeba, Z.: Pyrimidine compounds inhibiting the formation of nitric
oxide and prostaglandin E2, method of production thereof and use thereof. (Pyrimiddinové sloučeniny inhibující
tvorbu oxidu dusnatého a prostaglandinu E2, způsob výroby a použití).
Anotace: Pyrimidinové sloučeniny inhibující tvorbu oxidu dusnatého a prostaglandinu E2, způsob výroby a použití. Vynález se týká polysubstituovaných pyrimidinových derivátů vykazujících duální snížení produkce oxidu
dusnatého (NO) a prostaglandinu E2 (PGE2) a jejich použití jako léčiva.
81
Pedagogická činnost pracovníků ústavu
Letní semestr
2012/2013
Zimní semestr
2013/2014
Celkový počet odpřednášených hodin na VŠ v programech
bakalářských/magisterských/doktorských
52
170
18
78
254
22
Počet semestrálních cyklů přednášek/seminářů/cvičení
v bakalářských programech
6
5
1
5
0
1
Počet semestrálních cyklů přednášek/seminářů/cvičení
v magisterských programech
3
4
1
9
3
3
Počet pracovníků ústavu působících na VŠ v programech
bakalářských/magisterských/doktorských
12
20
8
17
17
7
Řada výzkumných pracovníků ÚEM AV ČR se podílí na na terciálním
vzdělávání ve formě výuky studentů bakalářského, magisterského
a doktorského studia na těchto vysokých školách:
Univerzita Karlova v Praze
Masarykova univerzita v Brně
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Palackého v Olomouci
Technická univerzita v Liberci
Veterinární a farmaceutická univerzita v Brně
České vysoké učení technické v Praze
Terciální vzdělávání
Studijní
program
Název VŠ
Předmět
1. Bakalářský
UK 2.LF
Neurovědy (Dr. Jendelová, Ing. Anděrová)
2. Bakalářský
PřF UK
Neurovědy (Dr. Romanyuk)
3. Bakalářský
UK 2.LF
Fyziologie (doc. Vargová, doc. Chvátal)
4. Bakalářský
PřF UK
Neurovědy (Ing. Anděrová)
5. Bakalářský
PřF UK
Antropologie (doc. Peterka)
6. Bakalářský
PřF UK
Ekologie, teratologie (doc. Peterka)
7. Bakalářský
PřF UK
Antropologie a genetika člověka
(Mgr. Hovořáková, Ph.D.)
8. Bakalářský
UK 2.LF
Fyzioterapie (prof. Amler)
ano
9. Magisterský
UK 2.LF
Pokroky v neurovědách (Dr. Jendelová,
Ing. Anděrová, doc. Chvátal, prof. Syková)
ano
ano
ano
10. Magisterský
UK 2.LF
Kmenové buňky a regenerativní medicína
(prof. Syková, Dr. Jendelová, Dr. Vaněček,
Dr. Růžička, Dr. Romanyuk)
ano
ano
ano
11. Magisterský
PřF UK
Neurovědy (Ing. Anděrová)
12. Magisterský
PřF UK
Histologie (Dr. Peterková)
82
Přednášky
Cvičení Vedení Učební Jiné
prací
texty
ano
ano
školitel
ano
školitel
ano
ano
školitel
ano
ano
ano
ano
ano
ano
školitel
školitel
ano
ano
ano
školitel
školitel
Studijní
program
Název VŠ
Předmět
Přednášky
Cvičení Vedení Učební Jiné
prací
texty
13. Magisterský
PřF UK
Vývojová biologie (Dr. Peterková)
14. Magisterský
PřF UK
Embryologie a teratologie (doc. Peterka)
15. Magisterský
PřF UK
Vedení diplomanta (Dr. Rössner Jr.)
ano
16. Magisterský
PřF UK
Molekulární a buněčná biologie, genetika
a virologie (Dr. Šrám, Dr. Vodička)
ano
17. Magisterský
PřF UK
Antropologie a genetika člověka
(Dr. Vodička, doc. Peterka)
ano
ano
18. Magisterský
LF UK v Plzni Farmakologie (doc. Kmoníčková)
ano
ano
19. Magisterský
LF UK v Plzni Molekulární onkologie (doc. Kmoníčková)
20. Magisterský
UK 2.LF
Všeobecná medicína (prof. Amler)
ano
ano
ano
21. Magisterský
UK 2.LF
Fyzioterapie (prof. Amler)
ano
ano
ano
22. Doktorský
Neurovědy (prof. Syková)
UK 2.LF,
Kurz Pokroky
v neurovědách
ano
23. Doktorský
Neurovědy (prof. Syka)
Univerzita
Karlova,
Kurz Pokroky
v neurovědách
ano
24. Doktorský
UK 2.LF
Neurovědy (Dr. Jendelová)
ano
ano
školitel
25. Doktorský
UK 2.LF
Neurovědy (doc. Vargová)
ano
ano
školitel
26. Doktorský
Neurovědy (Ing. Anděrová)
UK 2.LF,
Kurz Pokroky
v neurovědách
ano
ano
školitel
27. Doktorský
1. a 2. LF UK
Praha
Doktorský studijní program Neurovědy
(prof. Syka)
ano
ano
školitel,
člen OR
28. Doktorský
1. a 2. LF UK
Praha
Doktorský studijní program Neurovědy
(Dr. Tureček)
ano
ano
školitel
29. Doktorský
PřF UK
Antropologie a genetika člověka
(doc. Peterka)
ano
školitel,
člen OR
30. Doktorský
PřF UK
Vývojová biologie (Dr. Peterková)
ano
školitel
31. Doktorský
PřF UK
Antropologie a genetika člověka
(Dr. Peterková)
ano
školitel
32. Doktorský
PřF UK
Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie (Dr. Šrám, Dr. Novotná,
Dr. Rössner Jr., Dr. Vodička)
ano
školitel
33. Doktorský
PřF UK
Biochemie (Ing. Topinka)
ano
školitel,
člen OK
34. Doktorský
PřF UK
Environmentální vědy (Dr. Šrám)
ano
35. Doktorský
PřF UK
Molekulární a buněčná biologie, genetika
a virologie (Dr. Šrám, Dr. Vodička)
člen OK
36. Doktorský
UK 3.LF
Molekulární a buněčná biologie, genetika
a virologie (Dr. Vodička)
člen OK
ano
ano
ano
ano
školitel
ano
školitel
školitel
ano
ano
ano
školitel,
člen OK
koordinátor
ano
83
Studijní
program
Název VŠ
Předmět
37. Doktorský
PřF UK
Molekulární a buněčná biologie, genetika
a virologie (Dr. Malinský)
ano
38. Doktorský
MFF UK
Biofyzika, chemická a makromolekulární
fyzika (Dr. Malínský)
ano
39. Doktorský
LF UK v Plzni Farmakologie (doc. Kmoníčková)
ano
40. Doktorský
UK 1.LF
Farmakologie a toxikologie
(doc. Kmoníčková, Dr. Zídek)
ano
41. Doktorský
UK 2.LF
Lékařská biofyzika (prof. Amler)
42. Doktorský
UK 2.LF
Lékařská biofyzika (prof. Amler, Dr. Koláčná)
43. Doktorský
Neurovědy (doc. Chvátal)
UK 2.LF,
Kurz Pokroky
v neurovědách
ano
44. Doktorský
Neurovědy (Dr. Popelář)
UK 2.LF,
Kurz Pokroky
v neurovědách
ano
45. Bakalářský
UK 2.LF
Zdravotní sestra (prof. Amler)
ano
ano
46. Bakalářský
UK 2.LF
Zdravotní laborant (prof. Amler)
ano
ano
47. Doktorský
UK 2.LF
Biomechanika (prof. Amler)
ano
48. Bakalářský
PřF UK
Fyziologie živočichů (Ing. Anděrová)
ano
49. Magisterský
PřF UK
Fyziologie živočichů (Ing. Anděrová)
ano
50. Bakalářský
PřF UK
Imunologie (prof. Holáň)
51. Magisterský
PřF UK
Imunologie (prof. Holáň)
ano
ano
52. Doktorský
PřF UK
Imunologie (prof. Holáň)
ano
ano
53. Bakalářský
PřF UK
Biologie (Dr. Jendelová, Dr. Kubinová,
Dr. Malinský)
ano
ano
54. Magisterský
UK 2.LF
Fyziologie člověka (Dr. Jendelová)
55. Doktorský
PřF UK
In vivo molekulární a buněčné zobrazování
(Dr. Jendelová)
ano
56. Magisterský
PřF UK
Biologie (Dr. Malinský)
ano
57. Magisterský
VŠCHT
Biochemie a biotechnologie (Dr. Malinský)
ano
58. Doktorský
PřF UK
Vývojová a buněčná biologie (Dr. Malinský, ano
doc. Peterka)
ano
59. Magisterský
FBMI ČVUT,
Kladno
Biomedicínské inženýrství (prof. Syka,
Ing. Čejka)
84
Přednášky
ano
Cvičení Vedení Učební Jiné
prací
texty
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
školitel,
člen OR
ano
školitel
ano
ano
ano
ano
ano
ano
Mezinárodní spolupráce
1
Počet konferencí s účastí zahraničních vědců (pracoviště jako pořadatel nebo
spolupořadatel)
6
2.
Počet zahraničních cest vědeckých pracovníků ústavu
131
2.a
– z toho mimo rámec dvoustranných dohod AV ČR
131
3.
Počet aktivních účastí pracovníků ústavu na mezinárodních konferencích
133
3.a
Počet přednášek přednesených na těchto konferencích
46
3.b
– z toho zvané přednášky
23
3.c
Počet posterů
85
4.
Počet přednášejících na zahraničních univerzitách
3
5.
Počet členství v redakčních radách mezinárodních časopisů
30
6.
Počet členství v orgánech mezinárodních vědeckých vládních a nevládních organizací
(společnosti, komitéty)
28
7.
Počet přednášek zahraničních hostů v ústavu
9
8.
Počet grantů a projektů financovaných ze zahraničí
8
8.a
– z toho z programů EU
6
Kongresy v roce 2013
Výzkum lidského mozku – velké téma pro 21. století
Praha, 18. června 2013
Výzkum lidského mozku je největším vědeckým úkolem současnosti, a proto senátorka Eva Syková uspořádala v Senátu
pod záštitou předsedy Senátu, Milana Štěcha, konferenci
na téma výzkumu mozku.
Cílem konference navazující na Evropský měsíc mozku
bylo upozornit české politiky i širší veřejnost na význam
výzkumu mozku jako na prioritu tohoto století a na nutnost do této oblasti investovat více finančních prostředků z veřejných zdrojů. Této oblasti vědy se již dostalo
zvýšené pozornosti v USA v souvislosti s oznámením
americké „BRAIN Initiative“ a v EU výběrem „Human Brain
Project“ jako jednoho ze dvou celoevropských vlajkových
projektů.
ÚEM AV ČR: prof. MUDr. Eva Syková, prof. MUDr. Josef Syka, DrSc.
85
The FENS Featured Regional Meeting 2013
Praha, 11.–14. září 2013
Celkem 626 účastníků, z toho 536 zahraničních
Konference se konala v Kongresovém centru Praha pod
Konference se konala v Kongresovém centru Praha pod záštitou Federace evropských neurovědních společností
(FENS) a zorganizoval ji Ústav experimentální medicíny AV ČR, Česká společnost pro neurovědy, Slovenská společnost pro neurovědy a Rakouská Alzheimerovská společnost. Konferenci rovněž podpořila Mezinárodní organizace
pro výzkum mozku (IBRO), Evropská aliance mozku Dana (EDAB) a Evropská společnost mozku a chování (EBBS).
Prezidentka konference: prof. MUDr. Eva Syková, DrSc.
Vědecký výbor: prof. Josef Syka, doc. Alexandr Chvátal, Ing. Miroslava Anděrová, RNDr. Jiří Popelář
Problematika léčby pacientů, například po mrtvici, s poraněním mozku a míchy, s poškozením sluchu a zraku,
s Alzheimerovou a Parkinsonovou chorobou a nákladů s tím spojených u stále se zvyšujícího počtu nemocných, je závažným celospolečenských problémem nejen u nás, ale rovněž v celé Evropě a USA.
Vědecký program konference zahrnul celkem čtyři plenární přednášky. Jako první promluvil prof. Helmut
Kettenmann z Max Delbrück Center for Molecular Medicine z Berlína (Německo) o nejnovějších nálezech týkajících se úlohy gliových buněk. Prof. James W. Fawcett z Cambridge University Centre for Brain Repair z Londýna
(Velká Británie) se zabýval regenerativními procesy v nervovém systému. Dr. Irina Alafuzoff z Uppsala University,
Department of Immunology, Genetics and Pathology (Švédsko) hovořila o nových poznatcích v léčbě neurodegenerativnich chorob. Zajímavou přednášku přednesl také jeden z předních amerických vědců českého původu,
prof. Karel Svoboda z Janelia Farm Research Campus, Howard Hughes Medical Institute (USA), který referoval o výsledcích svého výzkumu prováděného pomocí moderních optogenetických metod.
Součástí programu bylo 18 sympozií zabývajících se otázkou moderní léčby Alzheimerovy a Parkinsonovy
choroby, terapií nervového systému pomocí kmenových buněk, regenerací tkáně v případě mozkové mrtvice,
problematikou zánětlivých procesů mozku, přenosů bolesti, náhradou ztráty sluchu a zraku, plasticitou mozku
během jeho vývoje, pamětí, funkcí receptorů a synapsí a genetickými aspekty neuroendokrinních funkcí. Bylo
připraveno 30 přednášek, 350 posterových sdělení a šest speciálních sekcí věnovaných např. práci s experimentálními zvířaty v neurovědním výzkumu, výchově v neurovědách v Evropě či etické problematice v neurovědách. Jedna ze speciálních sekcí byla věnována památce předního českého neurovědce Jana Bureše,
kterou uvedl prof. Josef Syka, jenž pohovořil rovněž o jednom z duchovních otců disciplíny neurověd – Janu
Evangelistu Purkyněm na závěrečném večeru věnovaném historii neurověd v Českém muzeu hudby.
Na konferenci se zaregistrovalo vice než 600 účastníků ze 60 zemí světa. Mimo českých účastníků přijeli
do Prahy vědci ze Slovenské republiky, Německa, Ruska, Slovenské republiky, USA, Maďarska, Japonska a Francie
a z asijských a jihoamerických zemí.
86
Osobnosti v UEM
Jméno
Pracoviště
Země
prof. Seeram Ramakrishna
University of Singapore
Singapore Světový odborník v oboru nanovláken
prof. Franco Rustichelli
University of Ancona
Itálie
Světový odborník v oboru chitosanu
Shmuel Muallem, PhD
National Institutes of
Health/ NIDCR, Bethesda
USA
Odborník v oboru molekulární fyziologie. Senior Investigator Chief, Epithelial
Signaling and Transport Section
Izumi Shibuya, PhD
Faculty of Agriculture,
Tottori University
Japonsko
Odborník v oboru neuroendokrinologie
Sivan Subburaju, PhD
Harvard Medical School,
Boston
USA
Odborník v oboru neurověd, Senior
Scientist
Dr. Meena Jhanwar-Uniyal
New York Medical College
USA
Odborník v oboru molekulární biologie,
výzkumu transkripčních faktorů a jejich
úlohy v nádorovém bujení a zánětlivých
procesech
Dr. Tamara Roitbak
University of New Mexico
USA
Odborník v oboru neurověd, neurálních
kmenových buněk a iktu
Dr. Slaven Erceg
Spanish National Research Španělsko Odborník v oboru derivace pluripotentCouncil
ních kmenových buněk
Joe Pinto, PhD
US Environmental
USA
Protection Agency,
Research Triangle Park, NC
Odborník v oboru studia interakce gen-environmentu a hodnocení rizik
Dr. Bernd Fritzsch
DEO, College of Liberal
Arts and Sciences, Iowa
City
Odborník v oboru sluchového systému
Dr. Oliver Douglas
University of Connecticut, USA
Health Center, Farmington,
CT 06030-3401
Odborník v oboru neuroanatomie
prof. David Hughes PhD
Dept. Physiol. Med.
Physics, Royal College of
Surgeons, Dublin
Odborník v oboru genetiky nádorových
onemocnění
USA
Irsko
Obor, význačnost
prof. Sergio Castellvi-Bel PhD Dept. Gastroenterology,
University of Barcelona
Španělsko Odborník v oboru molekulární
epidemiologie
prof. Dan Sliva, PhD
Cancer Res. Lab., Indiana
University Health,
Indianapolis, IN
USA
Odborník v oboru molekulární biologie
prof. Paul A.W. Edwards, PhD
Deprt. Pathol., University
of Cambridge
UK
Odborník v oboru molekulární biologie
a cytogenetiky
87
Praktické kurzy
Mezinárodní letní škola FENS: Kmenové buňky
a biomateriály v regenerativní medicíně
Místo a datum konání: Praha 9.–11. září 2013 Počet účastníků: 12, z toho zahraniční 8 Trvání kurzu: 3 dny
Počet vyučujících: 6 (vedoucí prof. Syková, Dr. Jendelová)
Přednášek se zúčastnilo 12 žáků (8 ze zahraničí). Byly představeny hlavní principy a techniky laboratorní práce
s kmenovými buňkami a biomateriály a jejich použití ve zvířecích modelech poranění CNS v regenerativní
medicíně.
Mezinárodní letní škola FENS: Sluchová neurofyziologie
Místo a datum konání: Praha, 9.–11. září 2013 Počet účastníků: 12, z toho zahraničních 10
Trvání kurzu: 3 dny
Počet vyučujících: 10 (vedoucí prof. Syka)
Přednášky a praktická cvičení v laboratořích proběhly s cílem demonstrovat metody používané při výzkumu neurofyziologie sluchu.
Neuroscience Methods
Místo a datum konání: Praha 6.–7. června 2013
Počet účastníků: 30, z toho zahraničních 30
Trvání kurzu: 2 dny
Počet vyučujících: 10 (vedoucí prof. Syka)
Přednášky a praktická cvičení v laboratořích proběhly s cílem demonstrovat metody používané při výzkumu neurovědních oborů.
Kurzu se zúčastnilo 28 studentů Lékařské fakulty univerzity v Connecticutu a studentů John Hopkins univerzity
v Baltimoru s cílem proškolit se v metodikách neurovědního výzkumu v laboratořích ÚEM AV ČR v Praze.
88
Kurz, zaměřený na metody používané ve výzkumu sluchové funkce, byl součástí měsíčního pobytu amerických
studentů na univerzitě ve španělské Salamance. Vědecká pracoviště univerzity v Salamance nemají tak komplexní
metodické vybavení jako má pražské Oddělení neurofyziologie sluchu v ÚEM AV ČR, které vede prof. MUDr. Josef
Syka, DrSc. Proto se s garantem kurzu, profesorem connecticutské univerzity Douglasem Oliverem, dohodli, že
praktickou část výuky přenechají pražskému pracovišti.
Ve dvou dnech intenzivní výuky se američtí studenti seznámili s metodikami měření akustických veličin, zvláštnostmi akustické stimulace sluchu, metodami narkózy u experimentálních zvířat a s operačními přístupy, s používanými behaviorálními, elektrofyziologickými a morfologickými metodami. Studenti sledovali záznam aktivity
jednotlivých nervových buněk mikroelektrodami a pomocí tzv. terčíkového zámku, záznam aktivity buněčných
komplexů implantovanými elektrodami a seznámili se s nejmodernější metodou záznamu činnosti neuronových
sítí pomocí dvoufotonového konfokálního mikroskopu.
Mezinárodní letní škola FENS: Elektrofyziologické a zobrazovací
metody pro zobrazování neuronů a gliových buněk
Místo a datum konání: Praha 9.–11. září 2013 Vedoucí: Ing. Anděrová, Dr. Vyklický
Trvání kurzu: 3 dny
Přednášky a praktická cvičení v laboratořích proběhly s cílem demonstrovat metody používané při neurovědním výzkumu.
Cílem workshopu bylo vyškolit zúčastněné studenty v nových metodách, které umožňují vizualizovat specifické
typy buněk v centrálním nervovém systému použitím např. fluorescenčních barviv v rámci promotoru GFAP,
CSPG4 a GLAST (typické znaky pro astrocyty a polydendrocyty), a také v metodách, které umožňují elektrofyziologickou a morfologickou charakterizaci buněk v nervové tkáni (patch clamp a 3D konfokální morfometrie) s využitím intracelulárního zobrazování vápníku a konfokální mikroskopie.
Letní škola v rámci projektu Lidské zdroje pro neurovědní
výzkum v Královéhradeckém a Ústeckém kraji
Datum a místo konání: Praha 9.–11. září 2013 Počet účastníků: 8, z toho zahraniční 4
Vedoucí: Ing. Jan Prokšík
Trvání kurzu: 3 dny
Počet vyučujících: 3
V rámci výše uvedeného projektu uspořádal ústav letní školu praktických cvičení pro studenty z Lékařské fakulty
UK v Hradci Králové. Letní škola byla zaměřena do tří tématických částí:
a) Kmenové buňky a biomateriály v regenerativní medicíně
b) Neurofyziologie sluchu
c) Elektrofyziologické a zobrazovací metody pro studium vlastností neuronů a glií
První běh Letní školy praktických dovedností v biomedicínském výzkumu se uskutečnil v termínu 9.–11. 9. 2013.
Vzdělávací akce byla určena pro studenty Lékařské fakulty v Hradci Králové se zájmem o nabízenou tématiku.
Byla rozdělena do tří samostatných tématických oblastí – Kmenové buňky a biomateriály (garant prof. Syková),
Elektrofyziologické a zobrazovací metody pro studium vlastností neuronů a glií (garant Ing. Anděrová)
a Neurofyziologie sluchu (garant prof. Syka). Na akci se odborně podíleli další vědečtí pracovníci ústavu. Letní
89
školy se zúčastnilo celkem 8 studentů z Lékařské fakulty v Hradci Králové. Studenti měli zajištěn celodenní odborný vzdělávací program v teoretické rovině i v laboratořích, obdrželi před zahájením akce výukové materiály a byli
požádáni o zpracování vlastního projektu či hodnocení akce tak, aby bylo možné pro další plánovaný běh letní
školy ještě lépe přizpůsobit jejich očekávání.
Odborná spolupráce postdoktorandů s magisterskými studenty v rámci
projektu Příprava výzkumných týmů ÚEM AV ČR pro projekt BIOCEV
Místo a datum konání: průběžně – ÚEM AV ČR, Praha 4, FBMI ČVUT Kladno, UK v Praze, Lékařská fakulta
v Hradci Králové
Trvání kurzu: 10 dnů
Počet vyučujících: 3
Počet účastníků: 12, z toho zahraniční 4 Vedoucí: Ing. Jan Prokšík
Tři postdoktorandi – vědečtí pracovníci působící v ústavu, odborně pracovali formou seminářů a konzultací se
studenty na tématech z oblasti kmenových buněk, biomateriálů, regenerativní medicíny a neurofyziologie sluchu
s cílem připravit základy nových výzkumných skupin pro BIOCEV.
15. Týden mozku
Místo a datum konání: Praha, AV ČR, 4.–8. března 2013
Počet účastníků: 1488
Počet přednášejících: 11 (prof. Syková, prof. Syka)
Promítání dokumentárních filmů: Tajný život mozku – Mozek teenagerů, Můj skvělý mozek: Náhodný genius
Cyklus přednášek pro veřejnost
Koordinace:
v Evropě European Dana Aliance for the Brain (EDAB),
v USA Dana Aliance for Brain Initiatives,
V ČR: ÚEM AV ČR, Česká společnost pro neurovědy a SSČ AV ČR.
Uskutečnil se cyklus přednášek předních českých neurovědců z oblasti výzkumu mozku, jejichž témata se týkala
nejnovějších poznatků v oblasti neurovědního výzkumu v ČR – např. o léčení nervových a duševních chorob, vnímání času, kódování informací o zvuku v mozku, léčení chorob mozku a míchy kmenovými buňkami a tkáňovými
náhradami. Návštěvníci, především z řad studentů, byli seznámeni také se spoluprací na mezinárodních projektech a připravovaných klinických aplikacích v praxi.
90
Projekty mezinárodní spolupráce
ve vědě a výzkumu
BIOactive highly porous and injectable Scaffolds controlling stem cell recruitment, proliferation
and differentiation and enabling angiogenesis for Cardiovascular ENgineered Tissues
Akronym: Bioscent. Typ: Collaborative project (CP) Large-scale integrating project
Koordinátor: Universita di Pisa, Pisa, Italy
Řešitel: Evžen Amler
Rok ukončení: 2013
Innovative methods of monitoring of diesel engine exhaust toxicity in real urban traffic.
Akronym: MEDETOX. Typ: IP
Koordinátor: ÚEM AV ČR, v.v.i.
Řešitel: Jan Topinka Rok ukončení: 2016
Ultrafine particles – an evidence based contribution to the development
of regional and European environmental and health policy.
Akronym: UFIREG. Typ: OPNS
Koordinátor: Technical University Dresden, Germany
Řešitel: Miroslav Dostál
Rok ukončení: 2014
Development of sensor-based Citizen´s Observatory
Community for improvig quality of life in cities.
Akronym: CITI-SENSE. Typ: IP
Koordinátor: NILU-Norway Institute for Air Research, Kjeller, Norway
Řešitel: Radim Šrám
Rok ukončení: 2016
ECMNET – Mozková extracellulární matrix ve zdraví a nemoci
Druh spolupráce: COST (Cooperation in Science and Technology)
Typ aktivity: Výchova mladých vědeckých odborníků v oboru neurální extracellulární matrix a rozšiřování a popularizace poznatků o extracellulární matrix v CNS na úrovni vědecké, veřejné i politické
Koordinátor: Alexandr Dityatev (Itálie), Eva Syková, Lýdia Vargová (ČR)
Účastnické státy: Itálie, ČR, Belgie, Chorvatsko, Kypr, Dánsko, Finsko, Francie, Německo, Řecko, Itálie, Nizozemí,
Polsko, Rusko, Srbsko, Španělsko, Švýcarsko, Turecko, UK
Spoluřešitelé: 49
Program Barrande – Úloha astrogliálních gap junction v neuronálním přenosu
Typ aktivity: Výměnné stáže mladých vědeckých pracovníků
Koordinátor: Nathalie Rouach za Francii, Lýdia Vargová za ČR
Účastnické státy: ČR, Francie Spoluřešitelé: 2
KONTAKT (ME) – Imunomodulační vlastnosti látek izolovaných z rostlin tradiční čínské medicíny
Typ aktivity: Základní výzkum
Koordinátor: Zdeněk Zídek
Účastnické státy: Čína Spoluřešitelé: 6
Kontakt II – Stanovení molekulárních mechanismů účastnících se poranění
míchy, regenerace, buněčné terapie a léčby protizánětlivými faktory
Typ aktivity: Bilaterální CZ–USA vědecký projekt základního výzkumu
Druh spolupráce: COST (Cooperation in Science and Technology)
Koordinátor: Pavla Jendelová
Účastnické státy: USA Spoluřešitelé: 1
LD-COST – Spolupráce při studiu zděděné vnímavosti
vůči nádorům tlustého střeva a konečníku
Typ aktivity: Vědecká spolupráce
Koordinátor: Sergi Castellví-Bel
Účastnické státy: Španělsko, Německo, UK, Švédsko, Itálie, Portugalsko, Holandsko, Rakousko, USA
Spoluřešitelé: 25
91
Projekty ze strukturálních
fondů EU v roce 2013
Příprava výzkumných týmů ÚEM AV ČR pro projekt BIOCEV
Program: OP Vzdělávání pro konkurenceschopnost (OPVK)
Rozpočet: 9,1 mil. Kč
Doba řešení: 1. 4. 2012–31. 3. 2015
Obsah a hlavní cíl: Obsahem projektu pod vedením tří postdoktorandů je odborně připravit nové výzkumné
skupiny pro projekt Biomedicínského a biotechnologického centra BIOCEV se zaměřením na kmenové buňky
v neurovědách a na výzkum sluchové funkce u transgenních myší. 18 pregraduálních mimopražských vysokoškolských studentů se zúčastnilo vzdělávacích projektů.
Lidské zdroje pro neurovědní výzkum v Královéhradeckém a Ústeckém kraji
Program: Vzdělávání pro konkurenceschopnost (OPVK)
Rozpočet: 17,8 mil. Kč
Doba řešení: 1. 11. 2012–30. 4. 2015
Partneři: Univerzita Karlova v Praze, Lékařská fakulta v Hradci Králové, Krajská zdravotní a.s. , Masarykova nemocnice v Ústí nad Labem
Obsah a hlavní cíl: Projekt je zaměřen na založení a odborný rozvoj nových výzkumných týmů nazvaných
Neuroonkologie a Neuroregenerace v partnerských organizacích. Tyto výzkumné týmy mají svého lokálního
vedoucího, který jejich činnost koordinuje společně se zahraničním vědeckým pracovníkem z ÚEM AV ČR.
Výzkumné týmy se účastní odborných seminářů na relevantní témata, které zajišťuje ústav.
Biomedicínské a biotechnologické centrum AV ČR a UK ve Vestci BIOCEV
Program: Výzkum a vývoj pro inovace (OP VaVpI)
Rozpočet: Celkové plánované výdaje na projekt BIOCEV jsou 3,1 mld. Kč (z toho dotace z EU ve výši 2,3 mld. Kč).
Doba řešení: 2008–2015
Partneři: ÚMG, MBÚ, BTÚ, ÚEM, FÚ, ÚMCH, UK
Obsah a hlavní cíl: Vybudovat centrum excelentního výzkumu jako součást Evropského výzkumného prostoru
a garantovat rozvoj moderních biotechnologií a biomedicíny ve prospěch vědeckého pokroku a společnosti.
Výzkumné centrum buněčné terapie a tkáňových náhrad
Akronym: VCBTTN
Program: OPPK
Rozpočet: 60 mi. Kč
Doba řešení: 2011–2013
Řešitel: Ing. Petr Bažant, CSc., MBA
Partneři: IKEM, ÚVN, TC AV ČR, ÚHKT
Obsah a hlavní cíl: Výstavba a technologické vybavení nového výzkumného centra základního výzkumu jako
součást ÚEM AV ČR se zaměřením na buněčnou terapii a tkáňové inženýrství, biomateriály a nanomateriály.
Rozvoj podnikatelského prostředí v oboru klinických hodnocení LPMT
Program: OP Praha Adaptabilita (OPPA)
Rozpočet: 2,79 mil. Kč
Doba řešení: 1. 3. 2012–28. 2. 2014
Partneři: ÚEM AV ČR, v.v.i.
Obsah a hlavní cíl: Vzdělávací projekt zaměřený na pro podporu rozvoje podnikatelského prostředí v Praze
v odvětví klinických studií přípravků moderní terapie. Cílovou skupinou projektu jsou zaměstnanci a spolupracující OSVČ společnosti EastHorn Clinical Services in CEE, s.r.o., zejména manažeři a monitoři klinických studií,
kteří navštěvují odborné vzdělávací akce a účastní se dalších vzdělávacích aktivit jako jsou laboratorní stáže,
zahraniční studijní cesty či zpracování samostatných případových projektů. ÚEM AV ČR je odborným partnerem
projektu bez finančního příspěvku.
92
Poznámky:
93
Tiráž
Výroční zprávu za rok 2013 vydal ÚEM AV ČR, v.v.i. v dubnu 2014
Podklady a zpracování dat:
doc. RNDr. Alexandr Chvátal, DrSc. a Mgr. Jana Voláková Křížová
Tisk, zlom a grafická úprava Abalon, s. r. o.
Fotografie použity s laskavým svolením Akademického bulletinu
a autorky Mgr. Stanislavy Kyselové a z archívu ÚEM AV ČR.
94
Download

Výroční zpráva za rok 2013 - Institute of Experimental Medicine AS